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BPpython/BioinformaticsScript

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BioinformaticsScript

包含一些生物信息学处理重复工作的脚本

学习笔记

  1. GetAxes3DExample.ipynb 是Axes3D绘图代码的例子
  2. MySQL.ipynb/是Mysql学习的笔记
  3. json_hashlib_base64.ipynb 》json文件格式和hashlib、base64学习笔记
  4. 数据清洗与机器学习综合案例.ipynb 》包含python常用的机器学习代码和一些数据基础绘图
  5. 线程与线程池.ipynb 》线程和线程池的学习笔记

科研需要

  1. ReplacementContentForImageOnlySVG_or_utf8.ipynb》批量替换的文件内容的脚本,但是只能同一种格式替换,例如UTF-8不能替换进制文件
  2. ResourceLink.txt 》包含众多百度网盘里的软件、虚拟机、教学视频等文件
  3. getMotifSeqByMemeHtml_sumMotifs.ipynb 》从meme返回的xml文件里提取出motif基序并且自动生成一个excel表格
  4. plantCARE_output_PlantCARE_promoter_sum_matrix.xlsm 》里面包含VBA程序,能够自动完成来自plantcare启动子顺式作用元件个数和类型的矩阵生成
  5. 输入基因ID返回适用于Tbtools的基因结构绘制格式_适用于大豆,拟南芥,水稻,玉米,高粱,番茄.ipynb 》利用本地基因组,根据输入的基因ID返回tbtools绘图所需要的格式

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含有一些生物信息学处理重复工作的脚本

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