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我们的论文“基于知识图谱嵌入的阿尔茨海默病药物重定位研究”的代码。

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AD-KGE

我们的论文“基于知识图谱嵌入的阿尔茨海默病药物重定位研究”的代码。

介绍

利用知识图谱嵌入模型研究阿尔茨海默病的药物重定位.

该工作已被中国药科大学学报录用, 不久将会发表.

数据

原始的 DRKG 知识图谱 ( 链接:https://pan.baidu.com/s/1KRSHPjdCXf8y-0PfIEoPcg 提取码:war6 )

配置环境

$ git clone git@github.com:LuYF-Lemon-love/AD-KGE.git
$ cd AD-KGE/
$ conda env create -f environment.yaml
$ pip install -r requirements.txt

文件

引用

如果您发现 AD-KGE 对您的研究有用,请考虑引用以下论文:

@article{ZGYD202303009,

 author = {卢艳峰 and 杨思瀚 and 莫鸿仪 and 侯凤贞},

 title = {基于知识图谱嵌入的阿尔茨海默病药物重定位研究},

 journal = {中国药科大学学报},

 volume = {54},

 number = {03},

 pages = {344-354},

 year = {2023},

 issn = {1000-5048},

 doi ={10.11665/j.issn.1000-5048.2023040305}

 }

该仓库主要由Yanfeng LuFengzhen Hou提供(按时间顺序排列)。

Reference

[1] Drug Repurposing Knowledge Graph (DRKG), link: https://github.com/gnn4dr/DRKG .

[2] OpenKE: An Open Toolkit for Knowledge Embedding, link: https://github.com/thunlp/OpenKE .

[3] DGL-KE: Training Knowledge Graph Embeddings at Scale, link: https://github.com/awslabs/dgl-ke .

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我们的论文“基于知识图谱嵌入的阿尔茨海默病药物重定位研究”的代码。

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