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Releases: KangWang42/EpiAgentKit

Release list

EpiAgentKit 1.3

EpiAgentKit 1.3 Latest
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@KangWang42 KangWang42 released this 13 Oct 09:13
v1.3
fc54e0f

主要变化

  • 新增可选的 SQLite 技能知识索引：从现有 Markdown 描述、标题和章节生成候选信息，支持按技能查询、文件头预览、哈希核对、增量更新与缓存重建。源正文仍是唯一依据，不收集会话记忆或研究数据。
  • 轻量包单独提供 tools/knowledge_index.py，解压后可直接使用；保持 22 个可分发 skills，不额外安装维护技能或第三方依赖。
  • 学术 PPT 按组会、文献分享、方法讲解、开题和答辩的目的组织内容，改进研究问题开场、页面标题、重点强调与表格选择；已有 PPTX 的局部修改继续保留原模板和约定范围。
  • 同步更新 v1.3 安装与回退说明，保留文件处理 skills、机构模板和未完成许可核查资料的分发排除规则。

使用

把本 release 页面或下载后的 ZIP 交给当前 Agent，要求按包内 README_中文.md 安装并保留现有个人配置。

在解压目录中查询技能细则：

python tools/knowledge_index.py search "缺失数据" --skill r-biostats
python tools/knowledge_index.py peek r-biostats/references/regression.md --lines 30

已知路径直接读取，简单关键词可继续用 rg。本机测量中索引命令比 rg 慢，但可限制候选数量、减少部分查询输出；不据此声称模型准确率或整个任务速度提升。

验证

  • 258 项单元测试完成：257 项通过，1 项因 Windows 符号链接创建权限不足而跳过。
  • 工作流与隔离安装审计通过；Claude Code 与 Codex 同步后 doctor 70/70。
  • ZIP 通过确定性构建测试、CRC、来源提交、版本、清单与 SHA-256 校验；解压后的 22 个 skills 通过格式校验，独立索引工具实跑通过。

来源提交：fc54e0fcd428a5662b27e578990791612a6492bf

ZIP SHA-256：c2cc172b5cb0f35acb90f6739de542a91bc68b37d2a9264c08b6494c98727c39

Assets 4
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EpiAgentKit 1.2

EpiAgentKit 1.2

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@KangWang42 KangWang42 released this 01 Oct 06:52
v1.2
46e3583

主要变化

  • 新增 4 个 skills：graduate-opening-report（研究生学位论文开题报告）、build-web-ui（网页与 Web UI）、workflow-retrospective（工作流问题复盘）和 chatgpt-web-collaboration（ChatGPT 网页协作），共 22 个。
  • 修正统计方法参考：比例风险检验不再把“不显著”解读为满足假设，中位生存时间改用 quantile()，时变系数必须写明时间函数，竞争风险按估计目标区分病因别 Cox 与 Fine-Gray；预后模型代码补上 x = TRUE 并改为显式公式；Meta 分析改用 REML 与 Hartung-Knapp 并报告预测区间；中介分析写明识别假设并加入敏感性分析；回归部分说明结局常见时 OR 与 RR 的区别。
  • R 代码风格规范重写：原生管道、.by 分组、带关系约束的连接、list_rbind()、pmap()、nest() 加 map()、possibly()、broom::tidy() 取数，以及 styler/lintr 只读检查；新增 Python 代码风格规范。所有示例均实际运行。
  • 研究设计加入目标试验模拟、基于 DAG 的调整变量选择和 E 值；偏倚评价工具更新为 PROBAST+AI 和 ROBINS-I 第 2 版；论断强度参考按研究设计选择措辞。
  • 论文缺失信息标记统一，并提供 scan_placeholders.py 扫描 Markdown 与 Word 中的残留标记；修订检查可发现新增的因果措辞。
  • 项目一致性检查按数值比较置信区间、点估计和 P 值，不再受分隔符写法影响；新项目不再把字体路径误报为密钥。
  • SVG 流程图模板带完整语义标注并通过严格校验；没有图像生成工具时（如 Claude Code），结构图改用 SVG 绘制。
  • pptx 修改说明、学位论文排版、交付模板、归档脚本和统计图设置脚本均接入工作流。

验证

  • 239 项单元测试通过。
  • 28 个公开 skills、65 个分流案例通过，无依赖环。
  • 双端工作流安装审计通过，Claude Code 与 Codex doctor 70/70 通过。
  • release ZIP 通过 CRC、来源提交、版本、清单和 SHA-256 核验；解压后 22 个 skills 均通过格式校验。

SHA-256: f0912134db10b6d4379ee7fa6d53d7557ae770a8a2835cf9a3ec53f1b05c006a

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EpiAgentKit 1.1

EpiAgentKit 1.1

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@KangWang42 KangWang42 released this 02 Aug 19:12
v1.1
0bd0970

主要变化

  • R 正式研究代码默认采用 tidyverse 风格，并增加研究对象命名、控制流、重复工具和日志噪声检查。
  • 新项目使用单个 02_code/00_setup.R|py；总分析入口只执行显式列出的正式分析脚本。
  • 论文正文和稳定装配脚本放入 paper/，验收与一次性代码不再混入 02_code/。
  • “写论文”默认生成内容完整、可进入投稿适配的论文；只有明确要求时才交付大纲。
  • 统计表不再重复表内标题、装饰空行或白色分隔线。
  • 含真实人数、日期或阈值的病例筛选与研究流程图仍使用 research-visuals → imagegen；统计映射使用 publication-figures。
  • README 新增可直接复制的 Codex skill 更新工作流。

验证

  • 91 项单元测试通过。
  • 23 个公开 skills、40 个分流案例通过，无依赖环。
  • 双端工作流安装审计通过，Claude Code 与 Codex doctor 58/58 通过。
  • release ZIP 通过 CRC、来源提交、版本、清单和 SHA-256 核验。

SHA-256: 47cfc95de5dacf3535c9feee03c6b5c6b14995ac30e53407d4a4f7cfe4054650

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EpiAgentKit 1.0

EpiAgentKit 1.0

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@KangWang42 KangWang42 released this 02 Aug 10:45
v1.0
c0086fc

EpiAgentKit 1.0

本版本提供可独立安装的 EpiAgentKit 轻量 release，包含 17 个经筛选的流行病学与生物统计 skills，以及共享规则和安装说明。

最简单的安装方法，是把下面一句发给当前使用的 Agent。

Claude Code：

请把这个 EpiAgentKit release 安装到当前 Claude Code：https://github.com/KangWang42/EpiAgentKit/releases/tag/v1.0。保留我现有的个人配置，安装完成后检查 skills 是否可用。

Codex：

请把这个 EpiAgentKit release 安装到当前 Codex：https://github.com/KangWang42/EpiAgentKit/releases/tag/v1.0。保留我现有的个人配置，安装完成后检查 skills 是否可用。
  • 压缩包由固定文件清单确定性构建，包内记录源提交 c0086fcc35cf46c546cf88acbc256acb1e321982。
  • 不包含用户配置、凭据、会话、缓存、研究数据或本机运行时。
  • 不包含 docx、pdf、pptx、xlsx、中山大学模板和仓库维护专用内容。
  • 包含的 skills、外部依赖和许可边界见压缩包内说明。

本 release 未附覆盖全部内容的统一开源许可证，不据此授予再分发权；使用、转发或再分发前请核对包内各项许可与来源说明。

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