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@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Oct 18, 2018 · 3 commits to master since this release

Assets 2

Nouveautés

  • Possibilité d'utiliser le MNT en raster ou en vecteur dans la BDD (+ doc MNT) #439 (merci @mathieubossaert)
  • INSTALL_ALL - gestion du format date du serveur PostgreSQL (#435)
  • INSTALL_ALL - Amélioration de la conf Apache de TaxHub pour gérer son URL sans / à la fin
  • Dessin cartographique d'une autre couleur (rouge) que les observations (bleu)
  • Occtax : retour au zoom précédent lors de l'enchainement de relevé (#436)
  • Occtax : observateur rempli par défaut avec l'utilisateur connecté (#438)
  • Prise en compte des géométries nulles dans la fonction serializegeofn
  • Gestion plus complète des données exemple intégrées ou non lors de l'installation (#446)
  • Complément des différentes documentations
  • Complément FAQ (#441)
  • Documentation de la customisation (merci @DonovanMaillard)
  • Amélioration de l'architecture du gn_module d'exemple
  • Clarification de la configuration des gn_modules
  • Lire le fichier VERSION pour l'afficher dans l'interface (#421)
  • Utilisation de la vue export_occtax_sinp et non plus export_occtax_dlb par défaut pour les exports Occtax (#462)
  • Complément et correction des vues export_occtax_sinp et export_occtax_dlb (#462)
  • Mise à jour de Marshmallow (2.5.0 => 2.5.1)
  • Améliorations des routes de gn_monitoring et de la configuration des modules de suivi pour pouvoir utiliser le nom d'une application plutôt que son identifiant
  • Export Synthèse - Remplacement de la barre de téléchargement par un spinner (#451)

Corrections

  • Doc Import niveau 2 : Corrections et compléments
  • Correction du trigger Occtax > Synthèse qui met à jour le champs gn_synthese.observers_txt et les commentaires (#448 et #459)
  • Correction et amélioration de la fonction install_gn_module
  • Correction coquille dans le modèle gn_monitoring et la fonction serializegeofn
  • Installation uniquement sur un environnement 64 bits (documentation + vérification) #442 (merci @jbrieuclp et @sig-pnrnm)
  • Correction et découpage des scripts de mise à jour de la BDD depuis la version Beta5
  • Correction de l'édition des date_debut et date_fin de Occtax (#457)
  • Correction des exports depuis la Synthèse et intégration de la géométrie des observations (#461 et #456)
  • Ne pas remplir pr_occtax.cor_role_releves_occtax si observers_txt = true (#463)
  • Edition d'un relevé Occtax - Ne pas recalculer l'altitude existante (#424)
  • Correction de l'activation du formulaire Occtax après localisation du relevé (#469 et #471)
  • Carte - Enlever le remplissage des lignes (#458)
  • Amélioration du script de mise à jour de GeoNature (install/migration/migration.sh) (#465)
  • Suppression d'un doublon dans le modèle de gn_commons.t_modules (merci @lpofredc)

Autres

Notes de version

Pre-release
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@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Sep 23, 2018 · 170 commits to master since this release

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Nouveautés

  • Script install_all.sh compatible Ubuntu (16 et 18)
  • Amélioration du composant Download
  • Amélioration du ShapeService
  • Compléments de la documentation
  • Intégration de la documentation Développement backend dans la documentation
  • Nettoyage du code
  • Mise à jour de la doc de l'API : https://documenter.getpostman.com/view/2640883/RWaPskTw
  • Configuration de la carte (frontend/src/conf/map.config.ts) : OSM par défaut car OpenTopoMap ne s'affiche pas à petite échelle

Corrections

  • Correction du script install/migration/migration.sh
  • Ne pas afficher le debug dans le recherche de la synthèse
  • Correction du bug de déconnexion entre TaxHub et GeoNature (#423)
  • Correction de la fiche info d'Occtax
  • Champs Multiselect : Ne pas afficher les valeurs selectionnées dans la liste quand on modifie un objet
  • Trigger Occtax vers Synthèse : Correction des problèmes d'heure de relevés mal copiés dans la Synthèse
  • Correction des altitudes (non abouti) (#424)
  • Données exemple : Suppression de l'observers_txt dans la synthèse
  • Suppression d'un id_municipality en dur dans une route
  • Suppression de la librairie Certifi non utilisée

Notes de version

  • Suivez la procédure standard de mise à jour de GeoNature
  • Exécuter l'update de la BDD GeoNature (data/migrations/2.0.0rc1-to-2.0.0rc2.sql)
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@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Sep 21, 2018 · 254 commits to master since this release

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La version 2 de GeoNature est une refonte complète de l'application.

  • Refonte technologique en migrant de PHP/Symfony/ExtJS/Openlayers à Python3/Flask/Angular4/Leaflet
  • Refonte de l'architecture du code pour rendre GeoNature plus générique et modulaire
  • Refonte de la base de données pour la rendre plus standarde, plus générique et modulaire
  • Refonte ergonomique pour moderniser l'application

Présentation et suivi des développements : #168

Accueil

  • Message d'introduction customisable
  • Carte des 100 dernières observations
  • CSS général de l'application surcouchable

Occtax

Module permettant de saisir, consulter, rechercher et exporter des données Faune, Flore et Fonge de type Contact selon le standard Occurrences de taxon du SINP (https://inpn.mnhn.fr/telechargement/standard-occurrence-taxon).

  • Développement des formulaires de saisie, page de recherche, fiche détail, API, CRUVED et export
  • Possibilité de masquer ou afficher les différents champs dans le formulaire Occtax (#344)
  • Développement du formulaire de manière générique pour pouvoir réutiliser ses différents éléments dans d'autres modules sous forme de composants Angular
  • Configuration possible du module (Niveau de zoom, champs affichées, export...)
  • Ajout des nomenclatures dans les filtres d'Occtax à partir du composant dynamicForm qui permet de créer dynamiquement un formulaire en déclarant ses champs et leur type (#318)
  • Amélioration du composant de recherche d'un taxon en ne recherchant que sur les débuts de mot et en affichant en premier les noms de référence (ordrer_by cd_nom=cd_ref DESC) #334
  • Multilingue fourni avec français et anglais (extensible à d'autres langues)
  • Mise en place d'un export CSV, SHP, GeoJSON paramétrable dans Occtax. #363 et #366
  • Ajout d'un message d'erreur si l'utilisateur n'a pas de jeu de données ou si il y a eu un problème lors de la récupération des JDD depuis MTD
  • Prise en compte du CRUVED au niveau des routes et du front pour adapter les contenus et fonctionnalités aux droits de l'utilisateur
  • Mise en place des triggers alimentant la synthèse à partir des données saisies et modifiées dans Occtax

Synthèse

Module permettant de rechercher parmi les données des différentes sources présentes ou intégrées dans la base de données de GeoNature

  • Mise en place du backend, de l'API et du frontend #345
  • Interface de consultation, de recherche et d'export dans la Synthèse
  • Synthèse : Calcul automatique (trigger) des zonages de chaque observation (communes, zonages réglementaires et naturels)
  • Recherche sur les zonages générique et paramétrable
  • Recherche par taxon, liste de taxons, par rang, groupe, liste rouge, milieu, attribut taxonomique, nomenclature, date, période, commune, zonage, cadre d'acquisition, jeu de données, observateur, polygone, rectange ou cercle dessiné
  • Retour à la fiche source possible si l'observation a été saisie dans un module de GeoNature
  • Affichage de la fiche détail de chaque observation
  • Attributs TaxHub dynamiques et paramétrables
  • Configuration possible du module (colonnes, limites de recherche et d'export, zoom, export...)
  • Export basé sur une vue (observations et statuts)
  • Prise en compte du CRUVED pour définir les données à afficher et à exporter #412
  • Recherche de taxons : Liste basée sur une table alimentée automatiquement par les taxons présents au moins une fois dans la Synthèse

Export

Module permettant de proposer des exports basés sur des vues

  • Mise en place temporaire d'un export unique, basé sur une vue s'appuyant sur les données de Occtax, par jeu de données
  • A remplacer par le module générique https://github.com/PnX-SI/gn_module_export (en cours de développement) permettant de générer des exports à volonté en créant des vues et en les affectant à des utilisateurs ou des groupes. Chaque export sera accompagné de son API standardisée et documentée

Admin

Module d'administration des tables centrales de GeoNature

  • Mise en place d'un module (incomplet) permettant de gérer les métadonnées et les nomenclatures

Gestion des droits

  • Mise en place d'un système baptisé CRUVED permettant de définir globalement ou par module 6 actions sont possibles (Create / Read / Update / Validate / Export / Delete) sur 3 portées possibles (Mes données / Les données de mon organisme / Toutes les données)
  • Ces évolutions ont été intégrées au niveau du schéma utilisateurs de la base de données de UsersHub, de son module (https://github.com/PnX-SI/UsersHub-authentification-module), des routes de l'API GeoNature et des interfaces

Bases de données

  • Développement d'un module et d'une API générique et autonome pour la gestion des nomenclatures (https://github.com/PnX-SI/Nomenclature-api-module). Il permet d'avoir un mécanisme générique de centralisation des listes de valeurs (nomenclatures) pour ne pas créer des tables pour chaque liste : https://github.com/PnX-SI/Nomenclature-api-module. Les valeurs de chaque nomenclature s'adaptent en fonction des regnes et groupe 2 INPN des taxons.
  • Mise en place de tables de stockage verticales (historique, médias et validation) #339
  • Mise en place d'un référentiel géographique avec un schéma dédié (ref_geo), partageable avec d'autres applications comprenant une table des communes, une table générique des zonages, une table pour le MNT et des fonctions pour intersecter point/ligne/polygones avec les zonages et le MNT (#228)
  • Evolution du schéma utilisateurs de UsersHub pour passer d'une gestion des droits avec 6 niveaux à un mécanisme plus générique, souple et complet. Il permet d'attribuer des actions possibles à un rôle (utilisateur ou groupe), sur une portée; dans une application ou un module. 6 actions sont possibles dans GeoNature : Create / Read / Update / Validate / Export / Delete (aka CRUVED). 3 portées de ces actions sont possibles : Mes données / Les données de mon organisme / Toutes les données.
  • Droits CRUVED : La définition du CRUVED d'un rôle (utilisateur ou groupe) sur un module de GeoNature surcouche ses droits GeoNature même si ils sont inférieurs. Si une action du CRUVED n'est pas définie au niveau du module, on prend celle de l'application parente. #292
  • Si un rôle a un R du CRUVED à 0 pour un module, alors celui-ci ne lui est pas listé dans le Menu et il ne lui est pas accessible si il en connait l'URL. #360
  • Développement des métadonnées dans la BDD (schéma gn_meta) sur la base du standard Métadonnées du SINP (http://standards-sinp.mnhn.fr/category/standards/metadonnees/). Elles permettent de gérer des jeux de données, des cadres d'acquisition, des acteurs (propriétaire, financeur, producteur...) et des protocoles. Chaque relevé est associé à un jeu de données.
  • Développement d'un mécanisme de calcul automatique de la sensibilité d'une espèce directement dans la BDD (sur la base des règles nationales et régionales du SINP + locales éventuellement)
  • Intégration du calcul automatique de l'identifiant permanent SINP (#209)
  • Création du schéma gn_monitoring pour gérer la partie générique des modules de suivi (sites et visites centralisés) et les routes associées
  • Mise en place d'un schéma gn_commons dans la BDD qui permet de stocker de manière générique des informations qui peuvent être communes aux autres modules : l'historique des actions sur chaque objet de la BDD, la validation d'une donnée et les médias associés à une donnée. Accompagné de fonctions génériques d'historisation et de validation des données mises en place sur le module Occtax. #339
  • Ajout d'une vue matérialisée (gn_synthese.vm_min_max_for_taxons) et d'une fonction (gn_synthese.fct_calculate_min_max_for_taxon) permettant de renvoyer des informations sur les observations existantes d'un taxon (étendue des observations, date min et max, altitude min et max, nombre d'observations) pour orienter la validation et la saisie (PnX-SI/gn_module_validation#5). Désactivée pour le moment.
  • Ajout d'un trigger générique pour calculer la géométrie dans la projection locale à partir de la géométrie 4326 (#370)
  • Ajout d'un trigger pour calculer automatiquement les zonages des sites de suivi (gn_monitoring.fct_trg_cor_site_area())
  • Gestion des conflits de nomenclatures en n'utilisant plus leur id_type ni leur id_nomenclature lors de la création de leur contenu (code_nomenclature) (#384)
  • Mise en place d'un schéma gn_imports intégrant des fonctions SQL permettant d'importer un CSV dans la BDD et de mapper des champs de tables importées avec ceux d'une table de GeoNature pour générer le script INSERT INTO
  • Début de script de migration GeoNature V1 vers GeoNature V2
  • Nombreuses fonctions intégrées dans les schémas de la BDD

Installation

  • Scripts d'installation autonome ou globale de GeoNature sur Debian (8 et 9) et Ubuntu (16 et 18)
  • Scripts de déploiement spécifiques de DEPOBIO (MTES-MNHN)

Documentation

  • Rédaction d'une documentation concernant l'installation (autonome ou globale), l'utilisation, l'administration et le développement : https://geonature.readthedocs.io

Développement

  • Découpage de l'application en backend / API / Frontend
  • Multilingue au niveau de l'interface et des listes de valeurs avec français et anglais intégrés mais extensible à d'autres langues (#173)
  • Développement de composants Angular génériques pour pouvoir les utiliser dans plusieurs modules sans avoir à les redévelopper ni les dupliquer (composant CARTE, composant RECHERCHE TAXON, composant OBSERVATEURS, composant NOMENCLATURES, SelectSearch, Municipalities, Observers, DynamicForm, MapList...)
  • Implémentation de la gestion des droits au niveau de l'API (pour limiter les données affichées à un utilisateur en fonction de ses droits) et au niveau du Frontend (pour afficher ou non certains boutons aux utilisateurs en fonction de leurs droits).
  • Par défaut, l'authentification et les utilisateurs sont gérés localement dans UsersHub, mais il est aussi possible de connecter GeoNature directement au CAS de l'INPN, sans UsersHub (cas de l'instance nationale INPN de GeoNature).
  • Connexion possible au webservice METADONNEES de l'INPN pour y récupérer les jeux de données en fonction de l'utilisateur connecté, avec mise à jour des JDD à chaque appel de la route
  • Mise en place d'un mécanisme standardisé de développement de modules dans GeoNature (#306)
  • Ajout de tests unitaires au niveau du backend et du frontend
  • Ajout d'un mécanisme de log par email (paramètres MAILERROR)
  • Début de création du module de gestion des médias (backend uniquement)
  • Mise en place d'une configuration globale et d'une configuration par module
  • Fonction d'installation d'un module et de génération des fichiers de configuration
  • Gestion de l'installation d'un module qui n'a pas de Frontend dans GeoNature
  • Mise en place d'une route générique permettant de requêter dans une vue non mappée
  • Mise en place d'un script pour la customisation de la plateforme nationale (https://github.com/PnX-SI/GeoNature/blob/develop/install_all/configuration_mtes.sh)

Autres modules

Notes de version

Pour les utilisateurs utilisant la version 1 :

Il ne s'agit pas de mettre à jour GeoNature mais d'en installer une nouvelle version. En effet, il s'agit d'une refonte complète.

  • Passer à la dernière version 1 de GeoNature (1.9.1)
  • Idem pour UsersHub et TaxHub
  • Installer GeoNature standalone ou refaire une installation complète
  • Adaptez les scripts présents dans /data/migrations/v1tov2 et éxécutez-les

TODO : MAJ depuis V1 à tester et compléter

Pour les utilisateurs utilisant la version 2.0.0.beta5 :

@gildeluermoz gildeluermoz released this May 17, 2018 · 2956 commits to master since this release

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Corrections

  • Installation - Suppression des couches SIG (communes, znieff...) pour les télécharger sur http://geonature.fr/data/inpn/layers/ et ainsi alléger le dépôt de 158 Mo.
  • Compléments mineurs de la documentation
  • Migration du script install_all en Debian 9. La doc et le script Debian 8 restent disponibles dans le répertoire docs/install_all
  • Corrections mineures de triggers
  • Compatibilité avec TaxHub 1.3.2, UsersHub 1.3.1, GeoNature-atlas 1.3.2

Notes de version

  • Vous pouvez passer directement d'une 1.7.X à la 1.9.1, en prenant en compte les notes des différentes versions intermédiaires, notamment les scripts de mise à jour de la BDD ainsi que les éventuels nouveaux paramètres à ajouter.
  • Exécuter le script de mise à jour de la BDD data/update_1.9.0to1.9.1.sql

@gildeluermoz gildeluermoz released this Jul 6, 2017 · 2983 commits to master since this release

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ATTENTION : Les évolutions de cette version concernent aussi la webapi. Si vous utilisez les applications GeoNature-mobile, vous devez mettre à jour l'API de GeoNature-mobile-webapi en version 1.2.0 (https://github.com/PnEcrins/GeoNature-mobile-webapi), compatible avec cette version 1.9.0 de GeoNature.

A noter aussi que cette version de GeoNature est compatible avec GeoNature-atlas 1.2.4 et +.

Nouveautés

  • Ajout de la création des index spatiaux à la création initiale de la base.
  • Création ou mise à jour des géométries compatible PostGIS 2.
  • Ajout du champ diffusable (oui/non) dans le formulaire web de saisie, uniquement pour ContactFaune et Mortalité (TODO : faire la même chose pour les autres protocoles).
  • Multi-projection : Les versions antérieures de GeoNature n'étaient compatibles qu'avec la projection Lambert 93 (srid: 2154). Cette version permet de choisir sa projection locale. Elle ajoute un paramètre srid_local dans le config/settings.ini et renomme tous les champs the_geom_2154 en the_geom_local des tables "métier".
    Ce paramètre est notamment utilisé lors de la création de la base pour affecter le srid de la projection locale à tous les champs the_geom_local présents dans les tables de la base. Ce paramètre est également utilisé pour mettre en cohérence le système de projection local utilisé dans toutes les couches SIG présentes dans la base et les géométries stockées dans les champs the_geom_local des tables "métier". Le paramétrage du service WMS dans wms/wms.map est également pris en charge par le script d'installation de l'application.
  • Correction de l'installation de npm
  • Script install_all.sh mis à jour avec les nouvelles versions de GeoNature-atlas, de TaxHub et de UsersHub.

IMPORTANT : toutes les couches SIG insérées dans le schéma layers doivent être dans la projection fournie pour le paramètre srid_local. L'application est livrée avec un ensemble de couches en Lambert 93 concernant la métropole. Une installation avec une autre projection, hors métropole, doit donc se faire sans l'insertion des couches SIG. Vous devrez manuellement fournir le contenu des tables du schéma layers dans la projection choisie.

Notes de versions

  • Vous pouvez ajouter les paramètres srid_local, install_sig_layers et add_sample_data au fichier config/settings.ini en vous inspirant du fichier config/settings.ini.sample. Toutefois ces paramètres ne sont utilisés que pour une nouvelle installation et notamment pour l'installation de la base.

  • Vous pouvez passer directement d'une 1.7.X à la 1.9.0, en prenant en compte les notes des différentes versions intermédiaires, notamment les scripts de mise à jour de la BDD ainsi que les éventuels nouveaux paramètres à ajouter.

  • Si vous migrez depuis la version 1.8.3, exécutez le fichier SQL data/update_1.8.3to1.9.0.sql. Comme GeoNature ne fonctionne jusque là que pour des structures de métropole, il est basé sur le fait que le champ the_geom_local reste en Lambert 93 (2154). Assurez-vous que le paramètre $srid_local dans lib/sfGeonatureConfig.php est égal à 2154.
    ATTENTION : ce script SQL renomme tous les champs the_geom_2154 en the_geom_local de la BDD de GeoNature. Ceci affecte de nombreuses tables, de nombreux triggers et de nombreuses vues de la base. Le script n'intègre que les vues fournies par défaut. Si vous avez créé des vues spécifiques, notamment pour le module d'export, ou si vous avez modifié des vues fournies, vous devez adapter/compléter le script. Vous pouvez vous inspirer de son contenu.

  • RAPPEL : Ceci affecte également la webapi des applications mobiles. Vous devez donc mettre à jour votre webapi si vous utilisez la saisie sur les applications mobiles. Une release de la webapi devrait sortir bientôt.

@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Apr 10, 2017

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Corrections

  • Correction du script d'installation globale (install_all) si l'utilisateur de BDD par défaut a été renommé (data/grant.sql)
  • Correction de la création des vues qui remontent la liste des taxons dans les 3 contacts

@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Feb 23, 2017 · 3048 commits to master since this release

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Nouveautés

  • Multi-organisme : l'organisme associé à la donnée est désormais celui de l'utilisateur connecté dans l'application (lors de la création d'une observation uniquement).
  • Taxonomie : création d'une liste Saisie possible, remplaçant l'attribut Saisie. Cela permet de choisir les synonymes que l'on peut saisir ou non dans GeoNature en se basant sur les cd_nom (bib_listes et cor_nom_liste) et non plus sur les cd_ref (bib_attributs et cor_taxon_attribut). Voir le script de migration SQL data/update_1.8.2to1.8.3.sql pour bien basculer les informations de l'attribut dans la nouvelle liste.
  • Correction de la vue synthese.v_tree_taxons_synthese potentiellement bloquante à l'ouverture de la synthèse.
  • Suppression de la table utilisateurs.bib_observateurs inutile.
  • Création des index spatiaux manquants (performances)
  • Clarification et corrections mineures du script install_all
  • Ajout du MCD de la 1.8 (par @xavier-pnm) - https://github.com/PnEcrins/GeoNature/blob/master/docs/2017-01-mcd_geonaturedb_1.8.2.png
  • Améliorations du nom des fichiers exportés depuis la Synthèse (par @sylvain-m)

Notes de versions

  • Vous pouvez supprimer les lignes concernant le paramètre public static $id_organisme = ... dans lib/sfGeonatureConfig.php, l'organisme n'étant plus un paramètre fixe mais désormais celui de l'utilisateur connecté.
  • Vous pouvez passer directement d'une 1.7.X à la 1.8.3, en prenant en compte les notes des différentes versions intermédiaires.
  • Si vous migrez depuis la version 1.8.2, exécutez le fichier SQL data/update_1.8.2to1.8.3.sql.

@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Jan 11, 2017 · 3084 commits to master since this release

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Nouveautés

  • Modularité des scripts SQL de création de la base en les dissociant par protocole et en regroupant les triggers dans les schémas de chaque protocole (préparation GeoNature V2)
  • Correction d'une requête dans flore station (indépendance vis à vis de flore patrimoniale)
  • Correction du trigger synthese_update_fiche_cflore (@ClaireLagaye)

Notes de versions

Vous pouvez passer directement d'une 1.7.X à la 1.8.2, en prenant en compte les notes des différentes versions intermédiaires.

Si vous migrez depuis la version 1.8.1, éxécutez le fichier data/update_1.8.1to1.8.2.sql. Consultez les dernières lignes de ce fichier : vous devez évaluer si la requête d'insertion dans la table taxonomie.cor_taxon_attribut doit être faite ou non (vous pourriez avoir déjà constaté et corrigé cette erreur lors d'une précédente migration). Cela corrige l'absence de taxons protégés dans votre synthese en récupérant les informations de protection présentes dans le champ filtre3 de la table save.bib_taxons

@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Jan 5, 2017 · 3108 commits to master since this release

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Nouveautés

  • Ajout des sauvegardes et de l'installation globale avec un exemple détaillé dans la documentation : http://geonature.readthedocs.io
  • Optimisation et correction de la vue qui retourne l'arbre des rangs taxonomiques (synthese.v_tree_taxons_synthese)
  • Mise en cohérence des données exemple de GeoNature-atlas avec les critères des vues matérialisées de GeoNature-atlas
  • Mise à jour de 2 triggers du Contact Flore (@ClaireLagaye)

Notes de versions

Vous pouvez passer directement d'une 1.7.X à la 1.8.1, en prenant en compte les notes des différentes versions intermédiaires.

Si vous migrez depuis la version 1.8.0, éxécutez le fichier data/update_1.8to1.8.1.sql

@camillemonchicourt camillemonchicourt released this Dec 14, 2016 · 3147 commits to master since this release

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Nouveautés

  • Passage à TAXREF version 9
  • Accès à la synthèse en consultation uniquement pour des utilisateurs enregistrés avec des droits 1
  • Ajout d'un champ diffusion (oui/non) dans la table synthese.syntheseff, utilisable dans GeoNature-atlas. Pas d'interface de gestion de ce champ pour le moment. CF #132
  • Création d'un script d'installation simplifié pour un pack UsersHub, TaxHub, GeoNature et GeoNature-atlas : https://github.com/PnEcrins/GeoNature/tree/master/docs/install_all
  • Factorisation des SQL de création des schémas taxonomie et utilisateurs en les récupérant dans les dépots TaxHub et UsersHub
  • Compatibilité avec l'application TaxHub qui permet de gérer la taxonomie à partir de TAXREF. Cela induit d'importants changements dans le schéma taxonomie, notamment le renommage de taxonomie.bib_taxons en taxonomie.bib_noms, la suppression de taxonomie.bib_filtres et l'utilisation de taxonomie.bib_attributs (voir PnX-SI/TaxHub#71 pour plus d'informations). Voir aussi le fichier de migration data/update_1.7to1.8.sql qui permet d'automatiser ces évolutions de la BDD
  • Compatibilité avec l'application GeoNature-atlas qui permet de diffuser les données de la synthèse faune et flore dans un atlas en ligne (exemple : http://biodiversite.ecrins-parcnational.fr)
  • Création d'un site internet de présentation de GeoNature : http://geonature.fr

Corrections

  • Amélioration des triggers concernant la suppression de fiches orphelines
  • Affichage par défaut du nom latin dans Contact flore et Contact invertébrés
  • Correction des exports lors de la présence de points-virgules dans les commentaires. Fix #143
  • Suppression du besoin d'un super utilisateur lors de l'installation de la BDD. Fix #141
  • Correction de l'ID des protocoles mortalité et invertebres dans la configuration par défaut
  • Suppression d'un doublon dans le fichier de configuration symfony de l'application
  • Correction des coordonnées lors de l'export de données Flore Station
  • Autres corrections mineures

Note de version

  • Exécuter le script SQL de migration réalisant les modifications de la BDD de la version 1.7.X à 1.8.0 data/update_1.7to1.8.sql
  • Mettre à jour taxref en V9 en vous inspirant du script data/taxonomie/inpn/update_taxref_v8tov9

TaxHub

L'application TaxHub (https://github.com/PnX-SI/TaxHub) est désormais fonctionnelle, documenté et installable.

Elle vous aidera à gérer vos taxons et l'ensemble du schéma taxonomie, présent dans la BDD de GeoNature.

TaxHub évoluera pour intégrer progressivement de nouvelles fonctionnalités.

Il est conseillé de ne pas installer la base de données de TaxHub indépendamment et de connecter l'application directement sur le la base de données de GeoNature.

GeoNature-atlas

GeoNature-atlas est également basé sur le schéma taxonomie de TaxHub. Ainsi TaxHub permet la saisie des informations relatives aux taxons (descriptions, milieux, photos, liens, PDF...). GeoNature-atlas dispose de sa propre base de données mais pour fonctionner en connexion avec le contenu de la base GeoNature il faut à minima disposer d'une version 1.8 de GeoNature.

Note

Une régression dans le contenu de Taxref V9 conduit à la suppression de l'information concernant le niveau de protection des espèces (régional, national, international,...).

Cette information était utilisée par GeoNature, notamment pour définir les textes à retenir pour la colonne concerne_mon_territoire de la table taxonomie.taxref_protection_articles.

Vous devez désormais remplir cette colonne manuellement.