add parameter node_label_scale for emapplot

[huerqiang]

1、增加了一个参数node_label_scale来调节emapplot中节点label的大小
2、将label字体改成了阴影字体

[GuangchuangYu]

为什么啥都要scale，比直接用个fontsize参数有什么好处？

[huerqiang]

老师，我把node_label_scale改成了node_label_size。 之前是想到有些用户可能对字体的绝对大小没什么概念，不看文档的话不知道我们使用的默认大小是多少，于是我就用个node_label_scale来作为相对大小的参数。

[GuangchuangYu]

都可以，无所谓的。最主要是要保持一致性。

另外，不要每次都加大版本号。我一般是X.Y.Z.991，加后面的991，然后等我要push到bioconductor的时候，我再改为X.Y.Z+1.

[GuangchuangYu]

news.md也要记录一下有什么新的东西。

[GuangchuangYu]

我说你为什么要用node_label_size，而不直接用fontsize呢？就是为了兼顾cnetplot，然后你还搞成一样的。

cnetplot有category和gene两种点。要分开参数设置，我觉得你的参数呢，又臭又长了，而且很乱。

参数命名得有规则，比如fontsize_category, fontsize_gene，一看就知道是设置category还是gene，而且都以fontsize_打头的话，假设我想调字体大小，我打下了fontsize_然后按下tab，就可以参数补齐，有几种选择给我选。

你参照一下https://www.statmethods.net/advgraphs/parameters.html中的cex.XX参数。

你这段时间改过的可视化函数，参数都重新搞一下，之前是越搞越乱。统一一下。包括之前XX_scale，可以改成scale_XX，这样，一类东西以一样的开头，像geom做为图层开始一样。

[GuangchuangYu]

当所有东西都是cex_之后，少数的fontsize就又跟人家不一样了。也改成cex吧。比如cex_label_category, cex_label_gene

[huerqiang]

老师，我在新的提交中把参数名称改成了cex_label_category, cex_label_gene和cex_label_group

[GuangchuangYu]

你的代码里： 5 * cex_label_gene 像这种的数字5太多了。 还有数字2.5之类的。 证明你写代码还是不太注意啊。比如5你想改成6呢，2.5你想改成3呢，那得改多少处，还可能有漏的。 你不知道在程序先声明常量吗？然后其它地方用常量变量名，需要改动的话，改声明一处地方就行。

…

On Sat, Sep 26, 2020 at 12:32 AM Erqiang Hu ***@***.***> wrote: 老师，我在新的提交中把参数名称改成了cex_label_category, cex_label_gene和cex_label_group — You are receiving this because you commented. Reply to this email directly, view it on GitHub <#62 (comment)>, or unsubscribe <https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AAEY625QPYWSGJGO5BT6W2LSHTA2DANCNFSM4RRRRWFA> .

-- --~--~---------~--~----~------------~-------~--~----~ Guangchuang Yu PhD Professor, Associate Director Department of Bioinformatics School of Basic Medical Sciences Southern Medical University Guangzhou, China www: https://guangchuangyu.github.io -~----------~----~----~----~------~----~------~--~---

[huerqiang]

老师，我在代码中加入提前声明常量了。另外在cnetplot的图中，之前是先打一层category节点的label，再打一层gene节点的label。这样的话当gene节点的label和category节点的label有重叠时，category的label就会被遮盖住。category的label应当比gene节点的label更重要一些，因此我把它们的顺序换了一下。