NANDO
NANDO（Nanbyo Disease Ontology）は，「指定難病」制度対象の疾患と「小児慢性特定疾病」制度対象の疾患について，国内においてオーソライズされた資料を元に，疾患概念と疾患同士の関係性を厳密に体系化したものである．また，国際的な疾患オントロジーMONDOへのクロスリファレンスを含む．
取得
参照
作成
1. 設定 (Macで検証済み)
$ brew install raptor$ pipenv install$ pipenv shell$ ./setting.sh
2. ファイル作成
- TTL
$ python -m converter
- RDF
$ rapper -i turtle -o rdfxml-abbrev results/nando.ttl > results/nando.rdf
- HTML
$ xsltproc --output results/nando.html data/owl2xhtml.xsl results/nando.rdf
統計情報
| 全疾患 | 指定難病 | 小児慢性特定疾病 | |
|---|---|---|---|
| クラス数 | 2,347 |
1,023 |
1,323 |
| 英語表記を含むクラス数 | 2,284 |
991 |
1,292 |
| 疾患定義を含むクラス数 | 1,189 |
333 |
856 |
| MONDOへのクロスリファレンスを含むクラス数 | 1,382 |
698 |
684 |
ライセンス
コンタクト
新しい用語のリクエストやクラスの修正依頼，オントロジーに関する問題点・疑問点の報告には，本リポジトリの Issue tracker をご利用ください．
出典
- 「概要、診断基準等」（厚生労働省）（https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000084783.html)
（2020年7月14日に利用） - 「臨床調査個人票」（厚生労働省）（https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000084783.html)
（2020年7月14日に利用） - 小児慢性特定疾病情報センター「概要」（https://www.shouman.jp/disease/search/group/)
（2020年7月14日に利用） - 小児慢性特定疾病情報センター「意見書」（https://www.shouman.jp/disease/search/group/)
（2020年7月14日に利用）
謝辞
- 本オントロジーの構築に際してDDrareおよびRDVJを参照した．
- 本オントロジーの構築にBioHackathonの成果を利用した．