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Base de dados e scripts para ajustar função de pedotransferência (PTF) para cálculo de Água Disponível (AD) a partir das frações Areia Total, Silte e Argila. A ser utilizada pelo ZARC

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dvictori/ptf_zarc

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Função de Pedotransferência ZARC

Nesse repositório estão os scripts R utilizados para gerar a função de pedotransferêcia (PTF) a ser utilizada pelo Zoneamento Agrícola de Risco Climático (ZARC).

A descrição detalhada do trabalho pode ser encontrada na publicação:

TEIXEIRA, W. G.; VICTORIA, D. de C.; BARROS, A. H. C.; LUMBRERAS, J. F.; ARAUJO FILHO, J. C. de; SILVA, F. A. M. da; LIMA, E. de P.; BUENO FILHO, J. S. de S.; MONTEIRO, J. E. B. de A. Predição da água disponível no solo em função da granulometria para uso nas análises de risco no Zoneamento Agrícola de Risco Climático. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 272. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2021 http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/224270/1/CNPS-BPD-272-2021.epub

Adicionalmente, estão incluídos os scripts para gerar as figuras encontradas na publicação citada acima.

Todos os scripts foram desenvolvidos na liguagem R, utilizando projeto da IDE RStudio. Os seguintes pacotes adicionais são necessários:

  • MASS
  • Ternary
  • Tidyverse

Os scripts estão organizados na seguinte estrutura de pastas e arquivos:

  • dados - pasta com os dados primários utilizados
    • bd_zarc.csv - base de dados com amostras de AD
    • bd_independente.csv - base de dados independente, com amostras de AD cedidas por Dr. Eduardo Guimarães Couto (UFMT - Cuiabá), Dr. Jean Dalmo de Oliveira Marques (IFAM - Manaus) e Joberta Cardoso Pastana Yakuwa (mestranda da UFRA)
    • sensibilidade_risco_cad_csv - dados da variação do risco agrícola em relação à CAD
  • figs - pasta com os gráficos gerados pelos scripts e utilizados na publicação
  • resultados - pasta com os resultados gerados pelos scripts
    • Preditos_triangulo_AD_m1.csv - AD predita e intervalo de confiança p/ o triangulo textural por M1 (n = 5151)
    • Preditos_triangulo_AD_m2.csv - AD predita e intervalo de confiança p/ o triangulo textural por M2 (n = 5151)
    • PTF_ZARC_m1_ms.csv - Dados preditos por M1 e M2 para o BD-Zarc (n = 1021)
  • src - pasta com os scripts R
    • estatistica_descritiva_bd_zarc.R - Análise da BD-Zarc, usado para gerar gráficos de densidade, boxplots e representação no gráfico ternário. Inclui gráficos descrevendo resultado do modelo M2
    • estatistica_descritiva_base_independente.R - Análise da BD-Independente, usado para gerar gráficos de densidade, boxplots e representação no gráfico ternário
    • outras_PTFs.R - scripts com outras PTFs usadas para a comparação
    • grupo_subgrupo_textural.R - funções para retornar o grupo / subgrupo textural do SiBCS de uma amostra
    • sensibilidade_risco_ad.r - Script para avaliar a sensibilidade do risco à AD e avaliar a divisão das novas classes de AD
    • PTF_AD_MIXTURE.R - Script para calibração da PTF, modelos M1 e M2. Incluí gráficos ternários e análise do modelo gerado
    • validacao_cruzada_m1_m2.R - validação cruzada dos modelos m1 e m2
    • validacao_cruzada_e_compara_PTFs.Rmd - Notebook para fazer a validação cruzada e comparação do resultado do M2 com outras PTFs da literatura. Originalmente foi escrito na forma de um Notebook. Decidido manter nesse formato.

Principais resultados

Como principais resultados podemos citar:

  1. PTF para estimativa da AD a partir das frações Areia Total, Silte e Argila (src/PTF_AD_MIXTURE.R)
  2. Novas classes de AD para o ZARC (src/sensibilidade_risco_ad.R)
    Novas classes de AD{width=500px}
  3. Triângulo textural com as novas classes de AD
    Classes de AD no triângulo
  4. Intervalo de confiânça das estimativas de AD no triângulo
    Intervalo de confiânça da AD

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