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yejelim/vitaldb-mcp-server

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VitalDB MCP Server - Advanced Edition

VitalDB 데이터를 자연어로 탐색하고 고급 분석을 수행할 수 있는 Model Context Protocol (MCP) 서버입니다.

✨ 주요 기능

🔍 1. 고급 데이터 필터링

  • 통계 기반 필터링: "평균 심박수가 100 이상인 케이스 찾기"
  • 조건식 지원: >100, >=80, <60, 50-100
  • 대규모 분석: 최대 100개 이상의 케이스 동시 처리

📊 2. 일괄 분석

  • 배치 처리: 여러 케이스를 한 번에 분석
  • 다중 트랙 분석: 한 케이스의 여러 신호를 동시 분석
  • 통계 추출: 평균, 중앙값, 표준편차, 왜도, 첨도 등

🔗 3. 상관관계 분석

  • 두 신호 간 상관계수 계산
  • 케이스별 상관관계 및 전체 상관관계
  • 산점도 시각화 (추세선 포함)

📈 4. 그룹 비교

  • 두 그룹 통계 비교
  • t-test 자동 수행
  • p-value 계산 및 유의성 판단

🎨 5. 고급 시각화

  • 무제한 케이스 플롯: 오버레이 또는 서브플롯
  • 분포 시각화: 히스토그램, 박스플롯, 바이올린 플롯
  • 히트맵: 시간대별 트랙 값 변화
  • 상관관계 산점도: 회귀선 포함

🔬 6. 이상치 탐지

  • Z-score 방법: 표준편차 기반
  • IQR 방법: 사분위수 기반
  • 시각화: 이상치 위치 자동 표시

📂 7. 데이터 내보내기

  • CSV 저장: 분석 결과를 파일로 저장
  • 다중 케이스/트랙 지원

🚀 설치 방법

1. 의존성 설치

cd /Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server
./install.sh

2. Claude Desktop 설정

설정 파일 위치: ~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "vitaldb": {
      "command": "/Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server/venv/bin/python",
      "args": ["/Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server/server.py"]
    }
  }
}

3. Claude Desktop 재시작

설정 후 Claude Desktop을 완전히 종료하고 다시 시작하세요.

💡 실제 활용 예시

"마취 중 평균 심박수가 100 이상이었던 환자들의 수술 중 체온 변화 특징은?"

이런 복잡한 질문도 자연어로 가능합니다!

🛠️ 사용 가능한 도구

기본 도구

  • find_cases: 트랙 기반 케이스 검색
  • get_case_info: 케이스 정보 조회
  • search_available_tracks: 사용 가능한 트랙 목록

고급 분석

  • filter_cases_by_statistics: 통계 조건 필터링
  • batch_analyze_cases: 일괄 분석
  • analyze_correlation: 상관관계 분석
  • compare_groups: 그룹 비교
  • detect_anomalies: 이상치 탐지
  • time_window_analysis: 시간 구간 분석
  • export_to_csv: CSV 내보내기

시각화

  • plot_multiple_cases: 다중 케이스 플롯 (무제한)
  • plot_distribution: 분포 시각화
  • plot_scatter_correlation: 산점도 상관관계
  • plot_heatmap: 시간대별 히트맵

📋 VitalDB 트랙 종류

생체 신호

  • ECG_II, ECG_V5: 심전도
  • PLETH: 맥파
  • RESP: 호흡 파형

혈압

  • ART: 동맥압
  • CVP: 중심정맥압
  • PAP: 폐동맥압
  • NIBP_SYS, NIBP_DIA, NIBP_MBP: 비침습적 혈압

산소/가스

  • SpO2: 산소포화도
  • EtCO2: 호기말 이산화탄소
  • FiO2: 흡입산소농도

마취/진정

  • BIS: 뇌파지수
  • MAC: 최소폐포농도

기타

  • HR: 심박수
  • RR: 호흡수
  • TEMP: 체온

🔧 문제 해결

1. MCP 서버가 연결되지 않는 경우

  • Claude Desktop을 완전히 종료하고 재시작
  • 설정 파일의 경로가 정확한지 확인
  • Python 경로가 올바른지 확인

2. VitalDB 다운로드 느린 경우

  • 인터넷 연결 확인
  • 샘플링 간격을 크게 설정 (예: interval=1.0)
  • 작은 케이스 수로 시작

3. 패키지 오류

cd /Users/yeze-macbookair-2025/workspaces/vitaldb-mcp-server
source venv/bin/activate
pip install --upgrade -r requirements.txt

📚 프로젝트 구조

vitaldb-mcp-server/
├── server.py              # 메인 서버 (MCP 엔드포인트)
├── tools.py               # 도구 정의
├── handlers.py            # 분석 기능 핸들러
├── visualization.py       # 시각화 핸들러
├── utils.py               # 유틸리티 함수
├── requirements.txt       # Python 의존성
├── install.sh            # 설치 스크립트 (Mac/Linux)
├── install.bat           # 설치 스크립트 (Windows)
└── README.md            # 이 문서

🎓 학습 리소스

📝 라이선스

MIT License


제작: VitalDB MCP Server Advanced Edition
버전: 2.0.0
최종 업데이트: 2025-10-07

About

for Korea Clinical Datathon 2025

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Packages

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