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Beta 2

Beta 2 Pre-release
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@798645706 798645706 released this 09 Oct 14:21

Beta 2 — 2026-11-05

安装包:dsh-strawberry-data-hub@0.1.0-beta.9。本版整合首发后所有新增功能与修复;公开展示名与 npm 包技术版本分别管理。

  • 兼容 DeepSeek Harness 桌面客户端 0.2.1-rc.5,保留旧版 dsh-tools 0.1.5-rc.2 支持。

  • FASTA 导出跟随会话当前工作目录,使用文件系统规范路径登记附件;下载改为经字节校验的本机链接,避免依赖旧版 Web 下载路由。

  • 补充桌面客户端安装步骤及工作目录切换、附件和下载的回归验证。

  • BerryLocus 改用结构化参考目录与 SNV 草稿接口,移除插件对网站聊天接口和试用额度的依赖;继续校验参考版本、REF/ALT、会话归属及独立提交确认。

  • BerryPlot 改为结构化目录与草稿接口,由服务器校验数据;不调用网站模型、不消耗网站试用额度,保留会话授权和独立提交确认。

  • 目录和下载的网络读取失败明确区分于提交结果不明,避免将只读失败误报成可能已创建任务。

  • 明确拒绝后的请求允许用户手动重试;网络结果不明仍禁止重复提交,重复提示不再暗示服务器已存在草稿。

  • 补充代谢物与基因组证据操作的必填参数校验、区间范围和游标配对检查。

  • 大目录和代谢物矩阵支持20 MiB以内完整JSON下载,保留原始字节校验和来源摘要。

  • 提供37项工具:29项只读服务接口、2项本地工具、6项任务流程工具。

  • 文献检索保留人工整理证据、摘要及可用全文的来源与范围,支持结构化证据检查。

  • 基因解析、多组学上下文、批量注释、蛋白/CDS获取与经过字节校验的 FASTA 导出;保留歧义、未解析及未注释记录。

  • 基因组目录、泛基因组、图变异、单细胞、转录组、表观组、共表达、代谢物和下载资源查询。

  • 基因家族、转录因子、miRNA、共线性、GO/KEGG富集、GWAS性状和研究查询。

  • 序列工具箱、ORF、批量序列与引物设计;CRISPR数据及现有任务状态、引物特异性服务状态查询。

  • BerryLocus 参考目录、基因定位、区间、序列与变异证据;明确参考和SNV参数后可准备预测、确认提交、查询状态及获取结果。

  • BerryPlot 绘图草稿、独立授权提交、状态查询和图件/数据下载;下载前校验SHA-256,提供15分钟本机链接。

  • 24 KB以内的绘图JSON直接提供内容预览,避免抓取环回下载地址。

  • 程序计算基因组半开区间长度、代谢物原始名称分组计数和参考目录统计,保留来源摘要与目录范围。

  • 会话隔离、确认凭据隐藏、重复任务限制和不明确网络结果不自动重试;支持草莓专用 researchOnly 工具范围设置。

本次验证:52项自动测试通过,并直接使用桌面客户端随附的运行时验证37项工具注册、当前目录导出、文件沙箱、附件事件和下载字节一致性。线上目录、基因解析、注释、序列和文献接口通过连通测试。

此前验收:真实DSH页面已完成目录与定位查询、2313 bp区间长度核对、绘图授权提交、JSON预览和下载校验。完整目录与1.53 MB代谢物矩阵已完成真实下载校验。已有 SNV 验收用例通过新的授权路径完成确认与结果读取(复用计算缓存,未重跑模型推理);引物特异性服务和历史预测缓存未启用。

任务取消、改图、跨重启恢复,以及BLAST和CRISPR新任务提交暂不在本插件的执行范围。数据和文献遵循各自来源的许可。

安装

桌面客户端:在「插件」中添加 dsh-strawberry-data-hub@0.1.0-beta.9,安装后启用。已验证 DSH 0.2.1-rc.5。

命令行:dsh plugin --profile strawberry add dsh-strawberry-data-hub@0.1.0-beta.9。升级后重启 DSH。

Beta 1

Beta 1 Pre-release
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@798645706 798645706 released this 28 Sep 08:25

首发版本:文献检索、基因解析、多组学上下文、资源目录、FASTA导出和结构化证据检查。

完整升级版请使用 Beta 2。

首发安装包:dsh-strawberry-data-hub@0.1.0-beta.1。