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GenePad v0.6.9
本次更新的两大主角是引物结合分析与分子克隆模拟：引物结合位点检测更准、Tm 计算改用标准热力学模型，并新增简并引物支持；分子克隆改为按片段逐步处理，组装结果一图看懂。同时 Linux 下的编辑与滚动性能大幅改进，序列比对视图与色谱交互更强，还带来了文件分享等新功能。
✨ 新功能
引物结合分析（全面升级）
- 结合位点检测更准：插入与凸环不再被"一刀切"过度惩罚，位点按「退火碱基数优先、再比分数」排序，更容易找到真正的最佳结合位点
- Tm 计算采用 SantaLucia 1998 最近邻热力学模型：凸环、错配、简并碱基均参与计算，独立引物与结合位点使用同一套算法
- 新增简并引物支持：NNK 等含简并码的引物可直接分析
- 引物跨模板缺失结合时按缺口对齐双臂，以三段结构清晰显示
- 调参更直接：取消 strict/standard/relaxed 三档预设，参数在引物对话框内即时调整、全局生效，模板变更自动重算
- 显示更清楚：相邻结果气泡自动合并、跨行引物补显名称、酶表新增切点数一列
分子克隆模拟（重构）
- 与「构建质粒」解耦：默认 1 个片段按需添加，每个片段一条处理链（限制性酶切 / PCR / 载体自连），每步生成可见的中间产物；修改上游参数自动清掉受影响的下游产物
- 酶切步骤选齐酶即自动酶切，产物区间即时高亮并回标到原始序列（支持跨起点环绕）；酶列表跟随左侧图谱的酶池筛选
- PCR 引物单条输入即可，自动区分 3′ 退火区与 5′ 延伸；引物成形后实时显示在图谱与序列视图
- 两端接头相同的片段正反皆可连时，自动列出全部取向产物（按序列去重），产物页直接切换预览与导出
- 组装示意图重画：载体开口骨架、黏性末端榫卯咬合、失败连接留空隙凸起，成败一目了然
- 图谱 / 序列视图与打开质粒完全一致，支持上下分栏比例拖动与全窗口铺满
序列比对视图
- 比对区色谱图支持框选：选中一段色谱即选中对应参考序列区段并锁定条目；色谱条目色球改为高度拖杆，拖动即缩放峰幅（1/3–3×，双击复位）
- 峰高显示更合理：常规峰接近满高，个别超强峰只裁平顶部，不再压矮整段
- 匹配 / 错配配色更易读；比对标签锚定到比对起点，圆形图下半圈文字保持正立
- 导入比对序列后自动跳转到第一个比对区，无需手动点击
文件与系统集成
- 工具栏新增分享按钮：把已保存的文件直接交给系统分享面板（Windows / macOS / Android），双端 FASTQ 会把 R1/R2 一起分享
- 设置新增「关于本程序」页（使用条款 + 隐私策略）；另存为菜单按「推荐 / 其它」分组重组
- 新增匿名使用统计：仅含安装标识与使用时长，每 7 天上报一次，可随时在设置中关闭；官网新增实时数据页展示系统分布
- AI 翻译语言文件更稳：分段进行、失败自动重试、中断后可从断点继续
- FASTQ 视图左下角补设置按钮；图谱双击酶切位点直接打开限制酶信息
FASTQ（NGS）
- R1/R2 配对记忆跨运行形态共用：文件挪位置、换盘符也能识别；多选批量配对窗口按记忆自动预填
- 序列分析报告在「带裁切锚点」口径下用颜色标出锚点区段（Top20 直方图与 Top100 表格同步显示）
- 术语统一为「读段」；分析进行中取消立即生效，不再卡住
⚡ 性能与流畅度
- Linux 更顺滑：大型比对不再冻结窗口，序列视图滚动更快，启动更快
- 编辑更跟手：1Mb 级大序列的编辑不再卡顿，撤销 / 重做更轻快
- .gen 文件不再随编辑无限膨胀（自动精简编辑历史）
- 质粒库放在网络盘时，扫描明显提速
🐛 修复
- 修复 Linux「打开方式」列表不显示 GenePad、.gen 文件被系统识别为世嘉 ROM 的问题
- 修复分子克隆 / 电泳工具窗口跨窗口传参丢失
- 修复图谱 Ctrl 两点配对选区不生效、滚轮缩放时外层容器跟着滚动的问题
- 修复单行模式平滑跳转偶发被打断的问题
- 右键菜单点空白处可靠关闭，二级子菜单纵向避让不再截断
- FASTQ 配对询问框取消后不再残留窗口占位