GenePad v0.7.9

GenePad v0.7.9

本次更新以小修补为主:引物 Tm(熔解温度)计算算法更新为对齐 SnapGene;另新增引物浓度设置项,并修复反向拖选时选中信息气泡位置、图谱独占时工具栏位置两个显示问题。

✨ 新功能

• 新增「设置 > 引物」页:引物寡核苷酸浓度可调(默认 0.25 µM,与 SnapGene 相同),改动即时生效并在多窗口间同步

🐛 问题修复

• 序列视图中反向拖选(光标落在选区起始端)时,选中信息气泡现在贴选区上侧跟随光标端,不再固定显示在底部
• 图谱独占显示(序列视图隐藏)时,底部悬浮工具栏贴左下角,不再悬在画面中央

GenePad v0.7.8

GenePad v0.7.8

本次更新带来两大新能力:局域网去中心团队(无需服务器,同一局域网内即可组建团队、共享基因文件库)与基因文件库设置改版(双击可映射用外部程序打开);安卓安装包大幅瘦身(24.7MB → 17.8MB);序列比对全面优化:泳道更紧凑、支持勾选框多选、新增空白泳道快速跳转、图谱与列表联动更顺畅。另修复安卓启动报错、错误弹窗显示 [object Object] 等一批问题。

✨ 新功能

团队协作

• 全新「局域网网络」模式:无需中心服务器,同一局域网内即可创建/加入团队(开放网络自动扫描发现;隐藏网络或跨网段可手动输入网络凭据或 IP 直连)
• 成员的基因文件列表自动同步,文件索取直达持有者、投递定向直传,文件本体始终只在自己电脑上
• 双击成员条目即可发起索取;与原有「中心服务器(企业管理)」模式并存,任一时刻二选一
• 共享基因列表默认开启:对方只能看到列表,具体文件需向你索取

基因文件库

• 库窗口设置弹窗改版为三页签:AI 标签 / 团队管理 / 双击打开方式
• 双击打开方式支持按扩展名映射外部程序(如双击 .dna 直接用 SnapGene 打开),右键「打开」同步跟随,并新增「用本程序打开」;支持一键恢复全部默认
• 用第三方程序打开时显示进行中提示,失败给出明确错误弹窗

序列比对

• 比对条目列表改版:每行行首勾选框多选,配套全选 / 取消选择 / 隐藏显示 / 移除所选工具栏,支持 Delete / Ctrl+A / Esc 快捷键(全选按鼠标焦点只作用于上或下部分,再按一次整体取消)
• 泳道大幅压缩:无色谱的泳道只占一行高度,列表行只保留名称(bp / 一致度等详情移入悬停提示)
• 空白泳道新增快速跳转按钮:←/→ 跳到本泳道最近命中,↑/↓ 跳到最近有内容的泳道并居中
• 图谱比对条与列表双向联动:悬浮 / 选中金色描边,点击图谱比对条直接跳转并聚焦泳道
• 点击比对名称跳转时,目标泳道/色谱自动纵向滚入视口
• 核酸搜索无命中时,可确认后一键转为序列比对(以搜索序列新建比对条目并进入比对模式)
• 隐藏比对条目时列表不再整体跳动;隐藏区文字改回正常颜色、上下区分隔线加深加粗

交互与快捷键

• 引入「焦点」概念:Delete、Ctrl+A 等快捷键按鼠标上一步点击的位置分流——点引物删引物、点泳道全选该泳道、点列表全选该列表,不再误触

安卓

• 安卓版大幅瘦身:团队、AI 助手、分子克隆、电泳等不再进入安卓包(安卓聚焦浏览),安装包从 24.7MB 降到 17.8MB(-28%),浏览、酶切检测、序列查看等功能不变

🐛 问题修复

• 安卓启动不再弹出「Plugin window not initialized」错误
• 错误弹窗不再显示 [object Object],对象类错误完整展示并可复制详情
• 勾选比对条目时列表不再下坠一帧再归位
• 修复全局 toast 气泡变透明的问题;AI 设置打开时不再先闪「未配置任何 AI」黄条
• 修复局域网团队「member not found」、侧栏团队共享计数为 0 等问题
• 比对泳道与面板列表滚动联动更流畅,滚动中悬浮高亮不再引发卡顿

GenePad v0.7.7

GenePad v0.7.7

本次更新以比对与图谱的大版本打磨为主：序列搜索新增全部匹配浅蓝高亮、环形图谱轴环双风格可切换、外圈标签排布全新定版（引导线防交叉）、AB1 比对头尾低质量插入段自动折叠、比对条目支持多选批量移除；新增 Ctrl+S 保存快捷键，另存为后文档原地改挂新文件；编辑历史统一按「层」计数并新增自动历史上限。另修复比对后跳转卡顿、快滚跳动等一批问题。

✨ 新功能

序列视图与搜索

• 序列搜索新增「全部匹配」浅蓝高亮：所有命中一目了然，首中自动优先落在当前视口
• 单行模式快滚纵向跳动根治，轨道顺序调整（feature 块→反向引物），相邻 feature 端点相接不再误避让

序列比对

• AB1 读段头尾低质量插入段默认折叠（≤100bp），色谱上以小圆点按钮展开/收起
• 比对条目支持 Ctrl/Cmd+点击多选批量移除（Del 删除、Esc 清空）
• 比对面板条目名称悬停跑马灯滚动 + 全名 tooltip
• SnapGene「等待区」（use="0"）比对条目读入即隐藏，且在 .gen/.gjson/.dna 间往返保留；进入比对模式自动跳到首个可见比对区
• 环形参考跨起点读段正确回绕缝合，读段头尾宽容缝合不再整段误标为插入
• 比对保存到 .dna 所见即所得：多命中合并 BAM、反向链软截断纠正
• 比对泳道体验：快速滚动时泳道/色谱不再降档、选区浮层不再遮挡错配/插入/缺失三色块、缺失占位改浅红、多读段泳道只画自己的数据、色谱上拖选直接得到序列选区

图谱

• 图谱风格双布局：设置>外观可切换「轴环外圈」（新缺省，feature 环更宽松）与「轴环内嵌」（经典）
• 外圈标签排布全新定版：标签更密集，不再有标签偶发被丢到远距离空间的情况。
• feature 弧内放不下文本时先向相邻内圈泳道探寻放置，无空间才落外圈标签
• feature 环数上限 4 环（超出由 Layers 计数标提示），比对轨道全面重排与标签重设计，比对模式自动收纳图谱底部显示开关
• 图谱顶部质粒名称按钮移除（名称看窗体标题/属性面板），圆形视图按纵向带域整体居中

保存与另存为

• 新增 Ctrl+S / Cmd+S 保存快捷键
• 另存为成功后文档原地改挂新文件：路径/格式/标题全套重指向，后续保存直写新路径（与 Office/SnapGene 同款，不再弹「打开新文件」）

编辑历史

• 新增历史按层裁切与「自动历史上限」：拨杆开启后每次编辑自动按层裁切，保存/另存为超限静默处理不弹窗，层数默认 20
• 提示、红字建议、裁切阈值与自动上限统一按「层」计数，与裁切对话框实时预览同一口径
• 打开历史/保存前历史过大时给出「不再询问/忽略/现在处理」选择

🐛 问题修复

• 比对后平滑跳转「动一帧即卡」双根因修复（滚动回声守卫 + 分屏同步回写让位），跳转恢复平滑到位
• 分割面板拖到阈值自动隐藏后重显，恢复宽度不再过窄（按面板组实测宽度折算下限）
• 保存/另存为「正在保存」阻塞窗先于「历史过大」询问框弹出，惰性物化历史期间不再出现无遮罩的可编辑窗口
• AB1 比对插入区散碎匹配修复（全长带状 DP 装配式打分）
• 泳道虚线外框跨大删除区连续、幻影折叠点根治、短缺失段不再显示跳转钮
• 比对单行分屏 gap 模式 feature 跳泳道根治；多行跳转按显示列换算行号

GenePad v0.7.6

GenePad v0.7.6

本次更新以序列视图与图谱的交互打磨为主：序列视图全新密度布局、选中信息气泡贴选区边缘随内容滚动、分割面板拖动全程零卡顿、比对分屏快速滚动不再白屏、feature 高亮改用与图谱一致的金色描边。AI 语言文件翻译对乱码改为容忍重试策略，Linux 根治窗口圆角黑框并把桌面入口与基因文件库归入同一分类。

✨ 新功能

序列视图

• 全新密度与可读性布局：碱基格宽 14→12px（同宽视口多容约 17% 碱基）、阅读框氨基酸字母按密码子居中对准、酶切位点轨道移到行顶、视口边缘不再错层堆叠
• 选中信息气泡：紧贴选区端点可视格上下边缘显示，随序列内容原生滚动（比对插入列也正确映射行列）
• 分段 feature 段间跳转：多行标注行内 <> 跳转钮、恰一块行在名称两侧拆分双钮，悬浮该 feature 才淡入
• 标注表头部新增「在序列视图中显示标注」拨杆，行首眼睛按钮逐条显隐，图谱/序列同步生效
• 序列块 / 比对面板滚轮方向各自可切：分屏左上角按钮一键换向，全局记忆
• 快速滚动降保真分两档：中速滚动保留刻度与装饰，只有甩动才切纯骨架

图谱

• 引物带收窄至泳道约一半（24px→12px），正向引物弧在带内居中，feature 环更宽松
• 「显示标注名称」按钮红色计数标语义修正：只统计名称放不进色块/弧内、需外部标签指示的 feature
• 环形图谱标签排布与骨架半径恢复 v0.7.2 计算（0.7.5 周期的实验布局回退）

AI 助手

• 语言文件 AI 翻译乱码容忍策略：流式检出乱码即时中止并自动重试（预算内），末次接受并在结果中提醒导出后人工校对
• 日语翻译规则补充「取り消し/出来る」等汉字表记示例，减少假名占位
• 用量统计只保留最近 7 天，「每日用量」改称「最近用量」
• 语言选择器摊平为点击列表，已导入语言行内垃圾桶直接删除

新手引导

• 新增「比对分屏滚轮方向按钮」引导步骤

🐛 问题修复

• 右键菜单「粘贴」静默失效：WebView 无剪贴板读权限，新增 clipboard-manager 插件读取链路并兜底
• 分割面板拖到阈值自动隐藏后点「显示」闪现即隐 / 出现一下又藏起来：隐藏与重显恢复链路整体重构
• 序列 / AI 面板重显恢复竞态：恢复标记改渲染期预武装，重放先于恢复逻辑
• 比对命中区间 <> 跳转钮点击后滚动跳变：改视口相对 sticky 定位
• 悬浮 tooltip 泄漏：氨基酸/酶/feature/引物悬浮部件 mouseleave 丢失自愈补齐；酶名/正向引物 tooltip 翻到鼠标右上不再遮挡序列
• 快滚时刻度间隙闪烁、减速后装饰立刻恢复
• feature 高亮与同色填充不可辨：改金色描边（悬浮细边/点选粗边）+ 白晕衬底
• 比对单行分屏按钮避让 overview、视口方块精确贴合
• Linux：窗口圆角黑框根治（html/body 同透明 + WebKitGTK 走 X11 并禁用 DMABUF 渲染器）
• Linux：主程序桌面入口分类与基因文件库统一（Science;Biology;Education），不再落未分类组
• 文本右键菜单视口边缘避让，贴右缘/下缘自动翻面并钳回视口内

⚡ 性能

• 分割条拖动冻结重绘：拖动期零主线程工作（信号化起止零 React 重渲染），松手一次性按最终几何重绘
• 比对分屏滚动零白屏：绝对坐标色谱 chunk 滚动零重挂、同步绘制位图缓存、比对内容不降档
• 序列显隐单次重绘（陈旧几何闸门+尺寸量化）；点击/起拖/取消选区不再全量重建行；拖选帧按行级签名复用行元素缓存
• Linux 滚动性能平台缩放：降保真阈值前移、渲染桶加大、overscan 放长
• 环形图谱松手重绘长阻塞优化：标签横轴搜索粗扫+局部精修，45-65ms→11ms

GenePad v0.7.5

GenePad v0.7.5

本次更新以性能与比对视图体验为主：基因文件库大库快速滚动不再白屏、冷启动更快，AI 多轮对话 token 消耗显著降低；分屏色谱图支持手型平移，并修复多处选区问题。此外安装包体积进一步缩小，崩溃提示界面可展开技术详情，方便问题反馈。

⚡ 性能 / 体积

• 基因文件库大库：快速滚动不再白屏、文本不再空白（行减重、滚动状态下沉、速度自适应预渲染），冷启动更快
• AI 助手会话前缀缓存：多轮对话命中缓存，token 消耗显著降低
• 安装包体积进一步缩小：Windows 9.5 → 8.4 MB、Linux 12.6 → 10.7 MB、macOS 11.8 → 10.6 MB、Android 24.8 → 24.5 MB；计算引擎（限制酶 / 通用元件检测 / FASTQ 流式解析）维持全速编译，其余代码按体积优化

✨ 新功能

比对视图

• 单行分屏色谱图禁用拖选，改为手型光标各向平移（悬停虚线与数值提示保留）
• 滚轮分流：上块（读段区）横向滚动，下块恢复纵向滚动
• 泳道内单击 / 微动空白处即清空全部选区
• 参考行标签加大居中显示（Original / 原序列）

AI 助手

• 统计弹层新增「缓存命中率」与「当前对话」用量区块

FASTQ（NGS）

• 打开双端文件时若上次配对校验仍有效，直接复用不再弹选择框；校验不过会当场弹框改选

界面

• 长文本（最近打开的文件名 / 路径等）滚动改为无缝循环跑马灯，不再到头弹跳
• 异常 / 崩溃提示界面新增「技术详情」折叠区：展开可见完整错误堆栈与版本号，反馈问题时截图该区域可大幅加快定位
• 提示与错误文案补全中英双语

🐛 问题修复

• 比对：读段插入段（如 INDEL）不再被静默丢弃，全覆盖连续显示
• 比对：插入块内起止的拖拽选区不再偏移
• 比对：泳道选区不再整条全亮，纯插入选区松开后保持选中且可复制
• 比对：纯插入选区不再把锚碱基高亮到参考行（拖拽过程中也不亮）
• 比对：粘滞标签浮层不再盖住横向滚动条与分割拖杆

GenePad v0.7.4

GenePad v0.7.4

本次更新以性能与比对视图体验为主：基因文件库大库快速滚动不再白屏、冷启动更快，AI 多轮对话 token 消耗显著降低；分屏色谱图支持手型平移，并修复多处选区问题。

⚡ 性能优化

• 基因文件库大库：快速滚动不再白屏、文本不再空白（行减重、滚动状态下沉、速度自适应预渲染），冷启动更快
• AI 助手会话前缀缓存：多轮对话命中缓存，token 消耗显著降低

✨ 新功能

比对视图

• 单行分屏色谱图禁用拖选，改为手型光标各向平移（悬停虚线与数值提示保留）
• 滚轮分流：上块（读段区）横向滚动，下块恢复纵向滚动
• 泳道内单击/微动空白处即清空全部选区
• 参考行标签加大居中显示（Original / 原序列）

AI 助手

• 统计弹层新增「缓存命中率」与「当前对话」用量区块

FASTQ（NGS）

• 打开双端文件时若上次配对校验仍有效，直接复用不再弹选择框；校验不过会当场弹框改选

界面

• 长文本（最近打开的文件名/路径等）滚动改为无缝循环跑马灯，不再到头弹跳

🐛 问题修复

• 比对：读段插入段（如 INDEL）不再被静默丢弃，全覆盖连续显示
• 比对：插入块内起止的拖拽选区不再偏移
• 比对：泳道选区不再整条全亮，纯插入选区松开后保持选中且可复制
• 比对：纯插入选区不再把锚碱基高亮到参考行（拖拽过程中也不亮）
• 比对：粘滞标签浮层不再盖住横向滚动条与分割拖杆

GenePad v0.7.3

GenePad v0.7.3

本次更新以 AI 助手与保存、更新链路为主：新增文档内嵌 AI 面板，保存时显示「正在保存」并能识别文件占用进程，修复 Windows 应用内更新失败；另有多项比对、FASTQ 与编辑历史的改进和修复。

✨ 新功能

AI 助手

• 新增文档内嵌 AI 面板：打开文档后点「AI 工具」，在当前窗口右侧直接展开对话，支持调节宽度、与属性/比对/历史面板互斥、一键「打开为新窗口」接续同段对话
• 「思考」开关移至面板标题旁，输入区新增「新对话」按钮
• 会话记忆按文档隔离，切换文档不再看到上一个文档的对话；面板标题实时跟随会话重命名
• 消息右键「复制」只复制所选文本

编辑历史

• 历史树方向可切换：缺省最新在下并自动滚到底部，可切回经典左上布局
• 可见节点超 200 自动折叠更旧层级，总节点超 50 红字建议裁切
• 卡片常驻展开/收起提示；分支裁切按钮改为红色垃圾桶图标

保存

• 保存/另存为立即显示「正在保存」提示；文件被其他程序占用时识别占用进程，可直接重试或另存

FASTQ（NGS）

• 超长读段图形视图行尾可「再显示10% / 完全显示」，按需逐次放开
• 打开询问框按钮收为一行

线性图谱

• 测序轨道移到轴与 feature 之间，标签移到条上方不再重叠

⚡ 性能

• 打开带编辑历史的 .dna / .gen 文件显著提速（历史数据按需读取）

🐛 问题修复

• 修复 Windows 应用内更新失败的问题（更新包压缩方式不被存量客户端识别）
• 修复 ONT 超长读段质量柱显示为裂图
• 修复比对多项问题：插入列改紫色且选区精确到插入格、接缝重叠分段丢失、BLAST 分段不按原序列顺序
• 修复历史面板关闭后切回同屏报错
• 修复色谱偶发尖峰顶出画布
• 修复 Ctrl+R 无选区时无法唤起添加引物
• 修复 AI 内嵌面板布局溢出、跨文档会话串记忆、标题不同步等
• 修复 MCP 界面工具请求双执行
• .gen 临时工作副本治理，崩溃恢复更可靠

GenePad v0.7.2

GenePad v0.7.2

本次发布包含自 v0.7.1 以来的 69 项提交，核心是新增编辑历史功能：序列的每一次编辑都会记录为快照，可随时回看历史、裁切分支，并把任意历史时点完整还原成一个新文档；同时支持查看 SnapGene 文件自带的编辑历史。此外还有限制酶「添加酶到列表」与无切点查看、更新日志 AI 翻译、互斥切换零卡顿等改进，并修复了 FASTQ 打开转圈等多个问题。

✨ 新功能

编辑历史

• 每次插入、删除、替换、反转互补、拓扑切换都会记录为历史快照，侧栏「历史」按钮随时查看；历史随 .dna / .gen 文件保存
• 支持查看 SnapGene 文件自带的编辑历史树
• 树形布局：点击节点展开/收起，连线标注每一步编辑的处理方式与所用的酶、引物
• 每个节点自带迷你图谱缩略图；点击即可把该时点还原成完整文档（序列、拓扑、名称、描述、元件标注、引物、底色、链数），还原文件按原始格式路由（.gb 节点还原成真正的 GenBank 文件、.gen 还原成 GenePad 数据库），还原的 .dna 文件 SnapGene 也能直接打开
• 支持分支裁切（移除某次编辑及其全部输入的历史）与一键清空；历史树可导出 PNG / SVG 图片

限制酶

• 侧栏「酶切位点设置」与限制酶表底部新增「添加酶到列表」：搜索全部酶库，一键把酶加入当前酶池，支持直接定位到序列位置
• 限制酶表新增「有切点 / 无切点」切换：一眼查看当前池里哪些酶不切这条序列
• 添加 / 定位酶时，图谱与序列视图同步定位

分子克隆模拟

• 酶切步骤选定酶即自动酶切，酶槽自动追加，无需再点「增加限制酶」
• 组装产物起点改为以原始载体文件的 1 号碱基为基准
• 步骤选中的酶 / 引物在图谱上以紫色徽章标记，与金色选中、琥珀色悬浮清晰区分

更新与安装

• 更新弹窗的更新说明可由 AI 助手翻译成当前界面语言（需在设置中配置 AI）
• Windows 安装器新增文件关联勾选页：安装完成前可自由勾选要关联的文件类型

序列视图

• 无方向元件在分行交接处同样显示锯齿边，分段元件的分行衔接更连贯
• 元件悬停信息文案统一（类型 / 范围 / 方向），分段元件直接显示分段名

FASTQ（NGS）

• 序列分析结果改用 NGS 惯用表述（扫描读段对 / 通过筛选 / 唯一序列）

⚡ 性能

• 图谱 ↔ 序列互斥切换零卡顿：面板保活不重挂载，大酶池下切换不再重绘等待
• 带较多编辑历史的 .dna 文件打开显著提速（历史数据体积减半以上）

🐛 问题修复

• 修复图谱 / 序列单视图（胶囊）模式下，鼠标悬停侧边按钮栏显示左右拖动光标的问题
• 修复 FASTQ 文件打开永久转圈的多种情况（单文件打开、双击 / 多开、拖入）
• 修复 SnapGene 文件 Notes 描述读取与自定义酶集判定的三处格式偏差
• 修复分子克隆图谱步骤中酶过多时，选中酶标记消失的问题
• 修复部分工具窗口图标不显示的问题

GenePad v0.7.1

本次更新的主要变化是新增应用内自动更新：自本版本起，Windows / macOS / Linux 的后续升级可直接在应用内完成，无需再手动下载安装包；更新前会提示保存未保存的文档，更新包经数字签名校验。同时新增多标签页模式、新手教程与蛋白 / RNA 序列支持。

✨ 新功能

应用内更新

• 自本版本起，可在应用内完成「检查更新 → 下载 → 安装 → 重启」，无需手动下载安装包
• 更新前若有未保存的文档，会先提示保存；下载进度实时显示
• 更新包经数字签名校验

多标签页

• 单窗口多文档标签页，切换无需重新加载；点「+」可新开欢迎页
• 多标签与单文档模式可切换，切换在关闭全部文档后生效（Android 始终为标签页）

新手教程

• 首次打开质粒时分步导览：高亮指示当前位置，逐步介绍各功能区，可跳过或稍后再学
• 基因文件库窗口亦有专属教程；设置 → 外观 可重置教程

蛋白与 RNA 序列

• 支持直接打开蛋白（SnapGene .prot、蛋白 FASTA）与 RNA（.rna）文件，支持查看、翻译与搜索
• 另存为按分子类型给出对应格式
• 打开含多条序列的 FASTA / GenBank 文件时，可选择拆分打开或只打开第一条

其它新功能

• CRISPR sgRNA 可标注到图谱，「Target N」分段显示结合区与 PAM
• 快捷键可自定义（设置 → 快捷键）
• 复制选区时，选区内的元件标注与引物一并复制，粘贴后原样落位
• 支持 SnapGene 比对文件读写（含色谱），比对条目可导出 FASTA / AB1
• 基因文件库支持 Ctrl / Shift 多选与批量打开 / 分享 / 移出
• 酶表价格改按「单次反应」计价，新增「低价酶」分组（≤¥20 / 反应）
• F5 / Ctrl+R 不再刷新界面、丢失工作状态
• 默认图谱 + 序列同屏显示，可切换为单视图

⚡ 性能与流畅度

• 大序列（>50kb）的酶切位点标记不再卡顿
• FASTQ 快速滚动更流畅

🐛 问题修复

• Windows 任务栏窗口显示各自打开的文件名
• 修复环形图跨起点选区删除 / 替换出错、拖选方向异常的问题
• 修复「隐藏 ORF」不立即生效的问题
• 修复图谱底部酶池 / 筛选下拉显示异常的问题
• 恢复 Android 发布（上一版因打包问题缺席）

完整变更：Masterchiefm/GenePad@v0.6.9...v0.7.1

GenePad v0.6.9

本次更新的两大主角是引物结合分析与分子克隆模拟：引物结合位点检测更准、Tm 计算改用标准热力学模型，并新增简并引物支持；分子克隆改为按片段逐步处理，组装结果一图看懂。同时 Linux 下的编辑与滚动性能大幅改进，序列比对视图与色谱交互更强，还带来了文件分享等新功能。

✨ 新功能

引物结合分析（全面升级）

• 结合位点检测更准：插入与凸环不再被"一刀切"过度惩罚，位点按「退火碱基数优先、再比分数」排序，更容易找到真正的最佳结合位点
• Tm 计算采用 SantaLucia 1998 最近邻热力学模型：凸环、错配、简并碱基均参与计算，独立引物与结合位点使用同一套算法
• 新增简并引物支持：NNK 等含简并码的引物可直接分析
• 引物跨模板缺失结合时按缺口对齐双臂，以三段结构清晰显示
• 调参更直接：取消 strict/standard/relaxed 三档预设，参数在引物对话框内即时调整、全局生效，模板变更自动重算
• 显示更清楚：相邻结果气泡自动合并、跨行引物补显名称、酶表新增切点数一列

分子克隆模拟（重构）

• 与「构建质粒」解耦：默认 1 个片段按需添加，每个片段一条处理链（限制性酶切 / PCR / 载体自连），每步生成可见的中间产物；修改上游参数自动清掉受影响的下游产物
• 酶切步骤选齐酶即自动酶切，产物区间即时高亮并回标到原始序列（支持跨起点环绕）；酶列表跟随左侧图谱的酶池筛选
• PCR 引物单条输入即可，自动区分 3′ 退火区与 5′ 延伸；引物成形后实时显示在图谱与序列视图
• 两端接头相同的片段正反皆可连时，自动列出全部取向产物（按序列去重），产物页直接切换预览与导出
• 组装示意图重画：载体开口骨架、黏性末端榫卯咬合、失败连接留空隙凸起，成败一目了然
• 图谱 / 序列视图与打开质粒完全一致，支持上下分栏比例拖动与全窗口铺满

序列比对视图

• 比对区色谱图支持框选：选中一段色谱即选中对应参考序列区段并锁定条目；色谱条目色球改为高度拖杆，拖动即缩放峰幅（1/3–3×，双击复位）
• 峰高显示更合理：常规峰接近满高，个别超强峰只裁平顶部，不再压矮整段
• 匹配 / 错配配色更易读；比对标签锚定到比对起点，圆形图下半圈文字保持正立
• 导入比对序列后自动跳转到第一个比对区，无需手动点击

文件与系统集成

• 工具栏新增分享按钮：把已保存的文件直接交给系统分享面板（Windows / macOS / Android），双端 FASTQ 会把 R1/R2 一起分享
• 设置新增「关于本程序」页（使用条款 + 隐私策略）；另存为菜单按「推荐 / 其它」分组重组
• 新增匿名使用统计：仅含安装标识与使用时长，每 7 天上报一次，可随时在设置中关闭；官网新增实时数据页展示系统分布
• AI 翻译语言文件更稳：分段进行、失败自动重试、中断后可从断点继续
• FASTQ 视图左下角补设置按钮；图谱双击酶切位点直接打开限制酶信息

FASTQ（NGS）

• R1/R2 配对记忆跨运行形态共用：文件挪位置、换盘符也能识别；多选批量配对窗口按记忆自动预填
• 序列分析报告在「带裁切锚点」口径下用颜色标出锚点区段（Top20 直方图与 Top100 表格同步显示）
• 术语统一为「读段」；分析进行中取消立即生效，不再卡住

⚡ 性能与流畅度

• Linux 更顺滑：大型比对不再冻结窗口，序列视图滚动更快，启动更快
• 编辑更跟手：1Mb 级大序列的编辑不再卡顿，撤销 / 重做更轻快
• .gen 文件不再随编辑无限膨胀（自动精简编辑历史）
• 质粒库放在网络盘时，扫描明显提速

🐛 修复

• 修复 Linux「打开方式」列表不显示 GenePad、.gen 文件被系统识别为世嘉 ROM 的问题
• 修复分子克隆 / 电泳工具窗口跨窗口传参丢失
• 修复图谱 Ctrl 两点配对选区不生效、滚轮缩放时外层容器跟着滚动的问题
• 修复单行模式平滑跳转偶发被打断的问题
• 右键菜单点空白处可靠关闭，二级子菜单纵向避让不再截断
• FASTQ 配对询问框取消后不再残留窗口占位

完整变更：Masterchiefm/GenePad@v0.6.8...v0.6.9