GenePad v0.7.7

GenePad v0.7.7

本次更新以比对与图谱的大版本打磨为主：序列搜索新增全部匹配浅蓝高亮、环形图谱轴环双风格可切换、外圈标签排布全新定版（引导线防交叉）、AB1 比对头尾低质量插入段自动折叠、比对条目支持多选批量移除；新增 Ctrl+S 保存快捷键，另存为后文档原地改挂新文件；编辑历史统一按「层」计数并新增自动历史上限。另修复比对后跳转卡顿、快滚跳动等一批问题。

✨ 新功能

序列视图与搜索

• 序列搜索新增「全部匹配」浅蓝高亮：所有命中一目了然，首中自动优先落在当前视口
• 单行模式快滚纵向跳动根治，轨道顺序调整（feature 块→反向引物），相邻 feature 端点相接不再误避让

序列比对

• AB1 读段头尾低质量插入段默认折叠（≤100bp），色谱上以小圆点按钮展开/收起
• 比对条目支持 Ctrl/Cmd+点击多选批量移除（Del 删除、Esc 清空）
• 比对面板条目名称悬停跑马灯滚动 + 全名 tooltip
• SnapGene「等待区」（use="0"）比对条目读入即隐藏，且在 .gen/.gjson/.dna 间往返保留；进入比对模式自动跳到首个可见比对区
• 环形参考跨起点读段正确回绕缝合，读段头尾宽容缝合不再整段误标为插入
• 比对保存到 .dna 所见即所得：多命中合并 BAM、反向链软截断纠正
• 比对泳道体验：快速滚动时泳道/色谱不再降档、选区浮层不再遮挡错配/插入/缺失三色块、缺失占位改浅红、多读段泳道只画自己的数据、色谱上拖选直接得到序列选区

图谱

• 图谱风格双布局：设置>外观可切换「轴环外圈」（新缺省，feature 环更宽松）与「轴环内嵌」（经典）
• 外圈标签排布全新定版：标签更密集，不再有标签偶发被丢到远距离空间的情况。
• feature 弧内放不下文本时先向相邻内圈泳道探寻放置，无空间才落外圈标签
• feature 环数上限 4 环（超出由 Layers 计数标提示），比对轨道全面重排与标签重设计，比对模式自动收纳图谱底部显示开关
• 图谱顶部质粒名称按钮移除（名称看窗体标题/属性面板），圆形视图按纵向带域整体居中

保存与另存为

• 新增 Ctrl+S / Cmd+S 保存快捷键
• 另存为成功后文档原地改挂新文件：路径/格式/标题全套重指向，后续保存直写新路径（与 Office/SnapGene 同款，不再弹「打开新文件」）

编辑历史

• 新增历史按层裁切与「自动历史上限」：拨杆开启后每次编辑自动按层裁切，保存/另存为超限静默处理不弹窗，层数默认 20
• 提示、红字建议、裁切阈值与自动上限统一按「层」计数，与裁切对话框实时预览同一口径
• 打开历史/保存前历史过大时给出「不再询问/忽略/现在处理」选择

🐛 问题修复

• 比对后平滑跳转「动一帧即卡」双根因修复（滚动回声守卫 + 分屏同步回写让位），跳转恢复平滑到位
• 分割面板拖到阈值自动隐藏后重显，恢复宽度不再过窄（按面板组实测宽度折算下限）
• 保存/另存为「正在保存」阻塞窗先于「历史过大」询问框弹出，惰性物化历史期间不再出现无遮罩的可编辑窗口
• AB1 比对插入区散碎匹配修复（全长带状 DP 装配式打分）
• 泳道虚线外框跨大删除区连续、幻影折叠点根治、短缺失段不再显示跳转钮
• 比对单行分屏 gap 模式 feature 跳泳道根治；多行跳转按显示列换算行号