비주얼 바이오 : 바이오인포를 위한 시각화와 블록체인

스터디 정보

저희 모임은 강의식이 아닌 자신이 스스로 공부한 내용을 여러 사람과 공유하는 스터디 방식이며, 스스로 공부하고자 하는 열정을 꼭 준비물로 가지고 와 주시고, 열심히 발표를 해주시면 더욱 감사합니다.

후원사

KossLab : http://devlab.oss.kr/

공유폴더

https://drive.google.com/drive/u/0/folders/1FPPqaFBh4paxMyAWr3hk9f6Hktw3HX1j

교재 정보

1. 시각화

   • R-shiny : https://github.com/cardiomoon/shinyLecture2
   • Vue.js : https://kr.vuejs.org/v2/guide/
   • D3.js : Interactive Data Visualization for the Web : http://shop.oreilly.com/product/0636920026938.do

2. CT 이미지 분석

• http://nonmeyet.tistory.com/category/데이터분석
  - 타이타닉 생존자 예측모형 만들기 - 집값 예측 모형 만들기 - 공공 자전거 수요 예측 모형 만들기
• 캐글 - https://www.kaggle.com/kmader/siim-medical-images - https://www.kaggle.com/kmader/finding-lungs-in-ct-data
• https://www.nih.gov/news-events/news-releases/nih-clinical-center-releases-dataset-32000-ct-images

3. 블록체인 기술을 활용한 헬스케어데이터 공유 플랫폼 개발

• 인공지능을 위한 선형대수(주재걸 교수님) : http://www.edwith.org/linearalgebra4ai
• 처음 배우는 블록체인 : http://www.hanbit.co.kr/store/books/look.php?p_code=B8083970938

4. 참고자료

• https://github.com/bitcoinbook/bitcoinbook/blob/develop/README.md
• http://solidity.readthedocs.io/en/v0.4.24/
• https://book.naver.com/bookdb/book_detail.nhn?bid=13496085

차후 스터디

• 스터디원의 의견을 받아서 정리

장소

1. 장소: 토즈 신촌 본점 ( http://www.toz.co.kr/branch/main/index.htm?id=5 )
2. 매주 금요일, 저녁 7시 30분~10시
3. 시작: 2018년 10월 5일

이전 스터디 자료

• 딥메니아 : https://github.com/biospin/deep_menia
• 바이오케라스 : https://github.com/biospin/biokeras
• 클라우드 바이오 : https://github.com/biospin/cloudnomad_bio
• 모두의 바이오 : https://github.com/biospin/all_bio
• 알바이오플러스 : https://github.com/biospin/R_Bio_Plus
• 알바이오 : https://github.com/biospin/R_Bio
• 빅바이오 : https://github.com/biospin/BigBio
• 딥바이오 : https://github.com/biospin/DeepBio

Part 1.

seq.	날짜	내용
1	2018.10.05	(시각화) shiny1.pdf : R과 Shiny를 이용한 Web Application 제작(I)
		(캐글 & 이미지 분석 ) 타이타닉 생존자 예측모형 만들기
		(블록체인) 인공지능을 위한 선형대수 - 4장 : 고유벡터와 고유값 / 영공간과 직교여공간
2	2018.10.12	(시각화) shiny2.pdf : R과 Shiny를 이용한 Web Application 제작 (I)(II)
		(캐글 & 이미지 분석 ) 집값 예측 모형 만들기
		(블록체인) 인공지능을 위한 선형대수 - 4장 : 특성방정식 / 대각화 / 고유값 분해와 선형변환
3	2018.10.19	(시각화) Shiny3.pdf : RStudio addin 제작
		(캐글 & 이미지 분석 ) 공공 자전거 수요 예측 모형 만들기
		(블록체인) 인공지능을 위한 선형대수 - 4장 : 나머지 모두
4	2018.10.26	(시각화) Shiny4.pdf : Shiny module
		(캐글 & 이미지 분석 ) https://www.kaggle.com/kmader/siim-medical-images
		(블록체인) 인공지능을 위한 선형대수 - 5장 : 특이값 분해

Part 2.

seq.	날짜	내용
1	2018.11.02	(시각화) Vue.js : 필수요소중 설치방법 ~ 템플릿 문법
		(캐글 & 이미지 분석 ) https://www.kaggle.com/kmader/finding-lungs-in-ct-data
		(블록체인) 2장 블록체인 이해하기
2	2018.11.09	(시각화) Vue.js : 필수요소중 계산된 속성과 감시자 ~ 리스트 렌더링
		(캐글 & 이미지 분석 ) NIH Clinical Center releases dataset of 32,000 CT images 데이터 소개
		(블록체인)3장 스마트 계약과 이더리움 이해하기
3	2018.11.16	(시각화) Vue.js : 필수요소중 이벤트 핸들링 ~ 컴포넌트
		(캐글 & 이미지 분석 ) 32,000 CT images를 구글 클라우드에 올리고 전처리
		(블록체인) 4장 블록체인 2.0과 스마트 계약 플랫폼(김가경)
4	2018.11.23	(시각화) Vue.js : 트랜지션 & 애니메이션
		(캐글 & 이미지 분석 ) 32,000 CT images 실습(지용기)
		(블록체인) 5장 블록체인 서비스 활용하기

Part 3.

seq.	날짜	내용
1	2018.11.30	(시각화) Vue.js : 재사용 & 컴포지션 ~ 라우팅
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습(지용기)
		(블록체인) 6장 블록체인 애플리케이션 개발 기초
2	2018.12. 7	(시각화) D3.js : 1장 ~ 2장
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습
		(블록체인) 7장 솔리디티를 이용한 애플리케이션 개발
3	2018.12.14	(시각화) D3.js : 3장 Technology Fundamentals
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습
		(블록체인) 8장 애플리케이션 개발 프레임워크
4	2018.12.28	(시각화) D3.js : 4장 ~ 5장 : Data
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습
		(블록체인) 9장 애플리케이션을 설계할 때 주의할 점

Part 4.

seq.	날짜	내용
1	2019. 1. 4	(시각화) D3.js : 6장 Drawing with Data
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습
		(블록체인) 10장 블록체인의 기술적 과제와 해결 방법
2	2019. 1.11	(시각화) D3.js : 7장 ~ 8장 : Axes
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습
		(블록체인) 10장 블록체인의 기술적 과제와 해결 방법
3	2019. 1.18	(시각화) D3.js : 9장 Updates, Transitions, and Motion
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습 결과 발표
		(블록체인) 11장 블록체인의 미래
4	2019. 1.25	(시각화) D3.js : 10장 ~ 11장 : Layouts
		(시각화) D3.js : 12장 ~ 13장 : Exporting
		(캐글 & 이미지 분석) 32,000 CT images 실습 결과 발표