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Boom5426/Nature-Paper-Skills

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Nature-Paper-Skills

License: MIT Nature-first Workflow Codex Claude Code Contributions welcome GitHub stars

简体中文 | English

这是一个面向 Nature 系列期刊稿件的 agent skill 仓库,重点覆盖从初稿搭建、结构修订、图文对齐、引用核验、投稿前预检到返修回复的完整链路。

本仓库是强约束的,不是“通用论文写作技巧集合”。默认立场是 journal-first、claim-driven、证据边界优先。

快速开始

最快的上手方式不是先通读所有 skill,而是先把推荐安装集装好,然后直接让 agent 帮你路由下一步。

第 1 步:克隆仓库

git clone https://github.com/Boom5426/nature-paper-skills.git
cd nature-paper-skills

第 2 步:选一种安装方式

方式 A:直接让 Codex 安装

把下面这句话直接发给 Codex:

把当前仓库里的推荐 skills 安装到 ~/.codex/skills/:paper-workflow、paper-bootstrap、nature-portfolio-playbook、scientific-writing、manuscript-optimizer、results-section-revision、figure-planner、citation-verifier、data-availability、submission-audit、rebuttal-response。复制整个 skill 目录,不要只复制 SKILL.md。安装完成后,列出已安装目录,并用 paper-workflow 帮我判断当前稿件下一步该用哪个 skill。

方式 B:直接让 Claude Code 安装

把下面这句话直接发给 Claude Code:

把当前仓库里的推荐 skills 安装到 ~/.claude/skills/:paper-workflow、paper-bootstrap、nature-portfolio-playbook、scientific-writing、manuscript-optimizer、results-section-revision、figure-planner、citation-verifier、data-availability、submission-audit、rebuttal-response。复制整个 skill 目录,不要只复制 SKILL.md。安装完成后,列出已安装目录,并用 paper-workflow 帮我判断当前稿件下一步该用哪个 skill。

如果你只想让当前仓库生效,把上面提示里的目标目录改成 .claude/skills/

方式 C:手动安装

如果你更想自己动手,先克隆仓库,然后复制完整 skill 目录。

Codex:

mkdir -p ~/.codex/skills
cp -R \
  skills/core/paper-workflow \
  skills/core/paper-bootstrap \
  skills/core/scientific-writing \
  skills/core/manuscript-optimizer \
  skills/core/results-section-revision \
  skills/core/figure-planner \
  skills/core/citation-verifier \
  skills/core/data-availability \
  skills/core/submission-audit \
  skills/core/rebuttal-response \
  skills/venue/nature-portfolio-playbook \
  ~/.codex/skills/

Claude Code:

mkdir -p ~/.claude/skills
cp -R \
  skills/core/paper-workflow \
  skills/core/paper-bootstrap \
  skills/core/scientific-writing \
  skills/core/manuscript-optimizer \
  skills/core/results-section-revision \
  skills/core/figure-planner \
  skills/core/citation-verifier \
  skills/core/data-availability \
  skills/core/submission-audit \
  skills/core/rebuttal-response \
  skills/venue/nature-portfolio-playbook \
  ~/.claude/skills/

安装后第一句话

装完以后,最短路径通常是直接说:

用 paper-workflow 帮我判断这篇稿子下一步该用哪个 skill。

更详细的安装说明见 docs/installation-codex.mddocs/installation-claude.md。 Codex 使用 ~/.codex/skills/;Claude Code 使用 ~/.claude/skills/.claude/skills/,这几种安装方式可以并存,不会互相覆盖。

默认工作流

paper-bootstrap
  -> nature-portfolio-playbook
  -> scientific-writing / manuscript-optimizer
  -> figure-planner
  -> results-section-revision
  -> citation-verifier
  -> data-availability
  -> submission-audit
  -> rebuttal-response

默认假设:

  • 以期刊稿为主,不以会议稿为主
  • 未明确 venue 时按 Nature 系列期刊导向处理
  • 先修结构与证据链,再做语句级润色

仓库里有什么

核心技能

  • paper-workflow: 选择正确 skill 并按正确顺序推进
  • paper-bootstrap: 初始化论文项目、source of truth 和状态文件
  • scientific-writing: 章节撰写与重写
  • manuscript-optimizer: 结构与证据链修复
  • results-section-revision: Results 小节级叙述结构修复
  • figure-planner: 一图一主张、panel 角色、legend 同步
  • citation-verifier: 引用与 BibTeX 卫生检查
  • data-availability: Data Availability 声明、仓库与 accession/source data 规划
  • submission-audit: 投稿前/返修前总预检
  • rebuttal-response: 审稿意见回复与改稿联动

期刊定位技能

  • nature-portfolio-playbook: 做 Nature 系列期刊范围内的定位判断,并执行投稿前预检

研究与审稿技能

  • paper-analyzer
  • academic-researcher
  • results-analysis
  • paper-reviewer

可选技能

  • reference-audit-guide
  • conference-paper-writing
  • academic-presentations

仓库结构

nature-paper-skills/
├── .github/
├── docs/
├── examples/
├── reference/
├── skills/
│   ├── core/
│   ├── venue/
│   ├── research/
│   ├── review/
│   └── optional/
├── .gitignore
├── ATTRIBUTION.md
├── CONTRIBUTING.md
├── LICENSE
├── README.md
└── README.en.md

脚本随 skill 目录分发,保证 skill 可独立复制和复用。

设计原则

  • claim-driven,而不是 panel-driven
  • 一张主图尽量只承载一个主结论
  • 图注是结果叙述的第二层,不是只解释坐标轴
  • 主文只保留支撑本段 claim 的关键数字
  • 对已有章节重写前,先做 reverse outline
  • 不允许前半部分(Abstract/Introduction)比下游证据更强
  • venue 与 article type 要前置决策,不要末期再救火

详见:

仓库元信息

GitHub 仓库 description、topics 和 About 面板文案统一放在 .github/repo-metadata.md

适用范围

适用于:

  • Nature 系列生命科学/计算生物/方法学论文
  • methods / frameworks / benchmarks / resources / translational 分析类工作
  • 写作、修稿、投稿前预检与返修回复

不追求:

  • 覆盖所有期刊写作风格
  • 会议模板大全
  • 全量研究平台编排
  • 替代官方 author guidelines

贡献

贡献规范、命名约定和 PR 预期见 CONTRIBUTING.md

归因

来源归因见 ATTRIBUTION.md

致谢

本仓库部分代码和灵感来源于 OpenLAIR/dr-claw and 罗小罗团队Yuan1z0825/nature-skills,感谢所有为本项目贡献代码、文档和测试的开发者社区成员。

About

Agent skills for drafting, revising, auditing, and resubmitting Nature-style journal manuscripts.

Resources

License

Contributing

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Watchers

Forks

Releases

No releases published

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Contributors