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FastQTools Wiki

欢迎来到 FastQTools 的开发 Wiki！

本 Wiki 用于记录项目的FASTQ 格式规范、边界情况处理、性能基准对比等内部开发文档。

项目概览

FastQTools 是一个现代 C++ 高性能 FASTQ 文件处理工具包：

模块	说明
QC	Per-base/per-read 质量统计、GC 含量、长度分布
Filter	质量阈值、长度范围、N-ratio、复杂度过滤
Statistics	综合 FASTQ 指标，JSON/HTML 报告
I/O	多线程 I/O、SIMD 加速质量解析、gzip 支持

技术栈: C++23, CMake 3.20+, Conan 2.x, Google Test, Google Benchmark, zlib

页面索引

• FASTQ Format Notes — FASTQ 格式规范、边界情况、已知异常文件处理
• Performance Benchmarks — 各模块性能基准数据与优化记录
• Build and CI Notes — Conan 依赖管理、DevContainer、CI 配置细节
• Debug Notes — 调试经验与踩坑记录