save content using cc.Asset._nativeAsset.setter, add handler of '.bin'

[SantyWang]

Re: cocos-creator/2d-tasks#1170

Changes:

• save content
• loadResDir should not return all spriteFrame of SpriteAtlas

[SantyWang]

参考#2981
参考https://github.com/cocos-creator/fireball/issues/6757

现在用户释放资源基本都是用getDependsRecursively先获取依赖再传递给release函数，感觉没有必要返回spriteAtlas的spriteFrame在一个数组里了

[jareguo]

这样修改后，之前的 example 需要同步调整，也采用
getDependsRecursively 释放图集才行。 @ColinCollins

[jareguo]

现在用户释放资源基本都是用getDependsRecursively先获取依赖再传递给release函数，感觉没有必要返回spriteAtlas的spriteFrame在一个数组里了

其实当初那么改，主要原因也不是为了方便 release，而是为了保持行为和其它的 sub asset（如 texture -> sprite frame） 一致。loadResDir 总是会返回所有的子资源。
要说 loadResDir 那样改有什么问题？主要倒还是忽略了对 type 的判断，如果 type 定义为非 SpriteFrame，那么就不应该自行添加 SpriteFrame。

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重新想了一下，这里始终不会有特别统一的解决方法。日后有需要的话再采用类似 AssetBundle 的方案替代吧