J-CaseMap

Paper: Causal Tree Extraction from Medical Case Reports: A Novel Task for Experts-like Text Comprehension

Authors: Sakiko Yahata, Zhen Wan, Fei Cheng, Sadao Kurohashi, Hisahiko Sato, Ryozo Nagai

Sample data (national-exam/data.json)

Sample data consisting of pairs of pseudo case report data (report) based on Japanese national exams and causal trees (causal_tree) created based on them.

    {
        "id": "case54",
        "title": "既治療軟部肉腫転移後に出現した薬剤性心筋障害が疑われた心不全の1例",
        "report": "【症例】70歳男性【主訴】労作時息切れと倦怠感【現病歴】4年前縦隔軟部肉腫切除、2年前肺転移に対しドキソルビシン（アドリアマイシン）を2か月間施行後病勢安定。1か月前から倦怠感、数日前より階段昇降で息切れ増悪。3か月で体重＋3kg。既往高血圧あり。胸痛は明確でない。【身体所見】BP164/78mmHg、HR80/分整、体温36.5℃。頸静脈怒張なし、III音聴取、ラ音なし。両下腿浮腫軽度。術痕あり。【検査】Hb 11.6g/dL。BNP 696pg/mL高値、トロポニンT軽度上昇0.14 ng/mL、CK-MB正常。肝酵素軽度上昇。心胸郭比58%（3か月前53%）。心電図：高電位＋側壁軽度ST低下。心エコー：左室びまん性壁運動低下、LVEF 35%、左室拡大軽度。1年前心エコー正常で差異顕著。【診断】アントラサイクリン既往後の遅発性薬剤性心筋障害による心不全（HFrEF）を最も考慮。急性心筋梗塞はCK-MB正常・局在性壁運動異常欠如から低可能性。拡張型心筋症と鑑別要するも既往薬剤曝露と発症様式が支持。【経過・治療】心不全ステージC/HFrEFとしてACE阻害薬（またはARNI検討）、β遮断薬、ミネラルコルチコイド受容体拮抗薬、SGLT2阻害薬を循序導入。体液貯留軽度で利尿薬少量。血圧コントロール下げながらリモデリング抑制。心毒性累積容量再評価し腫瘍内科と協議、追加アントラサイクリン回避。心リハ介入。3か月後LVEF 42%へ部分改善、BNP 320pg/mLへ低下しNYHA II維持。【考察】アントラサイクリン心筋障害は遅発性にLVEF低下を呈し、早期検出で機能回復可能性が高い。定期心エコーとバイオマーカー監視は腫瘍学的転帰と心血管安全性の両立に不可欠であり、四本柱薬物療法早期導入が予後改善に資する。",
        "causal_tree": "-軟部肉腫\n  -H:ドキソルビシン使用\n  -肺転移\n-ドキソルビシン副作用\n  -H:軟部肉腫転移\n  -薬剤性心筋障害\n    -H:高血圧\n    -労作時呼吸困難\n    -全身倦怠感\n    -体重増加\n    -3音\n    -浮腫@両*下腿\n    -頚静脈怒張/陰性\n    -ラ音/陰性\n    -ヘモグロビン/低値\n    -BNP/高値\n    -トロポニンT/高値\n    -CKーMB/正常\n    -肝酵素/高値\n    -急性心筋梗塞/陰性\n    -心電図=高電位\n    -心電図=ST低下\n    -超音波=左室収縮低下\n    -超音波=左室拡大\n    -H:ACE阻害薬/有効\n    -H:β遮断薬/有効\n    -H:ミネラルコルチコイド受容体拮抗薬/有効\n    -H:SGLT2阻害薬/有効\n"
    },

Citation

@misc{yahata2025causaltreeextractionmedical,
      title={Causal Tree Extraction from Medical Case Reports: A Novel Task for Experts-like Text Comprehension}, 
      author={Sakiko Yahata and Zhen Wan and Fei Cheng and Sadao Kurohashi and Hisahiko Sato and Ryozo Nagai},
      year={2025},
      eprint={2503.01302},
      archivePrefix={arXiv},
      primaryClass={cs.CL},
      url={https://arxiv.org/abs/2503.01302}, 
}