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v0.2.1

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@github-actions github-actions released this 04 Oct 08:29
· 5 commits to main since this release

v0.2.1

预编译二进制:

  • Linux x86_64(glibc):braid-v0.2.1-x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz,解压后是 braid
  • Windows x86_64(MSVC):braid-v0.2.1-x86_64-pc-windows-msvc.zip,解压后是 braid.exe

本版包含 TAMA collapse、TAMA merge、FLAIR combine 和 TACO meta-assembly。许可证 GPL-3.0-only。

更新内容:

  • 完成 TAMA merge,支持来源优先级、capped/no_cap 混合、重复模型处理及来源 ID/CDS 保留。
  • TAMA collapse 新增 no_cap、low_mem 和 BAM 支持,并兼容原版单横线参数。
  • 新增与 tacorna/taco 0.7.3 对照的 TACO meta-assembly。
  • 修复 FLAIR 连续过滤映射、混合 FASTA 输入和 FASTA 空行处理。
  • 扩充算法对照、命令行兼容性和 BAM 回归测试。

TAMA collapse 支持 capped/no_cap、original/low_mem 和 SAM/BAM;读取 BAM 需要在 PATH 中安装 samtools。
Linux 包在 GitHub 的 Ubuntu 运行器上编译,需要与该系统相近的 glibc。