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v0.2.1
预编译二进制:
- Linux x86_64(glibc):
braid-v0.2.1-x86_64-unknown-linux-gnu.tar.gz,解压后是braid - Windows x86_64(MSVC):
braid-v0.2.1-x86_64-pc-windows-msvc.zip,解压后是braid.exe
本版包含 TAMA collapse、TAMA merge、FLAIR combine 和 TACO meta-assembly。许可证 GPL-3.0-only。
更新内容:
- 完成 TAMA merge,支持来源优先级、capped/no_cap 混合、重复模型处理及来源 ID/CDS 保留。
- TAMA collapse 新增 no_cap、low_mem 和 BAM 支持,并兼容原版单横线参数。
- 新增与 tacorna/taco 0.7.3 对照的 TACO meta-assembly。
- 修复 FLAIR 连续过滤映射、混合 FASTA 输入和 FASTA 空行处理。
- 扩充算法对照、命令行兼容性和 BAM 回归测试。
TAMA collapse 支持 capped/no_cap、original/low_mem 和 SAM/BAM;读取 BAM 需要在 PATH 中安装 samtools。
Linux 包在 GitHub 的 Ubuntu 运行器上编译,需要与该系统相近的 glibc。