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Dowson0/dna_features

 
 

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dna_features


格式和运行


  • 这是一个常用的DNA特征提取方法的实现,通过下面命令行的运行可以得到多个特征文件。

  • 输入文件格式:标准的fasta文件格式

  • 运行

python feature.py -fasta fastafile
  • 输出: 所有的特征以文件形式保存,文件名字是特征名字
  • 其实,DNC就是2-mer,TNC就是3-mer。而kmer中的k我默认设置的是4,也就是4-mer。

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Implementations of different methods for extracting DNA features

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