Il seguente tool è stato creato in java e tramite maven. Accetta come input file in formato rnaml, ct, aas, bpseq e db. L'output si può richiedere negli stessi formati.
Per installare il tool bisogna seguire i seguenti passaggi:
- Scaricare il contenuto della repository
- Copiare i tre file contenuti nella cartella result in una cartella apposita
- Inserire nella variabile di sistema Path il perscorso della cartella scelta
- Creare una nuova variabile di sistema RNATOOL_PATH ed inserire lo stesso percorso
Per usarlo su riga di comando è necessario digitare rnatool, il path del file di input e, di seguito, tutti gli output. Es. rnatool input.rnaml output.db output.ct... Per usarlo per tradurre un gran numero di file dello stesso formato è necessario digitare rnatool all, il path della cartella (o un punto, se si esegue il comando dalla cartella) il formato dei file da prendere e il formato di out da produrre. Es. rnatool all . rnaml db Il software è stato pensato per una pipeline con RnaView. Per sfruttarla, bisogna prima installare RnaView sul proprio applicativo. Una volta fatto, è necessario digitare rnaviewtool, il file di input di tipo pdb e il formato di output Es. rnaviewtool input.pdb bpseq