DNATestCompression

Repository per la compressione di file EDS

Questo progetto è uno script bash che esegue una serie di operazioni per convertire file di tipo .eds in formato .bwt, comprimerli e infine analizzarli con DNAStructureInfo. È utile per coloro che lavorano con dati biologici e necessitano di strumenti per la gestione e l'analisi dei dati.

Prerequisiti

Prima di eseguire lo script, assicurati di avere nella cartella corrente i seguenti progetti:

1. EDS-GEN: Questo programma serve per generare file in formato Raw e Eds.
2. DNAStructureInfo: Utilizzato per analizzare file BWT generati.
3. gsufsort: Serve a eseguire l'ordinamento BWT sui file RAW.

Inoltre, assicurati di avere installato i seguenti strumenti:

• 7-Zip: Necessario per la compressione dei file.

     sudo apt update && sudo apt upgrade
     sudo apt install p7zip-full
  

Utilizzo

1. Avvia l'installazione:

   ./install.sh
   

2. Avvia l'applicativo

   ./DNATestCompression.sh
   

• Segui le istruzioni fornite per eseguire il test

Opzionale

1. Disinstallazione

   ./uninstall.sh