GCGE当前依赖的外部包如下：
- mingw-w64-x86_64-msmpi 10.1.1-11
- mingw-w64-x86_64-openblas 0.3.28-1
- mingw-w64-x86_64-gcc 14.2.0-1(其中自带openmp)
windows平台下msys2环境：采用pacman -S mingw-w64-x86_64-msmpi 10.1.1-11进行安装，其他包类似
cd LearnGCGE
mkdir build
cd build
cmake ..
make 编译时不能链接libgomp.a和libmingwthrd.a
--原因：测试用电脑已安装有mingw64(并设置系统变量)
--措施：卸载已有的mingw64，重新按上述流程编译
- sudo apt install build-essential openssl libssl-dev
- 下载编译安装 cmake-3.16.5
- 下载编译安装 OpenBLAS-0.3.28
# 下载 OpenBLAS wget https://github.com/xianyi/OpenBLAS/archive/v0.3.28.tar.gz -O OpenBLAS-0.3.28.tar.gz tar -xzf OpenBLAS-0.3.28.tar.gz cd OpenBLAS-0.3.28 # 编译并启用 OpenMP make -j4 USE_OPENMP=1 PREFIX=$HOME/deps/OpenBLAS-0.3.28 # 这个路径指定好像没生效，生成在了/opt/OpenBLAS/下 # 安装 sudo make install echo 'export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/deps/OpenBLAS-0.3.28/lib:$LD_LIBRARY_PATH' >> ~/.bashrc echo 'export CPATH=/deps/OpenBLAS-0.3.28/include:$CPATH' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc
- 下载编译安装 mpich-4.2.3
wget https://www.mpich.org/static/downloads/4.2.3/mpich-4.2.3.tar.gz tar -xzf mpich-4.2.3.tar.gz cd mpich-4.2.3 ./configure --prefix=$HOME/deps/mpich-4.2.3 # --prefix=后面是安装路径，可不填则默认安装到系统路径 make -j4 make install echo 'export PATH=$HOME/deps/mpich-4.2.3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc # 路径要根据自己的安装路径而定 echo 'export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/deps/mpich-4.2.3/lib:$LD_LIBRARY_PATH' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc
cd LearnGCGE
mkdir build
cd build
cmake ..
make 1.当cmake..时，find_package(OpenBLAS REQUIRED)失败
--原因：使用sudo apt install libopenblas-dev安装了低版本openblas
--措施：下载编译安装 OpenBLAS-0.3.24
2.当make时，出现"error: conflicting declaration of C function 'void MPI::Init(int&, char**&)' extern void Init(int&, char**&);"
--原因：使用sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev安装了低版本openmpi
--措施：下载编译安装 mpich-4.2.3
将北大网盘中libpetsc.a文件拷贝到LearnGCGE/3rd/petsc/linux/lib/libpetsc.a
原因：当前libpetsc.a没有进行编译优化，导致文件体积过大(180M),无法传入github仓库，因此暂时放在北大网盘中，辛苦采用ubuntu环境的同学，手动下载放置在如上目录中。
编译前(默认设置为MPI形式，因此无需修改)：
- 修改
gcge\include\ops_config.h中#define OPS_USE_MPI 0值为1 - 取消
CMakeLists.txt中注释# include(linux_mpicc)
运行时：
- 在Mingw64命令行窗口中执行如下命令, 其中为期望采用的进程数量
mpiexec -n <num> ./test.exe ../example/K.mtx ../example/M.mtx ../example/usrParam.txt
- 在Ubuntu bash命令行窗口中执行如下命令, 其中为期望采用的进程数量
mpiexec -n <num> ./test ../example/K.mtx ../example/M.mtx ../example/usrParam.txt
- 在Mingw64命令行窗口中执行:
./test.exe K.mtx M.mtx usrParam.txt- 在Ubuntu bash命令行窗口中执行:
./test K.mtx M.mtx usrParam.txt- windows系统运行时,不能使用mpiexec命令
--原因：mingw-w64-x86_64-msmpi安装包的部分版本不含msmpi
--措施：在windows系统下载安装msmpisetup.exe
- ubuntu系统运行时,出现"OpenBLAS Warning : Detect OpenMP Loop and this application may hang. Please rebuild the library with USE_OPENMP=1 option"
--措施：export OMP_NUM_THREADS=1
- 编译成功，运行时报错：YOUR APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Illegal instruction (signal 4)，加日志定位到PetscInitialize初始化失败。 --原因：因系统差异导致。当前打包的petsc.a是在ubuntu22.04下编译的，不同版本系统需要使用自己系统下编译的petsc.a。 --措施：自己编译petsc.a
读入MTX矩阵到petsc格式的Mat中，再转换为CCS_MAT格式，调用串行版GCGE求解器
目的是：验证MTX矩阵读入为petsc的Mat矩阵正确。
-
libpetsc.a的编译，使用“./configure --with-mpiexec=xx --with-blas-lib=/xxx/lib/libopenblas.a --with-lapack-lib=/xxx/lib/libopenblas.a xxx”编译的libpetsc.a仅58M大小(上传了)，但是要依赖libmpifort.a等库，这些依赖库是按照另一种“./configure --with xxx”编译出来库(也有一个大小约229M的libpetsc.a)，这些库共同作用才能将petsc作为第三方库使用
-
GCGE编译成动态库时与petsc链接失败 当前暂时采用GCGE编译成静态库来解决程序跑通的问题，之后修改与petsc的链接问题。
- 基础线性代数包 BLAS和LAPACK
目前调用的是openblas，如果调用其他库自行修改CMakeLists.txt
- UMFPACK
直接法解法器，可以加速收敛
该算例条件数较大，且矩阵比较病态，目前设置的参数并不适合一般矩阵的特征值问题（会影响效率）；
GCGE1.0_linux/include/ops_config.h 中包含该软件包涉及的一些计算环境的宏定义，注意同步修改这些宏定义；
- 下载编译安装 petsc-3.22.3
# 网站上下载指定安装包: https://web.cels.anl.gov/projects/petsc/download/release-snapshots/ tar -xzf petsc-3.22.3.tar.gz cd petsc-3.22.3 ./configure --prefix=$HOME/deps/mpich-4.2.3 # --prefix=后面是安装路径，可不填则默认安装到系统路径 make -j4 make install echo 'export PATH=$HOME/deps/mpich-4.2.3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc # 路径要根据自己的安装路径而定 echo 'export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/deps/mpich-4.2.3/lib:$LD_LIBRARY_PATH' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc