cleanup: rimuovi 4 CLI comandi senza consumatori esterni

[Gabrymi93]

Sintesi

Rimuove 4 comandi CLI deprecati che non hanno consumatori esterni (nessun riferimento in altri repo, skills, o CI).

Comando	Sostituito da	Motivo
toolkit query	toolkit layer -m sql	Nessun consumer esterno
toolkit preview	toolkit scout <URL>	Nessun consumer esterno
toolkit scaffold clean	toolkit run init	Nessun consumer CLI diretto
toolkit review-readiness	toolkit run full / inspect summary	Usato solo internamente

Cosa cambia

• Refactor / performance

Impatto su contratti pubblici

Nessuno — tutti i comandi erano hidden=True.

Verifica

pytest tests/ -q --ignore=tests/test_smoke_e2e_flow.py --ignore=tests/test_smoke_scout.py

• pytest -m core passa (1053 test, 0 fallimenti)

Note

• I backend module rimangono (usati internamente da run.py e MCP)
• DuckDB MCP (_local/mcp/duckdb/) aggiornato

[Gabrymi93]

Fix applicati (commit 64b25e3)

Coverage 81% — CI should pass now:

• Rimosso cmd_review_readiness.py (dead module, logica in readiness_ops.py)
• Rimosso cmd_query.py, cmd_scaffold.py (dead code, già deregistrati)
• Rimosso 503 linee di codice morto → copertura da 79.41% a 81%
• Aggiunti 3 test per check_column_types() (copre la nuova funzione)

Stale message fixed:

• cmd_run.py:789: toolkit scaffold clean → toolkit run init