Для запуска достаточно запустить скрипт start.sh, он в свою оредеь завустит собранный проект (ir-labs-jar.jar) со всеми необходимыми параметрами
-file <files>              - файлы для анализа
-detector <detectors>      - методы оценки Коллокаций
-top <top hit number>      - Список из top number Коллокаций с наибольшим рангом (в соотв. с методом вычисления)

Чтобы собрать проект, достаточно иметь jdk 7 (прописанный в JAVA_HOME env variable) и maven (версии 2.x или 3.x, желательно последнее, прописанный в MVN_HOME env variable)
Тогда, для сборки будет достаточно вызвать 

$ mvn

или, что то же самое

$ mvn package

После сборки целевой файл будет по адресу поддиректории:

target/ir-labs-jar.jar