KDS Pipeline
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·
3146 commits
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since this release
- Entwicklungsumgebung verfügbar
- Zugriffe für die Entwickler eingerichtet (VPN, Public-Keys, etc.)
- Docker-Umgebung Entwickler-VM einreichtet
- initiales docker-compose Setup erstellt ((opt: FHIR-Server), R-Umgebung, AMTS-Datenbank, Redcap+DB)
- Zugriff auf FHIR-Server mit Testdaten (MII FHIR Server mit Testdaten)
- R-kds2db Projekt inkl. Dokumentation aufgesetzt (roxygen)
- ETL (Stage 0 (temp.), Stage 1 (pers.), Rohdaten): FHIR-Ressourcen werden in tabellarische Daten konvertiert und in der AMTS-DB abgelegt #53
- Redcap: IP-Projekt aufgesetzt und exportiert
- Aufbereitung/Harmonisierung (Stage 2 (in Rel. 0.1.0: SQL; später Scripte/R), 'für IP nutzbare Daten') #55
- Redcap: Stage-2 Daten in Redcap-Formularen anzeigbar (Nachweis der technischen Machbarkeit), R-db2frontend #54
- Doku #58
- Markdown-Dateien
- github-Pages aktiviert
- Tests / QS
- docker-compose
- R-Scripte
- DB
What's Changed
- 46 fhir2sql initiale r projektstruktur anlegen by @astruebi in #49
- 50 add retrieval functions from template by @astruebi in #56
New Contributors
Full Changelog: https://github.com/medizininformatik-initiative/INTERPOLAR/commits/v0.1.0-alpha
What's Changed
- 46 fhir2sql initiale r projektstruktur anlegen by @astruebi in #49
- 50 add retrieval functions from template by @astruebi in #56
- 53 fhir2sql überführung der ressourcentabellen in ip datenbank by @astruebi in #62
- 63 release vorbereitung für fhir2db by @Flow191 in #65
- 64 kds2db datenbankzugriffsdaten für alle module in eine separate db configtoml verschieben by @astruebi in #66
- 69 db benennung initialer commit by @SebStaeubert in #70
- Rename mrputils -> etlutils by @astruebi in #72
- 73 initiale einrichtung docker auf der vm by @SebStaeubert in #74
- 79 finale anpassungen für release v01 im modul kds2db by @astruebi in #80
- 77 finalisierende arbeiten docker compose setup by @SebStaeubert in #78
- 29 skript zum daten in redcap schicken by @mayadogh in #82
- 81 initiale db skripte hinzufügen by @reuschem in #83
- 85 kds2db definition der table description erleichtern by @astruebi in #87
- 88 kds2db update table description by @astruebi in #89
- 92 kds2db fehlerbehebung beim logging und in der table description by @Flow191 in #95
- Release by @SebStaeubert in #96
- 84 redcap deploy variante 1 ip redcap from redcap plain download by @SebStaeubert in #97
- Change build of R environment from multiple Dockerfiles to a single D… by @SebStaeubert in #99
- Release by @SebStaeubert in #100
- kds2db korrektes arbeitsverzeichnis setzen by @Flow191 in #104
- 105 kds2db pfade für toml dateien korrigieren by @Flow191 in #106
- 84 redcap deploy variante 1 ip redcap from redcap plain download by @SebStaeubert in #107
- Release by @Flow191 in #108
- 106 db2frontend pfade für toml dateien korrigieren by @Flow191 in #110
- DB update init script with new tables by @reuschem in #111
- U Fix missing URL_PORT_SPEC variable by @astruebi in #113
- DB fix script by @reuschem in #115
- 112 ksd2db verbesserung des loggings by @Flow191 in #116
- DB change itemnames by @reuschem in #117
- DB change call to select by @reuschem in #118
- DB bigger med_code_system varchar by @reuschem in #119
- P Create initial DataProcessor project by @astruebi in #122
- Create README.md by @astruebi in #123
- 120 redcap api token und url in db2frontend configtoml by @Flow191 in #125
- Release by @SebStaeubert in #127
- 124 kds2db update table description by @astruebi in #128
- 126 kds2db kleine anpassungen für release v01 by @Flow191 in #129
- 130 add pids per ward in table description by @astruebi in #131
- 132 kds2db automatische generierung des initialen sql skriptes by @astruebi in #133
- 84 redcap deploy variante 1 ip redcap from redcap plain download by @SebStaeubert in #134
- 135 kds2db letzte fehlerbehebungen vor release v01 by @astruebi in #136
- K + DB Move template SQL Scripts to subfolder 'template' by @astruebi in #139
- 141 hotfix fuer release v01 by @Flow191 in #142
- Release v0.1 by @SebStaeubert in #144
New Contributors
- @Flow191 made their first contribution in #65
- @SebStaeubert made their first contribution in #70
- @mayadogh made their first contribution in #82
- @reuschem made their first contribution in #83
Full Changelog: https://github.com/medizininformatik-initiative/INTERPOLAR/commits/v0.1.0-alpha
Contributors
astruebi, SebStaeubert, and 3 other contributors