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Awesome Vibe Research

🔬 Awesome Vibe Research

面向 AI 辅助科研的开放共建仓库
收集和沉淀科研全流程中的 agents、skills、workflows、tools 与最佳实践

🇨🇳 中文版 | 🇬🇧 English

🧪 全流程🔭 方向扫描📚 文献研究🧩 方法设计⚗️ 实验执行📊 可视化✍️ 写作📦 复现发布📡 传播🤝 贡献


我们关注能在科研工作中反复复用、能被同行验证、能逐步演化、表现最优的 AI 辅助能力。

本仓库从「与 Agent 共事做研究」系列沙龙出发,希望把 speaker 的实践经验、观众的使用反馈、开源项目与可复用流程沉淀成一个社区可维护的知识库。


🗺️ 科研流程地图

下表是我们对科研生命周期的 9 阶段拆分。每个阶段列出了"典型问题"和"可沉淀的 AI 辅助组件类型"。正文按阶段展开条目表,收录已知最好的项目、skill、workflow。

💡 如果你觉得某个阶段的条目缺失或可以补充——直接在对应表格中添加一行。

阶段 典型问题 范围
🔄 0.全流程 覆盖以下多个环节和问题
🔭 1. 方向扫描和问题定义 这个领域最近发生了什么?什么问题值得做、可做、能验证? trend scanner、paper radar、venue tracker;idea generator、novelty checker、hypothesis workflow
📚 2. 文献研究 相关工作怎么找、读、比、写? literature review workflow、paper reading skill、citation graph agent
🧩 3. 方法设计 方案、实验和评价指标如何设计? experiment design skill、ablation planner、protocol checker
⚗️ 4. 实验执行与分析 如何写代码、跑实验、记录失败?结果是否可信,误差来自哪里? experiment runner、statistical analysis skill、failure analysis workflow、robustness checker
📊 5. 可视化 图表是否讲清楚了科学问题? figure generation agent、visualization critique skill
✍️ 6. 论文写作 如何组织论文、引用、补实验? paper writing workflow、citation verifier、rebuttal assistant
📦 7. 复现发布 如何让别人复现和使用? artifact packaging workflow、model card、data card、reproducibility checklist
📡 8. 传播影响 论文发表后如何追踪影响?如何构造自己的学术影响力 impact analysis tool、social summary skill、citation monitor

0 🔄 全流程(端到端自动科研)

覆盖从想法到论文的端到端系统。跨三个以上阶段的 agent 放这里,单阶段工具请放到对应阶段。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo Paper
AI-Scientist 端到端自动科学发现系统,覆盖想法生成、实验、论文和同行评审 agent ⭐ 14k GitHub - Nature 2024
AI-Scientist-v2 基于 agentic tree search 的自动科研系统,不依赖人类模板,面向更通用的 ML 研究探索 agent ⭐ 6.6k GitHub - arXiv 2025
EvoScientist 多 agent AI scientist 系统,强调持久记忆、技能演化和端到端科研协作 agent ⭐ 3.6k GitHub Demo arXiv 2025
nature-skills 符合 nature 论文学术表达和科研绘图的 Skill skill ⭐ 21.1k GitHub · 魔搭 Skills - -
AutoResearchClaw 自主、自进化的多阶段研究流水线,从研究想法推进到论文产物 agent ⭐ 13.5k GitHub Demo arXiv 2025
autoresearch Andrej Karpathy 的自主 ML 研究代理,在单 GPU 上自动运行实验并改进模型 agent ⭐ 87.6k GitHub - -
Auto Claude Code Research in Sleep 自动化 Claude Code 科研工作流项目,面向自动实验与代码执行 skill ⭐ 12.3k GitHub - -
AgentLaboratory 端到端的自主研究工作流程,由 LLM 驱动的专业代理支持完成从文献综述到报告撰写的全流程 agent ⭐ 5.7k GitHub - -
Aether 基于 OpenCode 的开源项目,面向科研人员提供 web 与桌面端统一的 AI 研究工作环境 agent/应用 ⭐ 65 GitHub - -
EurekAgent 环境工程驱动的自主科研系统,面向可度量任务协调 Claude Code 会话提出方案、实现代码、隔离评测并迭代优化 agent ⭐ 55 GitHub - arXiv 2026

1 🔭 方向扫描与问题定义

趋势追踪、选题灵感、新颖性验证、假说生成。与文献检索有交叉时,以"产出一个可做的研究问题"为核心判断归属。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo Paper
SciAgentsDiscovery MIT 开源的科学发现多智能体系统,结合知识图谱与 agent 协作用于跨学科假说生成 agent ⭐ 615 GitHub - arXiv 2024
AutoDiscovery AllenAI 开源的开放式科学发现框架,通过 Bayesian Surprise 从数据中发现可验证假说 benchmark/workflow ⭐ 186 GitHub - NeurIPS 2024

2 📚 文献研究:检索、精读、综述与引用网络

文献搜索、RAG 问答、自动综述生成、引用图谱分析。纯写作润色类放 6。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo Paper
STORM 斯坦福开源知识整理系统,通过多视角问题生成和检索生成带引用报告 agent ⭐ 28.6k GitHub Demo NAACL 2024
paperseek 面向研究者的文献发现工具,支持自然语言检索、自动迭代查询、扩展候选论文 agent/skill ⭐ 42 GitHub 魔搭创空间 -
Lune 通过 MCP 提供顶会 Paper 的 agentic search 能力,支持学术文献与科研最佳实践的 grounding agent/tool ⭐ 2 GitHub Demo -
PaperQA2 面向科学文献的高准确 RAG 问答系统,支持基于论文证据生成带引用回答 python 包 ⭐ 8.7k GitHub - -
OpenScholar 检索增强的科学文献综合系统,用开放语料和检索结果生成引用支撑的 scholarly answer agent/model ⭐ 1.5k GitHub - arXiv 2024
paper-search-mcp 面向 agent 的论文检索 MCP/CLI/Skill,支持 arXiv、PubMed、bioRxiv、Semantic Scholar、OpenAlex 等来源 tool/skill ⭐ 1.9k GitHub - -
Zotero-GPT Zotero 内的 AI 文献阅读插件,支持在文献库中进行摘要、问答、标签和笔记辅助 plugin ⭐ 7.2k GitHub - -

3 🧩 方法设计

实验方案、评价指标设计、ablation 规划、protocol 检查。纯代码实现与跑实验放 4。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo Paper
Curie 自动化且强调严谨性的科学实验 agent,从假说澄清到实验执行、分析和报告 agent/workflow ⭐ 363 GitHub - arXiv 2025

4 ⚗️ 实验执行与分析

代码编写、实验运行、统计分析、失败分析、鲁棒性检查。数据集构建放 3 或 2,可视化放 5。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo Paper
RD-Agent 实现数据与模型高价值通用研发流程的自动化,让 AI 驱动数据驱动型 AI agent ⭐ 13.5k GitHub - arXiv 2025
EurekAgent 面向可度量科研任务的实验执行环境,支持 Claude Code 会话自动实现方案、Docker 隔离评测、日志追踪和迭代优化 agent ⭐ 55 GitHub - arXiv 2026

5 📊 科学可视化:论文插图、科学绘图与可视化表达

出版级图表、示意图生成、数据 dashboard。幻灯/海报放 8。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo Paper
PaperBanana 多 agent 学术插图自动化生成框架,从文本描述生成出版级图表和统计图 agent ⭐ 6.6k GitHub Demo arXiv 2025

6 ✍️ 论文写作、投稿与同行评审

起草、润色、引用验证、LaTeX 辅助、rebuttal、审稿。综述生成类放 2。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo Paper
Academic Research Skills 覆盖学术写作、润色、投稿检查和发表流程的 Claude Code skill 套件,也覆盖文献调研 skill ⭐ 32.8k GitHub - -
RefChecker 学术参考文献验证工具,可检查引用真实性、元数据错误和疑似伪造引用 tool ⭐ 406 GitHub - -

7 📦 复现、发布与归档

代码复现、demo 体验、模型 & 数据集发布。

项目名称 描述 类型 链接 使用指引
ModelScope 创空间 承载科研 demo 复现、发布和体验 platform ModelScope Studio 文档
ModelScope Notebook 免费的云端 Jupyter 环境,自带 GPU、持久化存储和 AI 编程辅助 platform Gallery 指引
ModelScope 科学智能 汇集开源 AI for Science 模型,覆盖生命/地球/物质/社会科学等方向 platform Nexa Models 文档
Paper2Code 多智能体系统,将学术论文自动转化为可运行的代码仓库 agent GitHub Quick Start
data-to-paper 多 AI 智能体自主协作,从原始数据完成完整科研并生成可验证论文 python 包 GitHub -

8 📡 传播、教学与影响力分析

幻灯、海报、博文、社交传播、引用分析、学术影响力工具。

项目名称 描述 类型 Stars 链接 Demo/实践经验 Paper
CitationClaw 用 agent 挖掘可解释的论文影响力,适合论文发表后的引用画像和传播分析 tool ⭐ 308 GitHub ModelScope Studio -
ModelScope AI 超级简历 科研个人主页建设,用于沉淀模型、数据集、paper、demo 和学术影响力 platform - ModelScope 示例:VoyagerX · 陈谐 -

🏆 最佳实践

标题 实践简介 文章 Demo
DIY 你的蛋白质 — AlphaFold3 推理 用 AlphaFold3 在魔搭上做蛋白质结构推理的实操教程 魔搭研习社 创空间
AI Ready 遥感:从开放数据到开源生态实践 AI Ready 数据简介,以及 ModelScope 如何提升遥感研究的 AI 就绪程度 魔搭研习社 -
Open Source GeoAI Practise with ModelScope APGARSS 教程合集:基于 ModelScope 的开源地理人工智能实践 魔搭研习社 -
PaperSeek - 使用自然语言检索文献 用自然语言进行文献检索、自动扩展查询并生成候选论文列表的实践流程 魔搭研习社 创空间

📋 收录原则

我们收录的标准:

  • ✅ 明确面向科研场景(非通用 AI 助手)
  • ✅ 有可运行代码或可复用流程
  • ✅ 项目仍在维护(最近 6 个月有更新)
  • ✅ 文档或 README 清晰可上手
  • ✅ 解决科研痛点有实际案例
  • ✅ 开源或有免费可用版本

加分项:有论文支撑 · 有在线 demo · 被科研社区引用 · 已在实际项目中验证


🤝 如何贡献

除了推荐已有的开源项目,我们更鼓励沉淀自己在科研中实际跑通的 AI 辅助流程。

贡献形态:

  • 🔗 推荐 Resource:推荐一个你用过的工具/论文/agent/skill…门槛:在对应阶段表格加一行,写一句话说明你用在什么场景。
  • 📝 分享最佳实践:分享你自己写的可复用流程,示例:
    • 真实科研任务场景("我用它做了 XXX 方向的文献综述,节省了约 X 小时")
    • 失败案例与边界("在 Y 场景下表现不好,原因是 Z")

贡献方式: 直接在对应阶段的表格末尾添加一行,在 "Demo/实践经验" 列填入链接。建议发布在 魔搭研习社 并带上 tag #vibe-research,让同行更容易发现;如果已发布在其他平台,也欢迎直接填外链。如果你的实践横跨多个阶段,先放进最核心的那个阶段,在描述里注明"也覆盖 x 阶段"。

关于 Stars 列:

  • Stars 数量由 GitHub Action 自动维护,PR 合并后每日自动更新
  • 首次添加项目时,在 Stars 列按以下格式填写:
    `<!--stars:OWNER/REPO-->⭐ updating<!--/stars-->`
    
    例如:
    | DeepScientist | 本地优先的自主研究工作室... | agent | <!--stars:ResearAI/DeepScientist-->⭐&nbsp;3.1k<!--/stars--> | [GitHub](...) | [Demo](...) | [arXiv 2025](...) |
    

🙏 致谢

感谢所有贡献者的参与和分享!


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About

An open, collaboratively-built repository for AI-assisted scientific research — collecting and curating agents, skills, workflows, tools, and best practices across the full research lifecycle. 面向 AI 辅助科研的开放共建仓库 收集和沉淀科研全流程中的 agents、skills、workflows、tools 与最佳实践

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