Descripción: PACHA es una herramienta de software para alinear grafos químicos.
Uso:
- Para utilizar PACHA, dirígete al directorio 'pacha/src', ejecuta 'make' y luego corre './pacha --input_file=string --output_file=string [opciones] ...'.
- Las opciones incluyen:
- -i, --input_file: Nombre del archivo de entrada (cadena)
- -o, --output_file: Nombre del archivo de salida (cadena)
- -d, --dist: Distancia máxima para calcular características de vértices (entero largo sin signo [=5])
- -k, --topk: Número de alineaciones a partir de pares de vértices con las mejores puntuaciones coincidentes (entero largo sin signo [=10])
- -n, --num_threads: Número de hilos (entero largo sin signo [=1])
- -t, --threshold: Umbral (flotante [=0])
- -c, --inter_cuts: Número máximo de cortes intermoleculares (entero largo sin signo [=100000000])
- -a, --intra_cuts: Número máximo de cortes intramoleculares (entero largo sin signo [=100000000])
- -?, --help: Imprimir este mensaje
Requisitos:
- Compilador GNU C++ (Versiones superiores son preferibles para multi-hilos).
Instalación:
- Para instalar PACHA, ve al directorio 'pacha/src' y ejecuta 'make'.
Licencia: Licencia MIT