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phpitblitw/mr_preprocessor

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mr_preprocessor

v2.0

前列腺、肿瘤、直肠手动标注。 直肠中轴线提取,最大截面姿态参数

AnalyseProcess 姿态参数

记录分辨率信息,分别为MRI数据x,y,z方向上的像素数 记录体素大小信息,分别为MRI数据x,y,z方向上的体素大小(mm) 全部使用wld坐标系,以MRI数据(0,0,0)处为坐标原点,考虑体素大小信息 ScanCenter点:截取前列腺最大截面位置,B超探头在直肠中的坐标 RightDir向量:最大截面位置,2维B超图像的x轴正方向对应的三维空间向量 UpDir向量:最大截面位置,2维B超图像的y轴负方向对应的三维空间向量。 MoveDir向量:B超探头前进的方向,即从直肠入口 指向最大截面处B超探头坐标的向量

SurgicalPlan

仅图像的像素分辨率、体素大小

v2.1

与prostate_puncture主程序v1.2联调通过。可以实现对应读取ini配置文件以及raw数据文件。修改了AnalyseProcess.ini和SurgicalPlan.ini两个文件里的一些路径信息和section名。

v2.2

修复了rectum.obj存储文件名错误的问题 obj文件存储wld坐标信息(itk坐标*voxelSize)

v2.3

用imagePropertyConvert模块来进行ijk到wld(始于0,0,0)的坐标转换,重写了部分py脚本。修正了截取平面的参数(528行)

v2.3.1

修正了v 2.3中的数据问题。 添加了.gitignore文件 不再跟踪pyc文件

v2.3.2

为obj文件添加数字 统计节点数和面片数

v2.3.3

寻找前列腺最大截面位置时,从第4个直肠中轴点开始查找,从而避免前三个中轴点连出的直肠中轴线误差过大

v2.3.4

mri数据 导入前先进行插值插成各向同性的 如果未找到ADC序列 则SynchroView2D的两个图像区域 都用T2序列 SurgicalPlan.ini文件 记录各个数据的相对路径而非绝对路径

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