fix(pubmed): usar journal-id[nlm-ta] em JournalTitle em vez da abreviação SciELO

[Rossi-Luciano]

O que esse PR faz?

Corrige get_journal_title() em packtools/sps/formats/pubmed.py, que gerava a tag <JournalTitle> do XML PubMed usando journal_meta.Title.abbreviated_journal_title — a abreviação genérica de título registrada na SciELO (abbrev-journal-title[@abbrev-type="publisher"]).

O guia SPS 1.10 e a doc oficial do PubMed (NBK3828) especificam que JournalTitle deve ser a abreviação registrada no próprio PubMed (NLM Title Abbreviation), disponível em journal-id[@journal-id-type="nlm-ta"] — presente apenas quando o periódico é indexado no PubMed. O model journal_meta.JournalID.nlm_ta já existia no código mas não era usado por este pipeline.

A função passa a priorizar nlm-ta, com fallback para abbreviated_journal_title quando nlm-ta está ausente (necessário porque JournalTitle é um elemento obrigatório na DTD do PubMed — omiti-lo geraria XML inválido para periódicos não indexados).

Onde a revisão poderia começar?

packtools/sps/formats/pubmed.py, função get_journal_title (linha ~47). É a única função alterada; xml_pubmed_journal_title_pipe, que a consome, não muda.

Como este poderia ser testado manualmente?

1. Rodar a suíte: source .venv/bin/activate && python -m pytest tests/sps/formats/test_pubmed.py -v (47 passed: 46 originais + 1 novo, cobrindo a prioridade de nlm-ta sobre abbrev-journal-title).
2. Comparar antes/depois com um artigo real indexado no PubMed:

   from packtools.sps.formats import pubmed
   from packtools.sps.utils import xml_utils
   
   xml_tree = xml_utils.get_xml_tree('tests/samples/0034-7094-rba-69-03-0227.xml')
   print(pubmed.get_journal_title(xml_tree))

   Antes deste PR: 'Rev. Bras.\n Anestesiol.' (abreviação genérica da SciELO, com quebras de linha do XML fonte preservadas). Depois: 'Rev Bras Anestesiol' (valor correto de journal-id[@journal-id-type="nlm-ta"], sem os artefatos de whitespace).

Algum cenário de contexto que queira dar?

Parte da quebra da #1226 (conversor SPS 1.10 → PubMed XML) em sub-issues. Este bug foi identificado durante o levantamento inicial de contexto da #1226, antes mesmo de abrir as sub-issues: o model JournalID.nlm_ta já existia no código, mas nunca tinha sido conectado a este pipeline. Independente das demais sub-issues (não depende nem é dependência de nenhuma outra).

Screenshots

Não se aplica — mudança em geração de XML, sem interface gráfica.

Quais são tickets relevantes?

Closes #1235. Relacionado a #1226 (issue-mãe).

Referências

• NCBI — PubMed XML Tagged Format: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3828/#publisherhelp.PubMed_XML_Tagged_Format
• Guia SciELO SPS 1.10 (seção <journal-meta>): "Usar título abreviado do periódico registrado no PubMed" para journal-id[@journal-id-type="nlm-ta"]

[Rossi-Luciano]

Validado localmente contra a DTD oficial do PubMed (https://dtd.nlm.nih.gov/ncbi/pubmed/in/PubMed.dtd, via lxml.etree.DTD), combinando esta branch com o #1243 (#1234, necessário porque a DTD exige a raiz ArticleSet):

• Suíte de testes: passou sem regressões.
• Artigo real (tests/samples/0034-7094-rba-69-03-0227.xml): VALID: True.
• Também testado combinando todos os PRs abertos (feat(pubmed): envolver saída em ArticleSet/DOCTYPE e corrigir ordem dos elementos #1243–feat(pubmed): adicionar Object[@Type=grant] (financiamento) em ObjectList #1248) num artigo sintético que exercita as features de todos eles ao mesmo tempo (grupo de autoria, financiamento, copyright, coi-statement): VALID: True.

(O validador linkado na issue-mãe #1226 não serve para este formato — ver comentário em #1226.)