Skip to content
This repository was archived by the owner on Dec 18, 2020. It is now read-only.

svshedko/CHARgenome

Repository files navigation

Здесь размещены данные, которые служат приложением к препринту

Шедько С.В. 2019. Сборка ASM291031v2 (Genbank: GCA_002910315.2) идентифицирована как сборка генома северной мальмы (Salvelinus malma malma), а не генома арктического гольца (S. alpinus) // arXiv:1912.02474 https://arxiv.org/abs/1912.02474

/resultsMapping – Результаты выравнивания прочтений на диагностические локусы экспресс-методом. Там, где это было необходимо, все проверялось с помощью Bowtie2.

/trees – Расположение последовательностей диагностических локусов (полных митогеномов, ITS1, RAG1), собранных автором, а также взятых из сборки ASM291031v2 (GENBANK: GCA_002910315.2), на филогенетических деревьях Salvelinus.

Here is the data that is a supplementary to the preprint:

Shedko S.V. 2019. Assembly ASM291031v2 (Genbank: GCA_002910315.2) identified as assembly of the Northern Dolly Varden (Salvelinus malma malma) genome, and not the Arctic char (S. alpinus) genome // arXiv:1912.02474 https://arxiv.org/abs/1912.02474

Here is translation this preprint from Russian to English via translate.google.com

/resultsMapping - Results of mapping of illumina reads against the diagnostic loci by the express method. Where necessary, everything was validated with Bowtie2.

/trees – The position of the sequences of diagnostic loci (complete mitogenomes, ITS1, RAG1), assembled by the author, as well as taken from the assembly ASM291031v2 (GENBANK: GCA_002910315.2), on the phylogenetic trees of Salvelinus.

About

No description, website, or topics provided.

Resources

Stars

Watchers

Forks

Packages

 
 
 

Contributors