Parse TF motifs from public databases, read into R, and scan using 'rtfbs'.

An R package for de novo discovery of enriched DNA motifs (e.g. TFBS)

A robust statistical test for TF footprint data analyses

Repozitorijoje saugomi failai, implementuojantys R Shiny aplikaciją ir leidžiantys vertinti įkeltų genominių duomenų kokybę bei vykdyti biologines analizes.

Code for the BMC Genomics paper (Integrating binding and expression data to predict transcription factors combined function)