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fix: Exportação dos dados para o Darwin Core #92

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fix: Exportação dos dados para o Darwin Core #92

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9d6f2f1
adiciona novos campos e associações no modelo DarwinCore para incluir…
Gabriel-Bueno32 May 29, 2025
f1f3f82
remove unused variable TomboColetor and clean up console log in obter…
Gabriel-Bueno32 May 29, 2025
e3c2f45
remove date formatting in obterModeloDarwinCoreLotes for identificati…
Gabriel-Bueno32 May 29, 2025
df18187
format identification date in obterModeloDarwinCoreLotes to ensure co…
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23 changes: 14 additions & 9 deletions src/controllers/darwincore-controller.js
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Expand Up @@ -26,7 +26,6 @@ const {
Herbario,
Tombo,
TomboFoto,
TomboColetor,
Solo,
Relevo,
Vegetacao,
Expand Down Expand Up @@ -85,6 +84,10 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
'sub_familia_id',
'sub_especie_id',
'colecao_anexa_id',
'vegetacao_id',
'relevo_id',
'solo_id',
'coletor_id',
],
include: [
{
Expand Down Expand Up @@ -131,6 +134,7 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
model: Variedade,
include: {
model: Autor,
as: 'autor',
attributes: {
exclude: ['updated_at', 'created_at', 'ativo'],
},
Expand Down Expand Up @@ -162,6 +166,7 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
model: Especie,
include: {
model: Autor,
as: 'autor',
attributes: {
exclude: ['updated_at', 'created_at', 'ativo'],
},
Expand All @@ -186,14 +191,12 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
model: Subespecie,
include: {
model: Autor,
as: 'autor',
attributes: {
exclude: ['updated_at', 'created_at', 'ativo'],
},
},
},
{
model: TomboColetor,
},
],
});

Expand All @@ -212,7 +215,7 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
tombo.locais_coletum && tombo.locais_coletum.cidade ? tombo.locais_coletum.cidade.estado.nome : '';
const cidadeNome = tombo.locais_coletum && tombo.locais_coletum.cidade ? tombo.locais_coletum.cidade.nome : '';
const vegetacao =
tombo.locais_coletum && tombo.locais_coletum.vegetaco ? tombo.locais_coletum.vegetaco.nome : '';
tombo.locais_coletum && tombo.locais_coletum.vegetacao ? tombo.locais_coletum.vegetacao.nome : '';
const familiaNome = tombo.familia ? tombo.familia.nome : '';
const generoNome = tombo.genero ? tombo.genero.nome : '';
const especieNome = tombo.especy ? tombo.especy.nome : '';
Expand Down Expand Up @@ -253,13 +256,15 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
dataIdentificacao = tombo.data_identificacao_ano;
}
if (tombo.data_identificacao_mes) {
const mesFormatado = tombo.data_identificacao_mes.toString().padStart(2, '0');
if (dataIdentificacao !== '') {
dataIdentificacao += `-${tombo.data_identificacao_mes}`;
dataIdentificacao += `-${mesFormatado}`;
}
}
if (tombo.data_identificacao_dia) {
const diaFormatado = tombo.data_identificacao_dia.toString().padStart(2, '0');
if (dataIdentificacao !== '') {
dataIdentificacao += `-${tombo.data_identificacao_dia}`;
dataIdentificacao += `-${diaFormatado}`;
}
}
if (tombo.especy) {
Expand Down Expand Up @@ -291,7 +296,7 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
`${cidadeNome}\t${tombo.altitude}\t${tombo.altitude}\t\t\t${tombo.latitude}\t`,
`${tombo.longitude}\t${'WGS84'}\t${'GPS'}\t${'Plantae'}\t${familiaNome}\t${generoNome}\t`,
`${especieNome}\t${menorNomeCientifico}\t${tombo.nome_cientifico}\t${autores}\t${tombo.taxon}`,
`\t${tombo.nomes_populares}\t\t${nomeTipo}\t${nomeIdentificador}\t${format(new Date(dataIdentificacao), 'yyyy-MM-dd')}`,
`\t${tombo.nomes_populares}\t\t${nomeTipo}\t${nomeIdentificador}\t${dataIdentificacao}`,
`\t${identificationQualifier}`,
].join('');
linha = linha.replace(/(null|undefined)/g, '');
Expand All @@ -312,7 +317,7 @@ const obterModeloDarwinCoreLotes = async (limit, offset, request, response) => {
`${cidadeNome}\t${tombo.altitude}\t${tombo.altitude}\t\t\t${tombo.latitude}\t`,
`${tombo.longitude}\t${'WGS84'}\t${'GPS'}\t${'Plantae'}\t${familiaNome}\t${generoNome}\t`,
`${especieNome}\t${menorNomeCientifico}\t${tombo.nome_cientifico}\t${autores}\t${tombo.taxon}`,
`\t${tombo.nomes_populares}\t\t${nomeTipo}\t${nomeIdentificador}\t${format(new Date(dataIdentificacao), 'yyyy-MM-dd')}`,
`\t${tombo.nomes_populares}\t\t${nomeTipo}\t${nomeIdentificador}\t${dataIdentificacao}`,
`\t${identificationQualifier}`,
].join('');

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