При запуске из командной строки при закрытии v8Reader 1C:Предприятие также должно завершать работу
Добавить ключ параметра запуска shutdownAfterClose или ЗавершитьРаботу1СПослеЗакрытия
Было реализовано в https://github.com/xDrivenDevelopment/v8Diff/issues/2