O erro que encontrei, foi na configuração do arquivo "Tunic/project.yml".
Para resolver esse problema de sobrescrita do Info.plist, é necessário retirar o seguinte trecho de código:
12 info:
13 path: Tunic/Info.plist
14 properties:
15 UISupportedInterfaceOrientations:
16 - UIInterfaceOrientationPortrait
17 UILaunchStoryboardName: LaunchScreen
Esse trecho de código do arquivo project.yml, é utilizado para gerar um novo Info.plist sobrescrevendo qualquer arquivo anterior existente.