Releases: CHEMIX-Science/casein-ftir
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Casein FTIR 0.2.1 — Référence DFT intégrée
Casein FTIR est un outil Python développé par CHEMIX pour explorer les spectres infrarouges de la caséine et de matériaux associés, dans le cadre du projet Galalithe.
Il accompagne le travail du spectre au rapport : correction de la ligne de base, lissage, normalisation, repérage de bandes, calcul d'aires et comparaison de spectres. L'ajustement de la région amide I permet d'examiner six composantes gaussiennes et d'exporter un graphique de décomposition. Les résultats peuvent être enregistrés dans des rapports texte ou HTML, localement sur votre ordinateur.
Nouveautés de cette version
- Une référence théorique DFT Galalithe directement disponible, pour explorer les signatures d'un fragment moléculaire et les comparer à un spectre.
- Une présentation et des guides français et anglais plus clairs, avec les usages, les formats acceptés et des exemples de commandes.
Vous pouvez toujours utiliser vos propres références, convertir une sortie Gaussian en spectre IR et découvrir les fonctions avec les exemples synthétiques fournis.
Installation et premier essai
Avec Python 3.10 ou plus récent, téléchargez la roue .whl et installez-la dans votre environnement Python :
python -m pip install casein_ftir-0.2.1-py3-none-any.whl
python -m casein_ftir --helpPour essayer une comparaison avec la référence théorique sur un spectre de démonstration :
python -m casein_ftir simulate --output demo.csv
python -m casein_ftir analyze demo.csv --use-default-galalithe-ref --no-preprocess-ref --report comparaison.htmlOuvrez comparaison.html dans votre navigateur pour examiner les résultats. Cet exemple utilise un spectre synthétique : remplacez demo.csv par votre fichier pour analyser vos données.
Le ZIP contient le code, les exemples et la documentation ; la roue .whl sert à installer le programme. Le fichier SHA256SUMS.txt permet de vérifier les téléchargements.
Interpréter les résultats
Le logiciel est exploratoire. La référence DFT représente un petit fragment moléculaire, pas un étalon certifié du matériau. Les similarités et les composantes ajustées doivent être interprétées avec les conditions de mesure et d'autres éléments scientifiques ; elles ne prouvent pas à elles seules la pureté ou la réticulation d'un échantillon.
Guide complet · Méthode et limites · CHEMIX
Le programme et la référence fournie sont distribués sous licence MIT.
Casein FTIR 0.2.0
Casein FTIR est un outil Python développé par CHEMIX pour explorer les spectres infrarouges de la caséine et de matériaux associés, dans le cadre du projet Galalithe.
À partir d'un spectre, vous pouvez corriger la ligne de base, lisser et normaliser le signal, repérer des bandes, calculer leurs aires et comparer plusieurs échantillons. Le programme permet aussi d'ajuster la région amide I avec six composantes gaussiennes pour en examiner la décomposition.
Cette version comprend :
- l'import de spectres et les principaux prétraitements ;
- la détection de bandes, les aires, les ratios et la comparaison avec vos références ;
- la conversion de sorties Gaussian en spectres IR ;
- des rapports texte ou HTML, l'export des courbes ajustées et un graphique de décomposition ;
- des exemples synthétiques pour découvrir les commandes, avec une documentation en français et en anglais.
Les analyses et rapports sont réalisés localement sur votre ordinateur. Cet outil reste exploratoire : les similarités et composantes ajustées doivent être interprétées avec les conditions de mesure et ne prouvent pas, à elles seules, la pureté ou la réticulation d'un matériau.
Installation
Avec Python 3.10 ou plus récent, téléchargez le fichier .whl, puis exécutez dans votre environnement Python :
python -m pip install casein_ftir-0.2.0-py3-none-any.whl
python -m casein_ftir --helpLe ZIP contient le code, les exemples et la documentation. Le fichier SHA256SUMS.txt permet de vérifier les téléchargements.
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Distribué sous licence MIT.