v0.4.0 — 配置化 taxonomy + 增量 checkpoint + 输入层分类目录 + onboarding

基于 Karpathy 知识库理念的四层知识蒸馏系统。本版（相对 v0.3.5）是一次重构 + 能力增强，四大主题：

✨ 新能力

配置化 taxonomy

• 分类维度 / 类型简写 / 标签规则 / 主题 / 桥接规则全部外置到 scripts/taxonomy.default.json
• 用户可在 <vault>/taxonomy.json 覆盖：默认深合并，顶层 _replace:[段名] 做整段替换（彻底重定义分类、不残留默认旧类）
• clipping_refiner / link_suggester 读配置驱动

增量 checkpoint

• daily_distill / weekly_review 默认只处理自上次运行以来新增/变化的文档
• mtime 快筛 + 内容 hash 兜底（对抗云盘刷新 mtime 的误判）；漏跑自动补扫、连跑不重叠
• --days/--since 手动时间窗覆盖（不读写 checkpoint），--reset-checkpoint 清状态
• 状态存 <vault>/.kis_state.json，日/周各自独立 key

输入层分类目录

• 每日蒸馏时对输入内容多标签分类（复用 taxonomy 的 contentTypes key）
• 关键词后端（默认离线）+ LLM 后端（opt-in、降级安全、只提议不改 taxonomy）
• catalog.json 数据源 → 渲染 输入层分类目录.md（按分类看 / 按文档看双视图）
• classify.minKeywordHits 多标签精准阈值；零命中归「其他」+ 待审队列（不阻塞）
• --classify=keyword|llm|off 控制

Taxonomy onboarding

• kis_onboard.py（--status/--template/--validate/--write）非阻塞引导用户声明自己领域的分类
• 不声明也能用通用默认

🐛 修复

• link_suggester PYTHONHASHSEED 导致的非确定性
• ideas 根路径改为递归扫全树（daily / weekly / idea_tracker 口径一致）

📄 说明

个人 taxonomy.json 与运行时状态文件（.kis_state.json / catalog.json / 待审队列 / 分类目录）均不进仓库（gitignore）。全部能力无网/无 API 也能跑，LLM 一律 opt-in、默认关闭。

对应 PR #7，merge commit fad1e81。