Repositório do aluno Rafael S. Bittencourt

CTD Processing Package

Descrption

This is a project developed by Rafael S. Bittencourt, oceanography student working at the Ocean Dynamics Laboratory at UFSC. The objective is to develop a python program for pre-processing CTD data.

How to install it

pip install CTDProcessingPackage

Requirements

To be able to use all the CTDProcessingPackage functions, the CTD data file must be a Pandas dataframe, so don't forget to:

import pandas as pd

data = pd.read_csv('PATH')

How to use it

import ctdmodule as ctd

Package functions

• plot: plot a simple temperature profile
• plot_perfil_termosal: plot a temperature and salinity profile together
• diagramats: plot a T-S diagram with density isolines
• convert: convert the decimal and thousands separator
• downcast: overwrite the data maintaining only the CTD dowcast data
• remove_outliers: remove the data outliers using the 3-sigma method
• above_sea_level: remove the data collected above the sea level
• pressure_loops: remove the pressure loops from the data
• bin_average: bin averaging

Attention!

The pressure, temperature and salinity columns MUST be named respectively as: PRESSURE;DBAR , TEMPERATURE;C , Calc. SALINITY; PSU

Quick Start

Check the quickstart.ipynb notebook at the CTDProcessingPackage folder for a quick start guide on the package functions.

Examples

Here is a temperature profile of a data without any pre-processing:

We can see noises and loops in this data, so after using some functions of the package we will have something like this:

Internal Waves

Descrição

Projeto para calcular a frequência de Brunt-vaisalla para ser usado na identificação de ondas internas. É utilizado o toolbox GSW (Gibbs SeaWater) para calcular a salinidade absoluta, temperatura conservativa e por fim a frequência de flutuabilidade.

O código consiste de três funções: bruntvaisala, plotvaisala e timecounter

• bruntvaisala: calcula a salinidade absoluta a partir da salinidade prática, temperatura conservativa a partir da salinidade absoluta e temperatura in situ, retorna uma tupla com N2 e pressão;
• plotvaisala: plota o gráfico da frequência de flutuabilidade (N2) em função da pressão;
• timecounter: executa todas as funções cronometrando seu tempo de resposta.

Exemplo

Exemplo abaixo da imagem gerada depois de todas as funções serem executadas: