fix: count skipped stages in parsing progress

[ttommybot]

Description

修复文件解析主流程阶段数字未计入 skipped 状态的问题。

问题

解析进度使用“当前阶段”口径，但原来的后备计算只统计 done + 1。

当中间阶段因为不适用而变成 skipped 时，当前阶段数字会少算；流程结束后的阶段总数也只统计 done，可能无法正确显示为 5/5。

根因

进行过程中和流程结束后的两处统计都遗漏了 skipped 状态。

修改内容

• 进行过程中改为使用 done + skipped + 1 计算当前阶段。
• 当前阶段数字继续限制为不超过阶段总数。
• 流程结束后改为使用 done + skipped 计算已处理阶段总数。
• 保留 running 和 failed 阶段的优先定位逻辑。
• 保留“当前阶段”文案，不修改界面布局或样式。
• 增加回归测试，覆盖进行中和流程结束后的两处统计规则。

Type of Change

• 🐛 Bug fix
• ✨ New feature
• 💥 Breaking change
• 📚 Documentation update
• 🎨 Refactor
• ⚡ Performance improvement
• 🧪 Test
• 🔧 Configuration / Build / CI

Related Issue

N/A

Testing

已完成：

• git diff --check
• 静态检查进行过程中使用 done + skipped + 1
• 静态检查流程结束后使用 done + skipped
• 增加对应回归测试
• 前端单元测试
• 前端类型检查

Checklist

• make fmt && make lint && make test pass locally
• Self-reviewed the code
• Added/updated tests covering the change
• Updated related documentation (README, docs/, Swagger annotations, etc.)
• Breaking changes are clearly called out in the description above