OpenRelTime v0.1.0

首次公开发布 / First public release.

OpenRelTime 是相对速率框架（RRF）非贝叶斯分子测年的纯 Python 实现：速率与年代推断、校正转换与解析置信区间、CorrTest 速率自相关检验、ddBD 出生-死亡树先验、树/表与分类学工具，以及通往 IQ-TREE（BLB）与 MEGA-CC 的外部桥接。行为以 R3F 与 ape 重新生成的黄金标准锁定，每个第三方文件都带来源记录。

安装 / Install

本版本以源码发布，未上传 PyPI。

pip install --editable ".[dev,plot]"     # 从仓库检出安装

也可用下方附件：openreltime-0.1.0-py3-none-any.whl（直接安装）与 openreltime-0.1.0.tar.gz（含文档、示例与黄金数据的源码分发）。

pip install ./openreltime-0.1.0-py3-none-any.whl

需要 Python ≥ 3.10；核心依赖 numpy、scipy、pandas、click，绘图额外需要 matplotlib（[plot]）。

验证 / Validation

• 123 个单元测试，39 个端到端测试（外部工具缺失时 4 项跳过）
• CI 在 ubuntu-latest 与 macos-latest × Python 3.10–3.13 上运行 lint、单元测试与端到端套件
• 十二个黄金文件中十一个逐字节一致，余下一个的差异与容差记录在 data/PROVENANCE.md

桌面版 / Desktop

图形界面是独立项目 OpenRelTime-Studio，仅通过本引擎的公开 API 调用。

许可与引用

GPL-3.0-or-later。引用方式见 CITATION.cff。

作者：曾子超 · ORCID 0000-0001-6553-970X