3.0.0

Sloučení refresh-intel.sh do agent-code-intel --refresh — celá wayfinder
mapa #2, řezy
#11–#20.

Breaking

• Nástroj přejmenován z code-intel-init na agent-code-intel. --install
  starou binárku v ~/.local/bin/ smaže; žádný compat symlink na staré jméno
  (#11).
• refresh-intel.sh se už negeneruje ani nepoužívá. Existující repozitáře se
  zmigrují automaticky při prvním --apply po aktualizaci — nedotčená
  vygenerovaná kopie se smaže, ručně upravená se nikdy nesmaže, jen nahlásí a
  ponechá (#16).
• --force-script odstraněn (#17).
• --status --all --json už nevrací klíč project.N.script_state (#17).
• Pravidlo v ~/.claude/settings.json se změnilo z projektově-relativního
  Bash(./refresh-intel.sh) na globální Bash(agent-code-intel --refresh);
  --install staré pravidlo automaticky odstraní (#15).

Přidáno

• Nový režim --refresh: přeindexuje GitNexus, nastartuje GrepAI hlídač,
  pokud neběží, a zaudituje oba. Návratové kódy sjednoceny: 0 ok, 1 nešlo
  spustit, 2 drift (#14).
• Soubor .code-intel nese identitu repozitáře (WORKSPACE, PROJECT)
  přímo ve verzovaném repu. --apply ho zakládá (#13); nástroj ho čte a
  upřednostňuje před odvozením z basename i před registrem (#12).
• Automatická migrace nezmigrovaných repozitářů zabudovaná přímo do --apply
  — žádný samostatný přepínač (#16).

Změněno

• Blok pro AI agenty v CLAUDE.md/AGENTS.md mluví o chybějícím příkazu
  agent-code-intel, ne o selhaném skriptu; plné vysvětlení "proč selhání
  nevadí" se přestěhovalo do --help (#18).
• README.md kompletně sladěn s novou realitou — nové jméno binárky všude,
  refresh-intel.sh nahrazeno --refresh, doplněna poznámka o nutném
  přeinstalování code-intel-dash (#19).
• code-intel-dash (→ 1.1.0): opraven, aby uměl najít přejmenovanou binárku
  — od #11 ji vůbec nedokázal najít, dokud to tenhle řez nespravil — a
  přestal číst zrušený klíč script_state (#17).

Odstraněno

• Generátor refresh-intel.sh (render_refresh(), ~310řádková šablona)
  (#17).

Testy

• Sada testů rozšířena z 13 na 53, hermeticky, bez závislosti na skutečném
  stacku. Formálně zdokumentováno, že happy path --apply zůstává ověřován
  ručně na živém stacku, ne stuby — přehledně na jednom místě v
  test/run.sh (#20).