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mypystan

mypystanはCmdStanの自作ラッパーである。次の二つが不満でラッパーを自作するに至った。

  • PyStanがCmdStanに比べて10倍くらい遅い。
  • PyStanが未完成である。例えばoutput.csvとdiagnostic_fileが読めなかったり、CmdStanから利用できるオプションがPyStanからでは  利用できないことがある。

インストール方法

  1. CmdStanをインストールします。
  2. CmdStanインストール時に作成されるパスを覚えておきます。

使用方法

関数名、メソッド名はpystanと同じです。pystanのAPIの説明を参照して下さい。 めったに使わない引数はサポートしていません。 使い方の例については、以下のJupyter-notebook https://github.com/fujiisoup/mypystan/blob/master/Instructions_for_mypystan.ipynb を参考にしてください。

About

自作のstanのpythonラッパー。本ライブラリはcmdstanを呼び出すようにしており、pystanより高速である。

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