mypystanはCmdStanの自作ラッパーである。次の二つが不満でラッパーを自作するに至った。
- PyStanがCmdStanに比べて10倍くらい遅い。
- PyStanが未完成である。例えばoutput.csvとdiagnostic_fileが読めなかったり、CmdStanから利用できるオプションがPyStanからでは 利用できないことがある。
- CmdStanをインストールします。
- CmdStanインストール時に作成されるパスを覚えておきます。
関数名、メソッド名はpystanと同じです。pystanのAPIの説明を参照して下さい。 めったに使わない引数はサポートしていません。 使い方の例については、以下のJupyter-notebook https://github.com/fujiisoup/mypystan/blob/master/Instructions_for_mypystan.ipynb を参考にしてください。