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データベース

データベース名	概要	関連論文	担当	調査結果
NCBI	Bioinformatics Center
EMBL	Bioinformatics Center
PubMed	Biomedical literature
GenBank	Nucleic acid sequence
SRS at EMBL/EBI	Nucleic acid sequence
Entrez Genome	Genome sequence
TIGR database	Genome sequence
GenBank (protein)	Protein sequence
SWISS-PROT at ExPASy	Protein sequence
PIR	Protein sequence	http://pir.georgetown.edu/pirwww/aboutpir/publication.html	http://pir.georgetown.edu/pirwww/aboutpir/publication.html
Protein Data Bank	Protein sequence
http://www.rcsb.org/pdb/	Post-translational modifications	[[http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/resid.html	http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/resid.html]]
ENZYME	Biochemical and biophysical information
BIND	Biochemical and biophysical information
KEGG	Biochemical pathways	[[Introduction to KEGG	http://www.genome.ad.jp/kegg/kegg1.html]]
[[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM	OMIM]]	Disorders Database
[[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/LocusLink/index.html	LocusLink]]	Gene information
[[http://www.pubgene.org/	PubGene]]	MedLineから自動抽出したヒトイデンッし発現量DB	[[http://www.nature.com/nglink/v28/n1/abs/ng0501_21.html	http://www.nature.com/nglink/v28/n1/abs/ng0501_21.html]]
[[http://bioinfo.mbb.yale.edu/partslist/	PartsList]]	アミノ酸立体構造予測	[[http://nar.oupjournals.org/cgi/content/abstract/29/8/1750	http://nar.oupjournals.org/cgi/content/abstract/29/8/1750]]
[[http://www.ebi.ac.uk/interpro/	InterPro]]	プロテオーム関連DB	[[http://www.ebi.ac.uk/interpro/nar_interpro.pdf	http://www.ebi.ac.uk/interpro/nar_interpro.pdf]]
[[http://cdna.ims.u-tokyo.ac.jp/	FullLengthcDNA]]	HumanのFull Length cDNA8000本
[[http://www.atcc.org/	ATCC]]	STR(Short Tandem Repeat) and cDNA database
[[http://wdcm.nig.ac.jp/	World data centre for Microorganisms]]	Microbial database
[[http://wdcm.nig.ac.jp/wdcm/JFCC.html	JFCCバクテリア、ウイルス]]	Culture collection
[[http://www.cbs.knaw.nl/nccb/	NCCB]]	mutant strains
[[http://srs.ebi.ac.uk/	SRS]]	EMBLE database search
[[http://www.kazusa.or.jp/codon/	Codon Usage Database]]	Database of Codon usages
[[http://www.sanger.ac.uk/	SANGER]]	Portal site for bioinformatics
[[http://watson.nih.go.jp/new/latest.html	genbank updata]]	GenBank Updata information
[JSNPs](http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/	)	日本人SNPsDB
[[http://biochem.agr.nagoya-u.ac.jp/atgenome/index_noframe.php3	シロイヌナズナデータベース]]	シロイヌナズナゲノムデータベース
HGREP	ヒトゲノム再構築プロジェクト
dbSNP	NCBIのSNPデータベース

リンク

データベース名	概要	関連論文
DatabaseList	ゲノム解析班のデータベースリスト
NAR Database	NARデータベース特集