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データベース

データベース名	概要	関連論文	担当	調査結果
NCBI	Bioinformatics Center
EMBL	Bioinformatics Center
PubMed	Biomedical literature
GenBank	Nucleic acid sequence
SRS at EMBL/EBI	Nucleic acid sequence
Entrez Genome	Genome sequence
TIGR database	Genome sequence
GenBank (protein)	Protein sequence
SWISS-PROT at ExPASy	Protein sequence
PIR	Protein sequence	http://pir.georgetown.edu/pirwww/aboutpir/publication.html	http://pir.georgetown.edu/pirwww/aboutpir/publication.html
Protein Data Bank	Protein sequence
http://www.rcsb.org/pdb/	Post-translational modifications	http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/resid.html	http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/resid.html
ENZYME	Biochemical and biophysical information
BIND	Biochemical and biophysical information
KEGG	Biochemical pathways	http://www.genome.ad.jp/kegg/kegg1.html
[OMIM](http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM	Disorders Database
[LocusLink](http://www.ncbi.nlm.nih.gov/LocusLink/index.html	Gene information
PubGene	MedLineから自動抽出したヒトイデンッし発現量DB	http://www.nature.com/nglink/v28/n1/abs/ng0501_21.html	http://www.nature.com/nglink/v28/n1/abs/ng0501_21.html
PartsList アミノ酸立体構造予測	http://nar.oupjournals.org/cgi/content/abstract/29/8/1750	http://nar.oupjournals.org/cgi/content/abstract/29/8/1750
InterProInterPro	プロテオーム関連DB	http://www.ebi.ac.uk/interpro/nar_interpro.pdf	http://www.ebi.ac.uk/interpro/nar_interpro.pdf
FullLengthcDNAFullLengthcDNA	HumanのFull Length cDNA8000本
ATCCATCC	STR(Short Tandem Repeat) and cDNA database
[World data centre for Microorganisms](http://wdcm.nig.ac.jp/	World data centre for Microorganisms)	Microbial database
[JFCCバクテリア、ウイルス](http://wdcm.nig.ac.jp/wdcm/JFCC.html	JFCCバクテリア、ウイルス)	Culture collection
NCCB	mutant strains
[SRS](http://srs.ebi.ac.uk/	EMBLE database search
[Codon Usage Database](http://www.kazusa.or.jp/codon/	Codon Usage Database)	Database of Codon usages
SANGER	Portal site for bioinformatics
[genbank updata](http://watson.nih.go.jp/new/latest.html	genbank updata)	GenBank Updata information
[JSNPs](http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/	)	日本人SNPsDB
[[http://biochem.agr.nagoya-u.ac.jp/atgenome/index_noframe.php3	シロイヌナズナデータベース]]	シロイヌナズナゲノムデータベース
HGREP	ヒトゲノム再構築プロジェクト
dbSNP	NCBIのSNPデータベース

リンク

データベース名	概要	関連論文
DatabaseList	ゲノム解析班のデータベースリスト
NAR Database	NARデータベース特集