Alphafold 批量预测脚本

项目简介

本脚本基于ColabFold实现蛋白质结构的批量预测，支持自动处理FASTA文件、Google Drive集成、多序列处理等功能。

功能特性

• ✅ 自动解析FASTA文件批量处理
• ✅ 智能跳过已处理序列
• ✅ Google Drive自动同步结果
• ✅ 支持自定义模板和参数配置

快速开始

环境要求

• Python 3.7+
• Google Colab 环境

安装步骤

点击colab直接运行，如果有问题就重启执行

使用指南

1. 将FASTA文件放入Google Drive
2. 修改脚本中的fasta_path路径
3. 配置预测参数（详见参数说明）
4. 运行完整脚本

参数配置

参数	默认值	说明
num_relax	1	结构优化次数
template_mode	none	模板使用模式

常见问题

如何处理超长序列？

脚本会自动跳过长度超过2500的序列，并记录在skipped_sequences.txt

结果文件存储在哪里？

预测结果会自动打包为zip文件并同步到Google Drive的MyDrive目录

许可证

MIT License

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温馨提示：建议在Google Colab Pro环境下运行以获得更好性能