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v0.5.0

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@qgeng1465 qgeng1465 released this 25 Aug 15:43
· 3 commits to main since this release

BioMCP v0.5.0 — 智能 Agent 系统 + 诚实 Agent + 10 个新数据库,共 36 个数据库 / 68 个工具。

新增 / Added

  • 智能 Agent:intelligent_analyze 自动检测数据类型并推荐工具,省 token、给洞察;get_analysis_template 预置分析模板
  • 诚实 Agent:db_health_check 真实连通性测试;tool_inventory 工具验证状态清单
  • 10 个新数据库:HGNC、BioGRID、NCBI BioSamples、Expression Atlas、UniChem、ChEBI、PRIDE、FlyBase、WormBase、Rat Genome DB
  • 植物数据库(Ensembl Plants)、NCBI SRA / BioProject 测序档案
  • 4 个内置 Skill:bio-data-to-database / bio-analysis / bio-mcp-usage / bio-release
  • 数据库 26 → 36,工具 40 → 68

修复 / Fixed

  • ChEBI 改用 EBI Search chebi/entry/{id} 端点
  • PRIDE 改用 projects?q= 列表端点
  • Expression Atlas:公开 REST 单基因数值表达端点已下线,诚实重构为客户端过滤实验列表

诚实说明 / Honest note

  • 大部分新工具已用真实数据端到端验证;受限工具如实披露(FlyBase 被 CloudFront WAF 拦截、RGD 当前网络超时、WormBase 搜索尽力而为、BioGRID 需 key)
  • 授权:双重授权(学术 MIT + 商用需授权)