v0.3.4 — Drop CUSTOM, warn on negative delta_ij

Modifications

1. Mode CUSTOM supprimé

Le programme ne demande plus les paramètres ε_o / ε_p / ε_m. Ces valeurs étaient de toute façon ignorées dans le calcul (bug rapporté dans la revue précédente) : la matrice de référence est toujours dérivée topologiquement du cycle (formule Estrada-Goodman généralisée par taille). Suppression donc de fonctionnalité fantôme.

Le lancement se fait maintenant en 3 entrées au lieu de 6 :

• fichier géométrie/distances
• fichier LDM (optionnel)
• cycles manuels (optionnel, Entrée pour aucun)

2. Avertissement δ_ij < 0

Le cahier des charges v2.0 demandait un avertissement quand des indices de délocalisation sont négatifs (l'entropie de Shannon n'est plus bien définie). Désormais :

• `[WARN]` sur le terminal avec le nombre de paires concernées
• Bloc `WARNING : negative delocalization indices detected` en tête de la section ENTROPIE du .arx, listant jusqu'à 20 paires (i, j, δ_ij)

Sur les 15 PAH de référence, aucune paire négative n'est détectée (comme attendu pour des LDM issus de QTAIM).