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Bash
En esta sección se mencionan las mejores prácticas para el uso de home en un sistema NFS, el uso de la carpeta temporal, cómo se realiza el respaldo home y el respaldo de los datos en general.
Si bien /home guarda las configuraciones individuales de cada usuario el respaldo de los datos, como las imágenes debe realizarse en un directorio diferente, con el fin de mejorar el uso del cluster. Información aquí: datos cluster.
Los permisos de lectura y escritura se deben de asignar tanto a carpetas como a archivos, ya que si los permisos no están debidamente asignados, puede derivar en un fallo en el procesamiento de la tarea por parte del cluster o en la falta de respaldo de los archivos.
El bioinfo cuenta con un grupo particular de aplicaciones y variables de entorno específicas que se detallan en este apartado.
basicos que permiten la interacción con el sistema. El 95% de todos los comandos, trucos y piruetas que se recomienda que todo integrante del laboratorio sepa están agradablemente compilados en un TUTORIAL de la gente que hace el fsl, el cual puede consultarse http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fslcourse/lectures/scripting/s_0005.htm. NOTA, que en ese tutorial utilizan el lenguaje de shell llamado ''sh'', que está localizado en ''/bin/sh'', mientras que en el laboratorio habitualmente utilizamos ''bash'', que está en ''/bin/bash''. Los dos lenguajes hacen prácticamente lo mismo y tienen una sintaxis casi idéntica, con ligeras diferencias que pueden consultarse http://superuser.com/questions/125728/what-is-the-difference-between-bash-and-sh.
Una vez aprendidos los comandos básicos estos bashavd te permitiran realizar muchas más acciones en la terminal.
El protocolo ssh permite realizar ssh con una interacción a nivel de consola o mediante interfaces gráficas.
servido es una herramienta que permite el control de versiones de http://en.wikipedia.org/wiki/Source_code.
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