FAQ, Trucos y Alertas

Preguntas Frecuentes

¿Porque no abre firefox? : Si bien puede haber algun problema con la aplicación. en la mayoría de los casos el problema se debe a que una sesión de firefox quedo abierta en alguna otra maquina. Firefox no permite dos sesiónes de usuario al mismo tiempo por el mismo usuario en diferentes maquinas. Esto se puede solucionar abriendo la maquina donde esta la sesión de firefox y cerrar firefox. Sin embargo si la maquina en cuestion esta ocupada. Es posible hacer una sesión ssh a la maquina en cuestion y ya ahí matar el proceso, de preferencia a travez de la terminal

¿Cuando cambio de usuario la máquina no responde, la pantalla se pone negra? : Esto se debe a que hubo algún error en la carga del sistema de gráficos en el equipo. Puede deberse a un fallo de la tarjeta de video, que puede agravarse por programas que quedan abiertos por alguno de los usuarios. Es recomendable cerrar los programas en ejecución y de ser posible salir de la sesión. Si este problema se presenta lo mejor es llamar al administrador del sistema para que restablezca el sistema.

¿Por qué cuando paso mis PAR/REC del Philips a Penfield no se ven los niftis? : Es dificil de saber la causa de esto, en ocaciones puede ser por errores en el cluster mientras se copiaban los datos, lo cuales pueden llegar incompletos. Hay que volver a pasarlos desde la base de datos del Resonador. NO hay que borrar los datos de la base de datos de philips hasta que se este seguro que se tienen las imagenes integras.

Alertas

¿Cómo lograr que médicos clínicos vean la IRM? : Para compartir las imágenes de IRM con médicos clínicos los datos tienen que extraerse directamente de la máquina de donde se hayan exportado en una memoria externa, ya que la mayoria de los programas médicos usados en clínica no lo pueden leer el disco que se puede quemar en el VIRTUAL. Y se pueden mandar comprimidos (.zip) para mayor velocidad y eficiencia.

Trucos de Luis Concha

Algunos trucos de cosas truculentas, y otras muy bobas pero que me tardé en entender cómo hacerlas.

Lo que hago mas frecuentemente es un for loop, que directamente en la terminal debe usar punto y coma en sustitución de un script formal en donde se hace una nueva línea. Por ejemplo:

for sujeto in 301 302 303
do
  echo "trabajando en sujeto $sujeto"; done

en la terminal quedaría:

for sujeto in 301 302 303; do echo "trabajando en sujeto $sujeto"; done

Nótese la ausencia de punto y coma entre do y echo.

En caso de tener organizados a los sujetos cada uno con una carpeta, y con identiricadores claros, como en el caso de freesurfer, es muy fácil hacer algo repetitivo:

for sujeto in 3??; do recon-all -all -subjid $sujeto;done

Poner resultados FEAT en Freesurfer

Una manera muy fácil se explica aquí.

Una alternativa más viejita y complicada está acá.