Resonadores:Bruker

Bruker Biospec 70/16

Por qué Biospec y no Pharmascan?

Porque aunque el magneto es de un Pharmascan, toda la electrónica y los gradientes son de un Biospec. Por lo tanto, el resonador es de facto un Biospec.

Qué significa 70/16?

70 porque es un 7 Tesla, y 16 porque su túnel tiene 16 cm de diámetro.

Qué necesito hacer para usarlo?

Certificarte. Contacta a Juan Ortiz.

Dónde se guardan los datos?

La consola del resonador tiene tres discos duros. Uno es del sistema operativo, y los otros dos son donde se guardan los datos. Estos son /mnt/pvDatasets2, y /mnt/pvDatasets3. Adentro de cada uno de ellos, existen carpetas para cada usuario (ejemplo nmrsu, grvite). Las carpetas están nombradas de acuerdo a la siguiente nomenclatura: YYYYMMDD_HHMMSS_StudyName

Cómo transfiero mis datos?

Depende. Cómo los quieres?

Los quiero en formato Dicom.

Bien. En el resonador selecciona los datasets que requieres, da clic derecho y elige convert to Dicom. Al finalizar te dará la ruta donde se guardaron, que es por default dentro del data set. Ahora tienes dos opciones: Los sacas directamente del resonador usando una USB, o los sacas usando /misc (ver adelante).

Los quiero en Nifti.

Conviértelos a Dicom (paso anterior), y conviértelos en tu máquina usando mrconvert de mrtrix, o dcm2niix.

Los quiero crudos

Bien por tí, no necesitas hacer nada.

Y cómo los saco si no quiero usar USB?

En las computadoras del clúster, puedes accederlos en las rutas /misc/bruker_pvDatasets2 y /misc/bruker_pvDatasets3, que corresponden a /mnt/pvDatasets2 y /mnt/pvDatasets3, respectivamente.