v6.0 — Module 6 : Techniques d'électrophorèse

Module 6 — Techniques d'électrophorèse (20 h)

Licence 3 — Techniques de laboratoire en Biochimie-Génétique · Semestre 5 · UEF 3.1
Volume horaire : 20 h (8 h CM · 6 h TD · 6 h TP) — 2 crédits ECTS

Cette release marque l'intégration du module 6 sur main (PR #6). Le dépôt couvre désormais
quatre modules d'analyse instrumentale : spectrophotométrie moléculaire (M3), spectrophotométrie
atomique (M4), chromatographie (M5) et électrophorèse (M6).

Comme les modules précédents, le module 6 est produit par une chaîne entièrement scriptée à partir
d'un référentiel de contenu unique (scripts/contenu_module6_electro.py) qui alimente
simultanément les polycopiés Word, le diaporama, la version web interactive et l'audit.

---

PDF du dispositif d'évaluation

Les quatre PDF prêts à imprimer, téléchargeables directement depuis le dépôt à la révision de cette
release :

Fichier	Épreuve	Pages	Taille
M6_CC1_Sujet.pdf	Contrôle continu n° 1 — énoncé	5	13,6 ko
M6_CC1_Corrige.pdf	Contrôle continu n° 1 — corrigé-barème	10	30,1 ko
M6_ExamenFinal_Sujet.pdf	Examen final — énoncé	6	16,0 ko
M6_ExamenFinal_Corrige.pdf	Examen final — corrigé-barème	12	39,4 ko

Note — comme pour la release v1.2, la pièce jointe des binaires n'a pas pu être effectuée
depuis l'environnement d'exécution : l'accès à uploads.github.com y est filtré au niveau TLS
(la connexion TCP aboutit, mais la poignée de main est interrompue), alors que api.github.com
reste joignable. Les fichiers sont intégralement disponibles via les liens ci-dessus et pourront
être rattachés à la release dès que cet accès sera rétabli.

Dispositif d'évaluation

Épreuve	Programme	Durée	Barème
Contrôle continu n° 1	Chapitres 1 à 4	1 h 30	Synthèse 8 · Calcul 8 · QCM 4 — 20 pts
Examen final	Chapitres 1 à 8	1 h 30	Synthèse 10 · Calcul 6 · QCM 4 — 20 pts

Chaque épreuve propose deux sujets au choix en partie A (synthèse) et deux sujets au choix
en partie B (calcul) ; le QCM de 16 items à réponse unique est commun
(+ 0,25 / − 0,0625 / 0, plancher 0).

Note finale du module = 0,20 × CC1 + 0,30 × comptes rendus de TP + 0,50 × Examen final

Les corrigés sont des corrigés-barèmes utilisables directement par le correcteur : réponse
attendue découpée en éléments notés séparément, répartition des points au quart de point près,
erreurs fréquentes à sanctionner avec leur pénalité, et synthèse finale des erreurs les plus
courantes destinée à la séance de correction.

---

Contenu du module

Cours magistral — 8 chapitres

1. Définitions, principes physiques, forces et appareillage — bilan F = qE contre F = 6πηrv,
   vitesse v = qE/(6πηr), mobilité μ = q/(6πηr), Rf, effet du pH et pI, cuves horizontale et
   verticale, effet Joule P = U·I = R·I², sécurité électrique, électro-osmose
2. Gel d'agarose — gélification thermoréversible, tamisage (Ogston, reptation, reptation orientée),
   relation de Ferguson, choix de 0,5 % à 3 %, TAE contre TBE, révélation, diagnostic des anomalies
3. Acides nucléiques et protéines végétales — droite log M = f(Rf), conformères plasmidiques, ARN
   en conditions dénaturantes, extraction TCA-acétone, matrices végétales difficiles, densitométrie
4. SDS-PAGE, système discontinu de Laemmli — %T et %C, triple effet du SDS (1,4 g·g⁻¹), gels 4–5 %
   à pH 6,8 et 8–15 % à pH 8,8, empilement par isotachophorèse transitoire, écarts de masse
5. IEF, isotachophorèse, immunoélectrophorèse — ampholytes et gradients immobilisés, volts-heures,
   fonction de Kohlrausch, Ouchterlony, Laurell, immunofixation
6. Western blot — transfert en cuve / semi-sec / rapide, nitrocellulose contre PVDF, Ponceau,
   saturation, immunodétection indirecte, ECL, quantification et contrôles de charge
7. 2D-PAGE, électrophorèse capillaire et PFGE — capacité de pics n₁ × n₂, modes CZE/CGE/MEKC/cIEF,
   efficacité N = μ·V/(2D), temps de réorientation t_r ∝ L^1,5–2, OFAGE / FIGE / CHEF
8. Stratégie analytique — arbre décisionnel analyte → technique, validation de méthode, perspectives

Travaux pratiques — TP 1 agarose (ADN plasmidique, produits de PCR, ARN totaux) · TP 2
extraction des protéines de feuilles et de graines, Bradford et SDS-PAGE Laemmli · TP 3 Western
blot de la grande sous-unité de la Rubisco, transfert semi-sec, ECL et densitométrie.

Livrables commités dans le dépôt

Livrable	Chemin	Détail
Polycopié Cours	modules/module06_electrophorese/output/M6_Cours_Electrophorese.docx	8 chapitres, 12 figures, 84 tableaux et encadrés, ≈ 21 000 mots, glossaire (25 entrées), bibliographie APA (29 réf.)
Polycopié TD	.../output/M6_TD_Electrophorese.docx	10 questions de synthèse, 10 exercices de calcul, 20 QCM, énoncés puis corrigés détaillés (≈ 17 800 mots)
Polycopié TP	.../output/M6_TP_Electrophorese.docx	3 séances de 3 h pour 5 binômes : matériel, réactifs chiffrés, sécurité, mode opératoire, grille de notation (≈ 10 000 mots)
Diaporama	.../output/M6_Diaporama_Electrophorese.pptx	98 diapositives 16:9, ≤ 10 lignes par cadre, 0 chevauchement sur 307 cadres vérifiés
Version web	.../web/M6_Electro_Cours_Interactif.html	fichier autonome (figures en base64) : sommaire latéral, recherche plein texte, QCM auto-corrigé, 4 calculateurs, progression localStorage, mode sombre et mode impression
Figures	.../figures/	12 planches scientifiques PNG 300 dpi + SVG
Audit	.../audit/M6_Audit_Oral_Transcrit.docx / .md	audit technique + narration transcrite (~50 min de lecture)

Contrôle qualité

Audit	Portée	Score
Audit technique (scripts/audit_module6_electro.py)	format A4, marges 2,5 cm, Times New Roman 12 pt, interligne 1,5, hiérarchie de titres, en-têtes #003366, encadrés, illustrations, volume rédactionnel, ratio 16:9, densité, chevauchements	44/44
Audit d'évaluation (evaluation/audit_eval.py)	présence et taille des sources et des PDF, structure des épreuves (parties A/B/C), cohérence du barème	24/24

Les quatre modules du dépôt sont à 44/44 et 24/24.

Charte graphique

Bleu marine #003366 · accent violet électrophorèse #6a1b9a · corrigés-barèmes en rouge sobre
#a02c2c · Times New Roman 12 pt (DOCX) et Calibri (PPTX) · interligne 1,5 · marges 2,5 cm ·
encadrés Points clés #E8F4FD, Protocoles #FFF8E1, À retenir #E8F5E9, Attention #FBE9E9.

Régénérer le module

pip install --break-system-packages python-docx python-pptx matplotlib numpy pillow reportlab markdown

cd modules/module06_electrophorese/scripts
python3 build_all.py          # cours, TD, TP, diaporama, web, figures, audit (~17 s)

cd ../evaluation
python3 build_eval_pdf.py     # régénère les 4 PDF joints à cette release (~1 s)
python3 audit_eval.py         # vérification → 24/24

Modifier le seul fichier contenu_module6_electro.py puis relancer build_all.py met à jour les
quatre formats simultanément — aucune ressaisie n'est nécessaire.

v1.2 — Modules 1 & 2 : Sécurité/Métrologie & Centrifugation

Modules 1 & 2 — livrables de la licence 3 Techniques de laboratoire

Cette release contient les deux modules commités sur la branche arena/019fad4c-lab-analyse
(PR #5) :

• Module 1 — Sécurité au laboratoire, métrologie, préparation des solutions et dilutions (16 h)
• Module 2 — Centrifugation et fractionnement cellulaire (20 h)

Chaque module est généré de façon entièrement reproductible à partir d'un référentiel de contenu
unique en Python (contenu_moduleX.py) qui alimente 4 formats + l'audit.

Contenu

Module	Chapitres	Figures	DOCX	Diapo	Web	Audit technique	Évaluation
M1	8	12	3	75	2,1 Mo	44/44	4 PDF (audit 25/25)
M2	8	12	3	71	3,3 Mo	44/44	4 PDF (audit 25/25)

• Cours magistral : 8 chapitres illustrés de 12 planches scientifiques.
• TD : 10 questions de synthèse + 10 exercices de calcul corrigés + 20 QCM à réponse unique,
  tous justifiés.
• TP : 3 séances dimensionnées pour 5 binômes (10 étudiants), matériel/réactifs quantifiés,
  consignes de sécurité, mode opératoire, grille d'évaluation.
• Évaluation : CC1 (sujet + corrigé) et Examen final (sujet + corrigé) générés par
  build_eval_pdf.py (reportlab) et vérifiés par audit_eval.py.

Charte graphique commune

• DOCX : A4, Times New Roman 12 pt, interligne 1,5, titres bleu marine #003366, tableaux à
  en-têtes marine, encadrés colorés, pied de page avec champ PAGE, page de garde.
• PPTX : 16:9, max 10 lignes/cadre, diapositives « Question de réflexion » et récapitulatives,
  contrôle anti-chevauchement géométrique (0 anomalie).
• HTML : sommaire latéral, recherche plein texte, QCM auto-corrigé, calculateurs interactifs,
  progression persistante, mode sombre/impression.

Pour régénérer

cd modules/module01_Laboratoire/scripts && python3 build_all.py
cd modules/module02_centrifugation/scripts && python3 build_all.py

Où trouver les livrables

Les binaires (polycopiés .docx, diaporamas .pptx, pages web .html, PDF d'évaluation) sont
commités dans cette même révision sur la branche arena/019fad4c-lab-analyse (PR #5) et
téléchargeables depuis l'arborescence du dépôt :

• modules/module01_Laboratoire/{output,web,eval}
• modules/module02_centrifugation/{output,web,eval}

Note : la pièce jointe des binaires à cette release n'a pas pu être effectuée depuis l'environnement
d'exécution (l'endpoint d'upload de GitHub renvoie une erreur de connexion). Les fichiers restent
intégralement disponibles via le dépôt et la PR #5 ; ils pourront être rattachés à la release dès que
l'endpoint d'upload sera accessible.

Arborescence des livrables par module :

• Polycopiés Word (*_Cours_*.docx, *_TD_*.docx, *_TP_*.docx) et diaporama (*.pptx).
• Version web interactive (M*_Cours_Interactif.html).
• 4 PDF d'évaluation (*_CC1_Sujet.pdf, *_CC1_Corrige.pdf, *_ExamenFinal_Sujet.pdf,
  *_ExamenFinal_Corrige.pdf).
• README des modules et README/index du dépôt.

v1.1 — Modules 3 et 4 : dispositifs d'évaluation complets

v1.1 — Modules 3 et 4 : dispositifs d'évaluation complets

Cette release rassemble l'intégralité des modules 3 (Spectrophotométrie moléculaire, 30 h) et 4 (Spectrophotométrie atomique, 16 h), avec leurs dispositifs d'évaluation (contrôles continus, examens finaux, corrigés-barèmes détaillés).

🆕 Nouveautés par rapport à v1.0

Module 3 — Spectrophotométrie moléculaire (évaluation)

• CC1 (1 h 30) : Beer-Lambert, dosage A₂₈₀, Bradford, Lowry, BCA — QCM + exercice de calcul + synthèse (8/8/4 pts)
• CC2 (1 h 30) : fluorimétrie, FRET, dichroïsme circulaire, SPR
• Examen final (2 h 00) : stratégie analytique complète sur tous les chapitres
• Corrigés-barèmes détaillés avec erreurs fréquentes signalées
• 6 PDF mis en page (charte #003366, corrigés en rouge)

Module 4 — Spectrophotométrie atomique (évaluation)

• CC1 (1 h 00) : Boltzmann, SAA, ETAAS, interférences, correction de fond
• Examen final (1 h 30) : stratégie analytique FAAS/ETAAS/ICP-MS, minéralisation, validation, cas toxicologique
• 4 PDF mis en page (charte #5a2e0c)

Chaîne de production

• Scripts Python (build_eval_pdf.py, audit_eval.py) suivant l'architecture existante des modules
• Audit M3 : 24/24 critères conformes (100 %) · Audit M4 : 16/16 critères conformes (100 %)

📚 Contenu scientifique couvert

• Module 3 : 9 chapitres, Beer-Lambert, A₂₆₀/A₂₈₀, ratios de pureté, dosages protéiques, fluorimétrie, FRET, dichroïsme circulaire, SPR
• Module 4 : 8 chapitres, SAA, ETAAS, ICP-AES, ICP-MS, interférences, applications toxicologiques, validation

🔗 Liens

• PR #2 : #2
• README Module 3 : modules/module03_spectrophotometrie/README.md
• README Module 4 : modules/module04_spectro_atomique/README.md
• README Évaluation M3 : modules/module03_spectrophotometrie/evaluation/README.md
• README Évaluation M4 : modules/module04_spectro_atomique/evaluation/README.md

---

Release générée le 27 juillet 2026

Module 3 — Spectrophotométrie moléculaire (30 h) — v1.0

Module 3 — Spectrophotométrie moléculaire (30 h)

L3 Techniques de laboratoire en biochimie-génétique — Semestre 5, UEF 3.1, 3 crédits ECTS
Volume horaire : 12 h CM · 9 h TD · 9 h TP

Première publication du module 3 : cours magistral, travaux dirigés corrigés, travaux pratiques,
diaporama de projection, version web interactive et audit qualité — le tout généré par une chaîne
Python reproductible.

---

Télécharger les documents

L'archive Source code (zip) en bas de cette page contient l'intégralité du module.
Pour récupérer un document isolé, utilisez les liens directs ci-dessous :

Document	Téléchargement
Polycopié de cours magistral	M3_Cours_Spectrophotometrie.docx
Fascicule de travaux dirigés (énoncés + corrigés)	M3_TD_Spectrophotometrie.docx
Fascicule de travaux pratiques	M3_TP_Spectrophotometrie.docx
Diaporama 84 diapositives 16:9	M3_Diaporama_Spectrophotometrie.pptx
Version web interactive (autonome)	M3_Cours_Interactif.html
Audit technique + oral transcrit	M3_Audit_Oral_Transcrit.docx

Les 13 planches scientifiques (PNG 300 dpi + SVG) sont dans
modules/module03_spectrophotometrie/figures/.

---

Contenu pédagogique

Cours magistral — 9 chapitres

1. Définition, principes physiques et grandeurs fondamentales
2. Loi de Beer-Lambert : démonstration, validité 0,2 < A < 0,8, déviations
3. Architecture instrumentale et métrologie
4. Dosage des acides nucléiques : A₂₆₀, ratios A₂₆₀/A₂₈₀ et A₂₆₀/A₂₃₀
5. Dosage des protéines : A₂₈₀, Bradford, Lowry, BCA
6. Spectrofluorimétrie : Jablonski, décalage de Stokes, SYBR / DAPI / FITC / GFP
7. FRET : théorie de Förster, E = R₀⁶/(R₀⁶+r⁶), interactions protéine-protéine
8. Dichroïsme circulaire : signatures 208/222 nm et 218 nm, détermination du Tm
9. SPR (kon/koff/KD), arbre décisionnel, perspectives (UHPLC-DAD, Orbitrap, HR-ICP-MS, BLI)

13 planches figuratives · 44 tableaux et encadrés · glossaire · bibliographie APA (15 références)

Travaux dirigés — 10 questions de synthèse · 10 exercices de calcul entièrement corrigés ·
20 QCM justifiés · barème détaillé (80 points ramenés à 20)

Travaux pratiques — 3 séances de 3 h dimensionnées pour 5 binômes, matériel et réactifs chiffrés,
consignes de sécurité et gestion des déchets, grille de notation

• TP 1 — Validation de Beer-Lambert et dosage protéique par Bradford
• TP 2 — Quantification et contrôle qualité d'un extrait d'ADN génomique
• TP 3 — Spectrofluorimétrie : SYBR Green I, Stern-Volmer et introduction au FRET

Version web interactive — recherche plein texte, QCM auto-corrigé (barème −0,25, note /20),
corrections repliables, 4 calculateurs (Beer-Lambert, ratios ADN, FRET, SPR), suivi de progression,
mode sombre et mode impression.

---

Conformité

Audit programmatique des fichiers réellement produits : 44/44 critères conformes

• DOCX — A4, marges 2,5 cm, Times New Roman 12 pt, interligne 1,5, hiérarchie de titres
  14/13/13/12 pt, en-têtes de tableaux #003366 sur texte blanc, 4 types d'encadrés colorés
• PPTX — ratio 16:9 vérifié, Calibri, barre de titre #003366, ≤ 10 lignes par cadre,
  0 chevauchement entre texte, cadres et illustrations (contrôle géométrique automatisé)

---

Régénérer le module

pip install python-docx python-pptx matplotlib numpy pillow
cd modules/module03_spectrophotometrie/scripts
python3 build_all.py

Tout le contenu rédactionnel est centralisé dans contenu_module3.py : le modifier puis relancer
build_all.py met à jour les quatre formats simultanément.